MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016844	ATGCA	2	10	83678	83687	40 %	20 %	20 %	20 %	378974707
1502	NC_016844	GTT	2	6	83727	83732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974707
1503	NC_016844	CCG	2	6	83749	83754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974707
1504	NC_016844	TG	3	6	83778	83783	0 %	50 %	50 %	0 %	378974707
1505	NC_016844	TG	3	6	83859	83864	0 %	50 %	50 %	0 %	378974707
1506	NC_016844	TTG	2	6	83879	83884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974707
1507	NC_016844	TGGA	2	8	83921	83928	25 %	25 %	50 %	0 %	378974707
1508	NC_016844	GAT	2	6	83940	83945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974707
1509	NC_016844	GGT	2	6	83988	83993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974707
1510	NC_016844	CACTTT	2	12	84080	84091	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378974707
1511	NC_016844	GTG	2	6	84104	84109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974707
1512	NC_016844	GCA	3	9	84130	84138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974707
1513	NC_016844	GCG	3	9	84175	84183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974707
1514	NC_016844	TGG	3	9	84191	84199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974707
1515	NC_016844	GCG	2	6	84265	84270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974708
1516	NC_016844	TGTA	2	8	84316	84323	25 %	50 %	25 %	0 %	378974708
1517	NC_016844	GA	3	6	84326	84331	50 %	0 %	50 %	0 %	378974708
1518	NC_016844	GGGT	2	8	84334	84341	0 %	25 %	75 %	0 %	378974708
1519	NC_016844	GA	4	8	84377	84384	50 %	0 %	50 %	0 %	378974708
1520	NC_016844	A	6	6	84459	84464	100 %	0 %	0 %	0 %	378974708
1521	NC_016844	T	6	6	84485	84490	0 %	100 %	0 %	0 %	378974708
1522	NC_016844	GC	3	6	84653	84658	0 %	0 %	50 %	50 %	378974708
1523	NC_016844	ATC	2	6	84702	84707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974708
1524	NC_016844	GTTA	2	8	84824	84831	25 %	50 %	25 %	0 %	378974708
1525	NC_016844	GGA	2	6	84840	84845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974708
1526	NC_016844	CT	3	6	84876	84881	0 %	50 %	0 %	50 %	378974708
1527	NC_016844	GA	3	6	84916	84921	50 %	0 %	50 %	0 %	378974708
1528	NC_016844	A	7	7	84942	84948	100 %	0 %	0 %	0 %	378974708
1529	NC_016844	TGC	2	6	85019	85024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974708
1530	NC_016844	AGC	2	6	85045	85050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974708
1531	NC_016844	TGC	2	6	85073	85078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974708
1532	NC_016844	ATG	2	6	85098	85103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974708
1533	NC_016844	AAT	2	6	85131	85136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974708
1534	NC_016844	TCTA	2	8	85230	85237	25 %	50 %	0 %	25 %	378974708
1535	NC_016844	GAA	2	6	85262	85267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974708
1536	NC_016844	TGC	2	6	85277	85282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974708
1537	NC_016844	AAAG	2	8	85388	85395	75 %	0 %	25 %	0 %	378974708
1538	NC_016844	G	6	6	85395	85400	0 %	0 %	100 %	0 %	378974708
1539	NC_016844	GGAGTA	2	12	85482	85493	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378974708
1540	NC_016844	CGT	2	6	85501	85506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974708
1541	NC_016844	GCA	2	6	85550	85555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974708
1542	NC_016844	CAGA	2	8	85582	85589	50 %	0 %	25 %	25 %	378974708
1543	NC_016844	GTG	2	6	85605	85610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974708
1544	NC_016844	CGTGAA	2	12	85701	85712	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378974708
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1546	NC_016844	A	8	8	85897	85904	100 %	0 %	0 %	0 %	378974709
1547	NC_016844	TGA	2	6	85920	85925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974709
1548	NC_016844	GCA	2	6	85932	85937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974709
1549	NC_016844	CAA	2	6	85947	85952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974709
1550	NC_016844	T	6	6	85963	85968	0 %	100 %	0 %	0 %	378974709
1551	NC_016844	GC	3	6	85995	86000	0 %	0 %	50 %	50 %	378974709
1552	NC_016844	GGAT	2	8	86023	86030	25 %	25 %	50 %	0 %	378974709
1553	NC_016844	ACG	2	6	86032	86037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974709
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1555	NC_016844	GT	3	6	86280	86285	0 %	50 %	50 %	0 %	378974709
1556	NC_016844	A	6	6	86298	86303	100 %	0 %	0 %	0 %	378974709
1557	NC_016844	GC	3	6	86308	86313	0 %	0 %	50 %	50 %	378974709
1558	NC_016844	CCAT	2	8	86330	86337	25 %	25 %	0 %	50 %	378974709
1559	NC_016844	GTG	2	6	86401	86406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974709
1560	NC_016844	GCA	2	6	86413	86418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974709
1561	NC_016844	CCA	2	6	86492	86497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974709
1562	NC_016844	ACC	2	6	86506	86511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974709
1563	NC_016844	AGG	2	6	86517	86522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974709
1564	NC_016844	ATG	2	6	86537	86542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974709
1565	NC_016844	GCACC	2	10	86618	86627	20 %	0 %	20 %	60 %	378974709
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1567	NC_016844	GGC	2	6	86712	86717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974709
1568	NC_016844	CG	4	8	86734	86741	0 %	0 %	50 %	50 %	378974709
1569	NC_016844	GCC	2	6	86746	86751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974709
1570	NC_016844	T	7	7	86782	86788	0 %	100 %	0 %	0 %	378974709
1571	NC_016844	ATTTGT	2	12	86822	86833	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378974709
1572	NC_016844	ATT	2	6	86883	86888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974709
1573	NC_016844	T	6	6	86944	86949	0 %	100 %	0 %	0 %	378974709
1574	NC_016844	TG	3	6	86960	86965	0 %	50 %	50 %	0 %	378974709
1575	NC_016844	ACGCTT	2	12	87010	87021	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378974709
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1579	NC_016844	GC	3	6	87141	87146	0 %	0 %	50 %	50 %	378974710
1580	NC_016844	CG	3	6	87181	87186	0 %	0 %	50 %	50 %	378974710
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1583	NC_016844	GCA	2	6	87249	87254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974710
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1585	NC_016844	TGA	2	6	87362	87367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974710
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1593	NC_016844	CGC	2	6	87890	87895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974710
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1596	NC_016844	ATGG	2	8	88072	88079	25 %	25 %	50 %	0 %	378974710
1597	NC_016844	AT	3	6	88141	88146	50 %	50 %	0 %	0 %	378974710
1598	NC_016844	TG	3	6	88222	88227	0 %	50 %	50 %	0 %	378974710
1599	NC_016844	AGGA	2	8	88228	88235	50 %	0 %	50 %	0 %	378974710
1600	NC_016844	TCG	2	6	88241	88246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974710
1601	NC_016844	GC	3	6	88407	88412	0 %	0 %	50 %	50 %	378974710
1602	NC_016844	TCA	2	6	88471	88476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974710
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1605	NC_016844	AGT	2	6	88515	88520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974710
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1609	NC_016844	CTG	2	6	88774	88779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974710
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1611	NC_016844	TAT	2	6	88856	88861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974710
1612	NC_016844	GTTT	2	8	88913	88920	0 %	75 %	25 %	0 %	378974710
1613	NC_016844	GTACC	2	10	88955	88964	20 %	20 %	20 %	40 %	378974710
1614	NC_016844	GC	3	6	89025	89030	0 %	0 %	50 %	50 %	378974710
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1620	NC_016844	TAC	2	6	89151	89156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974710
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1624	NC_016844	CTTC	2	8	89360	89367	0 %	50 %	0 %	50 %	378974711
1625	NC_016844	GA	3	6	89391	89396	50 %	0 %	50 %	0 %	378974711
1626	NC_016844	T	6	6	89453	89458	0 %	100 %	0 %	0 %	378974711
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