MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016844	ATA	2	6	55423	55428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974672
1003	NC_016844	ATGCT	2	10	55484	55493	20 %	40 %	20 %	20 %	378974673
1004	NC_016844	A	6	6	55536	55541	100 %	0 %	0 %	0 %	378974673
1005	NC_016844	AGG	2	6	55584	55589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974673
1006	NC_016844	GT	3	6	55627	55632	0 %	50 %	50 %	0 %	378974673
1007	NC_016844	ACG	2	6	55638	55643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974673
1008	NC_016844	CAG	2	6	55657	55662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974673
1009	NC_016844	CAC	2	6	55698	55703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974673
1010	NC_016844	AC	3	6	55727	55732	50 %	0 %	0 %	50 %	378974673
1011	NC_016844	ACA	2	6	55823	55828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974674
1012	NC_016844	CAT	2	6	55850	55855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974674
1013	NC_016844	ATA	2	6	55870	55875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974674
1014	NC_016844	T	7	7	55878	55884	0 %	100 %	0 %	0 %	378974674
1015	NC_016844	CTG	2	6	55917	55922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974674
1016	NC_016844	CAA	2	6	55932	55937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974674
1017	NC_016844	GC	4	8	55942	55949	0 %	0 %	50 %	50 %	378974674
1018	NC_016844	GCA	2	6	55952	55957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974674
1019	NC_016844	CTA	2	6	55969	55974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974674
1020	NC_016844	CTT	2	6	55981	55986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974674
1021	NC_016844	CTAA	2	8	56043	56050	50 %	25 %	0 %	25 %	378974674
1022	NC_016844	CTT	2	6	56101	56106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974674
1023	NC_016844	GCA	2	6	56181	56186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974674
1024	NC_016844	TATG	2	8	56200	56207	25 %	50 %	25 %	0 %	378974674
1025	NC_016844	TCCT	2	8	56417	56424	0 %	50 %	0 %	50 %	378974674
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1029	NC_016844	GCG	2	6	56774	56779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974675
1030	NC_016844	T	6	6	56801	56806	0 %	100 %	0 %	0 %	378974675
1031	NC_016844	AT	3	6	56808	56813	50 %	50 %	0 %	0 %	378974675
1032	NC_016844	TTC	2	6	56863	56868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974675
1033	NC_016844	CTGCA	2	10	56887	56896	20 %	20 %	20 %	40 %	378974675
1034	NC_016844	AGG	2	6	56921	56926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974675
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1036	NC_016844	GC	3	6	56935	56940	0 %	0 %	50 %	50 %	378974675
1037	NC_016844	T	8	8	56969	56976	0 %	100 %	0 %	0 %	378974675
1038	NC_016844	CT	3	6	56979	56984	0 %	50 %	0 %	50 %	378974675
1039	NC_016844	AGG	2	6	56986	56991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974675
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1042	NC_016844	A	6	6	57175	57180	100 %	0 %	0 %	0 %	378974676
1043	NC_016844	CCA	2	6	57191	57196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974676
1044	NC_016844	TCC	2	6	57285	57290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974676
1045	NC_016844	GAT	2	6	57294	57299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974676
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1047	NC_016844	CG	4	8	57328	57335	0 %	0 %	50 %	50 %	378974676
1048	NC_016844	ACA	2	6	57409	57414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974676
1049	NC_016844	GAT	2	6	57624	57629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974677
1050	NC_016844	TGC	2	6	57646	57651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974677
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1054	NC_016844	GGC	2	6	57996	58001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974677
1055	NC_016844	CAT	2	6	58106	58111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974677
1056	NC_016844	GA	3	6	58193	58198	50 %	0 %	50 %	0 %	378974677
1057	NC_016844	CTG	2	6	58247	58252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974677
1058	NC_016844	CTT	2	6	58253	58258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974677
1059	NC_016844	CCG	2	6	58307	58312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974677
1060	NC_016844	A	8	8	58352	58359	100 %	0 %	0 %	0 %	378974677
1061	NC_016844	AGA	2	6	58384	58389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974677
1062	NC_016844	GTA	2	6	58411	58416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974677
1063	NC_016844	GCG	2	6	58480	58485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974677
1064	NC_016844	GC	3	6	58491	58496	0 %	0 %	50 %	50 %	378974677
1065	NC_016844	ACGA	2	8	58548	58555	50 %	0 %	25 %	25 %	378974677
1066	NC_016844	TGC	2	6	58821	58826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974678
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1068	NC_016844	GCAGG	2	10	58861	58870	20 %	0 %	60 %	20 %	378974678
1069	NC_016844	GTA	3	9	58880	58888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974678
1070	NC_016844	AG	3	6	58916	58921	50 %	0 %	50 %	0 %	378974678
1071	NC_016844	AGT	2	6	58987	58992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974678
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1073	NC_016844	AGG	2	6	59171	59176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974678
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1087	NC_016844	TGA	2	6	59944	59949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974679
1088	NC_016844	AGC	2	6	59950	59955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974679
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1091	NC_016844	TGC	2	6	60195	60200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974679
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1095	NC_016844	CTAC	2	8	60323	60330	25 %	25 %	0 %	50 %	378974679
1096	NC_016844	TGTC	2	8	60343	60350	0 %	50 %	25 %	25 %	378974679
1097	NC_016844	TCAAA	2	10	60364	60373	60 %	20 %	0 %	20 %	378974679
1098	NC_016844	GCA	2	6	60402	60407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974679
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1101	NC_016844	GA	3	6	60624	60629	50 %	0 %	50 %	0 %	378974679
1102	NC_016844	CG	3	6	60678	60683	0 %	0 %	50 %	50 %	378974680
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1105	NC_016844	TTGC	2	8	60760	60767	0 %	50 %	25 %	25 %	378974680
1106	NC_016844	CGTG	2	8	60775	60782	0 %	25 %	50 %	25 %	378974680
1107	NC_016844	CAG	2	6	60796	60801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974680
1108	NC_016844	T	6	6	60895	60900	0 %	100 %	0 %	0 %	378974680
1109	NC_016844	ATG	2	6	60994	60999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974680
1110	NC_016844	TGCG	2	8	61109	61116	0 %	25 %	50 %	25 %	378974680
1111	NC_016844	CT	3	6	61130	61135	0 %	50 %	0 %	50 %	378974680
1112	NC_016844	CG	3	6	61188	61193	0 %	0 %	50 %	50 %	378974680
1113	NC_016844	CG	3	6	61220	61225	0 %	0 %	50 %	50 %	378974680
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1118	NC_016844	GC	3	6	61531	61536	0 %	0 %	50 %	50 %	378974680
1119	NC_016844	GCA	2	6	61546	61551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974680
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1121	NC_016844	ATC	2	6	61751	61756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974681
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1123	NC_016844	CCA	2	6	61942	61947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974681
1124	NC_016844	C	6	6	61990	61995	0 %	0 %	0 %	100 %	378974681
1125	NC_016844	AAT	2	6	62093	62098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974681
1126	NC_016844	GT	4	8	62117	62124	0 %	50 %	50 %	0 %	378974681
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