MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum DAL-1 chromosome

Total Repeats: 22292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016844	TGC	2	6	268788	268793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974892
5003	NC_016844	TTTTC	2	10	268795	268804	0 %	80 %	0 %	20 %	378974892
5004	NC_016844	TTA	2	6	268831	268836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974892
5005	NC_016844	CG	3	6	268837	268842	0 %	0 %	50 %	50 %	378974892
5006	NC_016844	TTTTTC	2	12	268950	268961	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	378974892
5007	NC_016844	ATG	2	6	268988	268993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974892
5008	NC_016844	T	6	6	269085	269090	0 %	100 %	0 %	0 %	378974892
5009	NC_016844	CTT	2	6	269093	269098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974892
5010	NC_016844	TGGC	2	8	269124	269131	0 %	25 %	50 %	25 %	378974892
5011	NC_016844	TGCG	2	8	269151	269158	0 %	25 %	50 %	25 %	378974892
5012	NC_016844	GCC	2	6	269163	269168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974892
5013	NC_016844	GTG	2	6	269177	269182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974892
5014	NC_016844	CTT	2	6	269202	269207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974892
5015	NC_016844	T	8	8	269206	269213	0 %	100 %	0 %	0 %	378974892
5016	NC_016844	T	6	6	269227	269232	0 %	100 %	0 %	0 %	378974892
5017	NC_016844	GT	3	6	269249	269254	0 %	50 %	50 %	0 %	378974892
5018	NC_016844	TG	3	6	269414	269419	0 %	50 %	50 %	0 %	378974893
5019	NC_016844	G	9	9	269427	269435	0 %	0 %	100 %	0 %	378974893
5020	NC_016844	GCA	2	6	269566	269571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974893
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5022	NC_016844	TGAC	2	8	269634	269641	25 %	25 %	25 %	25 %	378974893
5023	NC_016844	AGA	2	6	269707	269712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974893
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5025	NC_016844	CG	3	6	269748	269753	0 %	0 %	50 %	50 %	378974893
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5028	NC_016844	A	6	6	269960	269965	100 %	0 %	0 %	0 %	378974893
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5031	NC_016844	GGA	2	6	270222	270227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974893
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5033	NC_016844	GAAA	2	8	270331	270338	75 %	0 %	25 %	0 %	378974893
5034	NC_016844	CG	3	6	270352	270357	0 %	0 %	50 %	50 %	378974893
5035	NC_016844	GTG	2	6	270407	270412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974893
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5038	NC_016844	CG	3	6	270594	270599	0 %	0 %	50 %	50 %	378974894
5039	NC_016844	CG	4	8	270627	270634	0 %	0 %	50 %	50 %	378974894
5040	NC_016844	GC	3	6	270704	270709	0 %	0 %	50 %	50 %	378974894
5041	NC_016844	CGC	2	6	270721	270726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974894
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5043	NC_016844	TTCTC	2	10	270788	270797	0 %	60 %	0 %	40 %	378974894
5044	NC_016844	CAT	2	6	270886	270891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974894
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5053	NC_016844	AG	3	6	271237	271242	50 %	0 %	50 %	0 %	378974894
5054	NC_016844	GT	3	6	271274	271279	0 %	50 %	50 %	0 %	378974895
5055	NC_016844	TG	3	6	271349	271354	0 %	50 %	50 %	0 %	378974895
5056	NC_016844	GGA	3	9	271395	271403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974895
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5061	NC_016844	GAA	2	6	271531	271536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974896
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5063	NC_016844	ATT	2	6	271693	271698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378974896
5064	NC_016844	TATC	2	8	271839	271846	25 %	50 %	0 %	25 %	378974896
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5097	NC_016844	CGGA	2	8	274047	274054	25 %	0 %	50 %	25 %	378974898
5098	NC_016844	GAG	2	6	274118	274123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974898
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5102	NC_016844	GA	3	6	274747	274752	50 %	0 %	50 %	0 %	378974899
5103	NC_016844	ACG	2	6	274798	274803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974899
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5108	NC_016844	GCA	2	6	275008	275013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974899
5109	NC_016844	CG	3	6	275018	275023	0 %	0 %	50 %	50 %	378974899
5110	NC_016844	TAG	2	6	275143	275148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974899
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5119	NC_016844	TGA	2	6	275666	275671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974900
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5121	NC_016844	GCA	2	6	275723	275728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974900
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5123	NC_016844	G	7	7	275808	275814	0 %	0 %	100 %	0 %	378974900
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5372	NC_016844	CGG	2	6	294168	294173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974915
5373	NC_016844	GTA	2	6	294210	294215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974915
5374	NC_016844	TGC	2	6	294265	294270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974915
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5376	NC_016844	TGA	2	6	294371	294376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974915
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5402	NC_016844	TTCT	2	8	295651	295658	0 %	75 %	0 %	25 %	378974916
5403	NC_016844	CGC	2	6	295675	295680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974916
5404	NC_016844	GCG	2	6	295739	295744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974916
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5411	NC_016844	CTG	2	6	295919	295924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974916
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5481	NC_016844	CGTGC	2	10	299914	299923	0 %	20 %	40 %	40 %	378974919
5482	NC_016844	GCG	2	6	299962	299967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974919
5483	NC_016844	GCT	2	6	299993	299998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974919
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5495	NC_016844	CGT	2	6	300814	300819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974919
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5497	NC_016844	GC	3	6	300926	300931	0 %	0 %	50 %	50 %	378974919
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5499	NC_016844	T	6	6	301025	301030	0 %	100 %	0 %	0 %	378974919
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