MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_016844	AGCA	2	8	616242	616249	50 %	0 %	25 %	25 %	378975203
12003	NC_016844	CG	4	8	616252	616259	0 %	0 %	50 %	50 %	378975203
12004	NC_016844	AC	3	6	616286	616291	50 %	0 %	0 %	50 %	378975203
12005	NC_016844	CA	3	6	616296	616301	50 %	0 %	0 %	50 %	378975203
12006	NC_016844	ACT	2	6	616495	616500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378975203
12007	NC_016844	T	6	6	616533	616538	0 %	100 %	0 %	0 %	378975203
12008	NC_016844	A	8	8	616639	616646	100 %	0 %	0 %	0 %	378975203
12009	NC_016844	CA	3	6	616650	616655	50 %	0 %	0 %	50 %	378975203
12010	NC_016844	AAATAC	2	12	616694	616705	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378975203
12011	NC_016844	ACTG	2	8	616757	616764	25 %	25 %	25 %	25 %	378975203
12012	NC_016844	TGA	2	6	616878	616883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975203
12013	NC_016844	GGAA	2	8	616915	616922	50 %	0 %	50 %	0 %	378975203
12014	NC_016844	AGAA	2	8	616951	616958	75 %	0 %	25 %	0 %	378975203
12015	NC_016844	ACC	2	6	617003	617008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378975203
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12017	NC_016844	A	7	7	617077	617083	100 %	0 %	0 %	0 %	378975203
12018	NC_016844	A	7	7	617122	617128	100 %	0 %	0 %	0 %	378975203
12019	NC_016844	CT	3	6	617158	617163	0 %	50 %	0 %	50 %	378975203
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12021	NC_016844	TG	3	6	617275	617280	0 %	50 %	50 %	0 %	378975203
12022	NC_016844	GCAC	2	8	617306	617313	25 %	0 %	25 %	50 %	378975203
12023	NC_016844	AAAAG	2	10	617349	617358	80 %	0 %	20 %	0 %	378975203
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12029	NC_016844	A	7	7	617610	617616	100 %	0 %	0 %	0 %	378975203
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12041	NC_016844	AAT	2	6	618178	618183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378975204
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12051	NC_016844	CTG	2	6	618749	618754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975205
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12057	NC_016844	CGC	3	9	619335	619343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975206
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12059	NC_016844	TCCC	2	8	619356	619363	0 %	25 %	0 %	75 %	378975206
12060	NC_016844	TCCT	2	8	619365	619372	0 %	50 %	0 %	50 %	378975206
12061	NC_016844	CA	4	8	619375	619382	50 %	0 %	0 %	50 %	378975206
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12124	NC_016844	TGC	2	6	621775	621780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975207
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12491	NC_016844	GTC	2	6	640838	640843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378975222
12492	NC_016844	TGA	2	6	640849	640854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975222
12493	NC_016844	A	6	6	640971	640976	100 %	0 %	0 %	0 %	378975222
12494	NC_016844	GGC	2	6	640999	641004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378975222
12495	NC_016844	GCC	2	6	641038	641043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378975222
12496	NC_016844	GCAC	2	8	641053	641060	25 %	0 %	25 %	50 %	378975222
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12500	NC_016844	ATG	2	6	641168	641173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378975222

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