MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016844	ATGA	2	8	301106	301113	50 %	25 %	25 %	0 %	378974919
5502	NC_016844	TG	3	6	301192	301197	0 %	50 %	50 %	0 %	378974919
5503	NC_016844	CGG	2	6	301214	301219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974919
5504	NC_016844	ATCT	2	8	301227	301234	25 %	50 %	0 %	25 %	378974919
5505	NC_016844	ATT	2	6	301277	301282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974919
5506	NC_016844	AGA	2	6	301312	301317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974919
5507	NC_016844	CAG	2	6	301352	301357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974919
5508	NC_016844	GGC	2	6	301374	301379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974919
5509	NC_016844	TGA	2	6	301441	301446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974919
5510	NC_016844	CA	3	6	301483	301488	50 %	0 %	0 %	50 %	378974920
5511	NC_016844	GGT	2	6	301490	301495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974920
5512	NC_016844	GGT	2	6	301497	301502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974920
5513	NC_016844	T	6	6	301526	301531	0 %	100 %	0 %	0 %	378974920
5514	NC_016844	AGT	2	6	301538	301543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974920
5515	NC_016844	T	6	6	301578	301583	0 %	100 %	0 %	0 %	378974920
5516	NC_016844	GCA	2	6	301635	301640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974920
5517	NC_016844	ATGT	2	8	301755	301762	25 %	50 %	25 %	0 %	378974920
5518	NC_016844	TTC	2	6	301868	301873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974920
5519	NC_016844	GTACT	2	10	301879	301888	20 %	40 %	20 %	20 %	378974920
5520	NC_016844	CTT	2	6	301925	301930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974920
5521	NC_016844	TTG	2	6	301987	301992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378974920
5522	NC_016844	G	6	6	302095	302100	0 %	0 %	100 %	0 %	378974920
5523	NC_016844	T	7	7	302253	302259	0 %	100 %	0 %	0 %	378974920
5524	NC_016844	T	6	6	302262	302267	0 %	100 %	0 %	0 %	378974920
5525	NC_016844	A	7	7	302352	302358	100 %	0 %	0 %	0 %	378974920
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5527	NC_016844	AGTG	2	8	302376	302383	25 %	25 %	50 %	0 %	378974920
5528	NC_016844	TGA	2	6	302557	302562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974921
5529	NC_016844	A	6	6	302570	302575	100 %	0 %	0 %	0 %	378974921
5530	NC_016844	GC	5	10	302591	302600	0 %	0 %	50 %	50 %	378974921
5531	NC_016844	AGA	2	6	302629	302634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974921
5532	NC_016844	CGT	2	6	302695	302700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974921
5533	NC_016844	T	6	6	302722	302727	0 %	100 %	0 %	0 %	378974921
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5537	NC_016844	GC	3	6	302837	302842	0 %	0 %	50 %	50 %	378974921
5538	NC_016844	CGC	2	6	302912	302917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974921
5539	NC_016844	GT	4	8	302930	302937	0 %	50 %	50 %	0 %	378974921
5540	NC_016844	CTGCCG	2	12	302946	302957	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378974921
5541	NC_016844	AGCG	2	8	303009	303016	25 %	0 %	50 %	25 %	378974921
5542	NC_016844	ATG	2	6	303023	303028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974921
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5544	NC_016844	ATGCGT	2	12	303084	303095	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378974921
5545	NC_016844	CG	3	6	303097	303102	0 %	0 %	50 %	50 %	378974921
5546	NC_016844	GGT	3	9	303106	303114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974921
5547	NC_016844	GCG	2	6	303164	303169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974921
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5549	NC_016844	G	6	6	303382	303387	0 %	0 %	100 %	0 %	378974921
5550	NC_016844	T	6	6	303548	303553	0 %	100 %	0 %	0 %	378974921
5551	NC_016844	CAC	2	6	303568	303573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974921
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5555	NC_016844	CG	4	8	303611	303618	0 %	0 %	50 %	50 %	378974921
5556	NC_016844	ACGG	3	12	303688	303699	25 %	0 %	50 %	25 %	378974921
5557	NC_016844	CTT	2	6	303717	303722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974921
5558	NC_016844	GCTGCA	2	12	303794	303805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378974921
5559	NC_016844	GCG	2	6	303809	303814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974921
5560	NC_016844	T	6	6	303844	303849	0 %	100 %	0 %	0 %	378974921
5561	NC_016844	CTG	2	6	303885	303890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974921
5562	NC_016844	CTG	2	6	303894	303899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974921
5563	NC_016844	GCA	2	6	303922	303927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974921
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5567	NC_016844	CTG	2	6	304018	304023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974921
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5571	NC_016844	T	7	7	304159	304165	0 %	100 %	0 %	0 %	378974921
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5589	NC_016844	GAA	2	6	305134	305139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974922
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5593	NC_016844	TGC	2	6	305287	305292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974922
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5596	NC_016844	GC	3	6	305439	305444	0 %	0 %	50 %	50 %	378974922
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5599	NC_016844	AT	3	6	305646	305651	50 %	50 %	0 %	0 %	378974922
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5605	NC_016844	TG	3	6	305931	305936	0 %	50 %	50 %	0 %	378974923
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5608	NC_016844	TAT	2	6	306128	306133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974923
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5611	NC_016844	A	7	7	306275	306281	100 %	0 %	0 %	0 %	378974923
5612	NC_016844	GA	3	6	306361	306366	50 %	0 %	50 %	0 %	378974923
5613	NC_016844	GTG	2	6	306437	306442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974923
5614	NC_016844	CG	3	6	306459	306464	0 %	0 %	50 %	50 %	378974923
5615	NC_016844	AG	3	6	306479	306484	50 %	0 %	50 %	0 %	378974923
5616	NC_016844	GC	3	6	306536	306541	0 %	0 %	50 %	50 %	378974923
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5997	NC_016844	GC	3	6	323484	323489	0 %	0 %	50 %	50 %	378974936
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5999	NC_016844	CG	5	10	323638	323647	0 %	0 %	50 %	50 %	378974936
6000	NC_016844	G	6	6	323662	323667	0 %	0 %	100 %	0 %	378974936

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