MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016844	CGGCAC	2	12	323679	323690	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378974936
6002	NC_016844	GC	3	6	323718	323723	0 %	0 %	50 %	50 %	378974936
6003	NC_016844	GGT	2	6	323780	323785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974936
6004	NC_016844	TGG	2	6	323878	323883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974936
6005	NC_016844	CGG	2	6	323884	323889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974936
6006	NC_016844	AAG	2	6	324170	324175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974937
6007	NC_016844	AGC	2	6	324207	324212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974937
6008	NC_016844	AGC	2	6	324237	324242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974937
6009	NC_016844	GCG	2	6	324364	324369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974937
6010	NC_016844	GC	3	6	324492	324497	0 %	0 %	50 %	50 %	378974937
6011	NC_016844	ATG	2	6	324498	324503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974937
6012	NC_016844	TCA	2	6	324504	324509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974937
6013	NC_016844	CTA	2	6	324510	324515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974937
6014	NC_016844	CAT	2	6	324538	324543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974937
6015	NC_016844	GAG	2	6	324599	324604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974937
6016	NC_016844	ATCC	2	8	324647	324654	25 %	25 %	0 %	50 %	378974937
6017	NC_016844	TAC	2	6	324683	324688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974937
6018	NC_016844	GGC	2	6	324773	324778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974938
6019	NC_016844	GAT	2	6	324787	324792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974938
6020	NC_016844	GTT	2	6	324805	324810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974938
6021	NC_016844	GTA	2	6	324835	324840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974938
6022	NC_016844	T	7	7	324864	324870	0 %	100 %	0 %	0 %	378974938
6023	NC_016844	TGA	2	6	324896	324901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974938
6024	NC_016844	CTG	2	6	324932	324937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974938
6025	NC_016844	GTT	2	6	325009	325014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974938
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6028	NC_016844	GC	3	6	325141	325146	0 %	0 %	50 %	50 %	378974938
6029	NC_016844	GCT	3	9	325150	325158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974938
6030	NC_016844	TCTG	2	8	325260	325267	0 %	50 %	25 %	25 %	378974938
6031	NC_016844	GTC	2	6	325288	325293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974938
6032	NC_016844	GA	3	6	325426	325431	50 %	0 %	50 %	0 %	378974938
6033	NC_016844	GAA	2	6	325451	325456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974938
6034	NC_016844	CG	3	6	325479	325484	0 %	0 %	50 %	50 %	378974938
6035	NC_016844	CG	3	6	325514	325519	0 %	0 %	50 %	50 %	378974938
6036	NC_016844	TGCAGG	2	12	325538	325549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378974938
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6038	NC_016844	G	7	7	325657	325663	0 %	0 %	100 %	0 %	378974938
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6040	NC_016844	G	7	7	325755	325761	0 %	0 %	100 %	0 %	378974938
6041	NC_016844	GGTG	2	8	325782	325789	0 %	25 %	75 %	0 %	378974938
6042	NC_016844	GT	3	6	325871	325876	0 %	50 %	50 %	0 %	378974939
6043	NC_016844	CTG	2	6	325883	325888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974939
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6045	NC_016844	CGC	2	6	326007	326012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974939
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6048	NC_016844	TGCGC	2	10	326137	326146	0 %	20 %	40 %	40 %	378974939
6049	NC_016844	CG	3	6	326337	326342	0 %	0 %	50 %	50 %	378974939
6050	NC_016844	TCG	2	6	326363	326368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974939
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6053	NC_016844	TGCGT	2	10	326638	326647	0 %	40 %	40 %	20 %	378974939
6054	NC_016844	TGC	2	6	326677	326682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974939
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6056	NC_016844	CGT	2	6	326867	326872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974940
6057	NC_016844	GC	3	6	326881	326886	0 %	0 %	50 %	50 %	378974940
6058	NC_016844	TGG	2	6	326903	326908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974940
6059	NC_016844	GTCG	2	8	326911	326918	0 %	25 %	50 %	25 %	378974940
6060	NC_016844	TGG	2	6	326933	326938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974940
6061	NC_016844	TGC	2	6	326940	326945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974940
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6063	NC_016844	CTT	2	6	326969	326974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974940
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6065	NC_016844	CCT	3	9	326983	326991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974940
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6070	NC_016844	CG	3	6	327174	327179	0 %	0 %	50 %	50 %	378974940
6071	NC_016844	CGTA	2	8	327200	327207	25 %	25 %	25 %	25 %	378974940
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6095	NC_016844	G	6	6	328273	328278	0 %	0 %	100 %	0 %	378974942
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6098	NC_016844	GTGC	2	8	328403	328410	0 %	25 %	50 %	25 %	378974942
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6105	NC_016844	GCA	2	6	328558	328563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974942
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6107	NC_016844	CGG	2	6	328611	328616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974942
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6109	NC_016844	CA	3	6	328629	328634	50 %	0 %	0 %	50 %	378974942
6110	NC_016844	CG	3	6	328635	328640	0 %	0 %	50 %	50 %	378974942
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6121	NC_016844	GT	3	6	329044	329049	0 %	50 %	50 %	0 %	378974942
6122	NC_016844	GC	3	6	329087	329092	0 %	0 %	50 %	50 %	378974942
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6495	NC_016844	TTC	2	6	350510	350515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974956
6496	NC_016844	TCA	2	6	350548	350553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974956
6497	NC_016844	T	6	6	350582	350587	0 %	100 %	0 %	0 %	378974956
6498	NC_016844	T	6	6	350674	350679	0 %	100 %	0 %	0 %	378974956
6499	NC_016844	GC	3	6	350706	350711	0 %	0 %	50 %	50 %	378974956
6500	NC_016844	CTT	2	6	350723	350728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974956

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