MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016843	CG	4	8	53229	53236	0 %	0 %	50 %	50 %	378973607
1002	NC_016843	TAC	2	6	53237	53242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973607
1003	NC_016843	AAG	2	6	53276	53281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973607
1004	NC_016843	AATC	2	8	53322	53329	50 %	25 %	0 %	25 %	378973607
1005	NC_016843	ATTA	2	8	53350	53357	50 %	50 %	0 %	0 %	378973607
1006	NC_016843	GA	3	6	53365	53370	50 %	0 %	50 %	0 %	378973607
1007	NC_016843	TA	4	8	53540	53547	50 %	50 %	0 %	0 %	378973607
1008	NC_016843	CG	3	6	53617	53622	0 %	0 %	50 %	50 %	378973607
1009	NC_016843	TTA	2	6	53624	53629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973607
1010	NC_016843	CAAA	2	8	53692	53699	75 %	0 %	0 %	25 %	378973607
1011	NC_016843	GAA	2	6	53752	53757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973607
1012	NC_016843	TAT	2	6	53772	53777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378973607
1013	NC_016843	CGCTG	2	10	53790	53799	0 %	20 %	40 %	40 %	378973607
1014	NC_016843	CG	3	6	53802	53807	0 %	0 %	50 %	50 %	378973607
1015	NC_016843	ATC	2	6	53831	53836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973607
1016	NC_016843	CGA	2	6	53853	53858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973607
1017	NC_016843	AT	3	6	53862	53867	50 %	50 %	0 %	0 %	378973607
1018	NC_016843	GAT	2	6	53881	53886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973607
1019	NC_016843	CG	3	6	53928	53933	0 %	0 %	50 %	50 %	378973607
1020	NC_016843	AGA	2	6	54011	54016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973607
1021	NC_016843	CTG	2	6	54020	54025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973607
1022	NC_016843	A	7	7	54038	54044	100 %	0 %	0 %	0 %	378973607
1023	NC_016843	CAA	2	6	54084	54089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973607
1024	NC_016843	GCTAC	2	10	54154	54163	20 %	20 %	20 %	40 %	378973607
1025	NC_016843	TCGCT	2	10	54191	54200	0 %	40 %	20 %	40 %	378973607
1026	NC_016843	GGAA	2	8	54315	54322	50 %	0 %	50 %	0 %	378973607
1027	NC_016843	CG	3	6	54348	54353	0 %	0 %	50 %	50 %	378973607
1028	NC_016843	TC	3	6	54363	54368	0 %	50 %	0 %	50 %	378973607
1029	NC_016843	AGC	2	6	54485	54490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973607
1030	NC_016843	A	6	6	54632	54637	100 %	0 %	0 %	0 %	378973608
1031	NC_016843	CATC	2	8	54676	54683	25 %	25 %	0 %	50 %	378973608
1032	NC_016843	T	8	8	54685	54692	0 %	100 %	0 %	0 %	378973608
1033	NC_016843	TTTC	2	8	54765	54772	0 %	75 %	0 %	25 %	378973608
1034	NC_016843	CTTT	2	8	54895	54902	0 %	75 %	0 %	25 %	378973608
1035	NC_016843	T	6	6	54900	54905	0 %	100 %	0 %	0 %	378973608
1036	NC_016843	CAT	2	6	55007	55012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973608
1037	NC_016843	TTC	2	6	55142	55147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973608
1038	NC_016843	ACG	2	6	55188	55193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973608
1039	NC_016843	AAT	2	6	55283	55288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973608
1040	NC_016843	TCG	2	6	55299	55304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973608
1041	NC_016843	ACT	2	6	55338	55343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973608
1042	NC_016843	TCGT	2	8	55361	55368	0 %	50 %	25 %	25 %	378973608
1043	NC_016843	ATA	2	6	55421	55426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973608
1044	NC_016843	ATGCT	2	10	55482	55491	20 %	40 %	20 %	20 %	378973609
1045	NC_016843	A	6	6	55534	55539	100 %	0 %	0 %	0 %	378973609
1046	NC_016843	AGG	2	6	55582	55587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973609
1047	NC_016843	GT	3	6	55625	55630	0 %	50 %	50 %	0 %	378973609
1048	NC_016843	ACG	2	6	55636	55641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973609
1049	NC_016843	CAG	2	6	55655	55660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973609
1050	NC_016843	CAC	2	6	55696	55701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378973609
1051	NC_016843	AC	3	6	55725	55730	50 %	0 %	0 %	50 %	378973609
1052	NC_016843	ACA	2	6	55821	55826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973610
1053	NC_016843	CAT	2	6	55848	55853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973610
1054	NC_016843	ATA	2	6	55868	55873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378973610
1055	NC_016843	T	7	7	55876	55882	0 %	100 %	0 %	0 %	378973610
1056	NC_016843	CTG	2	6	55915	55920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973610
1057	NC_016843	CAA	2	6	55930	55935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973610
1058	NC_016843	GC	4	8	55940	55947	0 %	0 %	50 %	50 %	378973610
1059	NC_016843	GCA	2	6	55950	55955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973610
1060	NC_016843	CTA	2	6	55967	55972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973610
1061	NC_016843	CTT	2	6	55979	55984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973610
1062	NC_016843	CTAA	2	8	56041	56048	50 %	25 %	0 %	25 %	378973610
1063	NC_016843	CTT	2	6	56099	56104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973610
1064	NC_016843	GCA	2	6	56179	56184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973610
1065	NC_016843	TATG	2	8	56198	56205	25 %	50 %	25 %	0 %	378973610
1066	NC_016843	TCCT	2	8	56415	56422	0 %	50 %	0 %	50 %	378973610
1067	NC_016843	GCG	2	6	56435	56440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973610
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1069	NC_016843	GTG	2	6	56715	56720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378973611
1070	NC_016843	GCG	2	6	56772	56777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973611
1071	NC_016843	T	6	6	56799	56804	0 %	100 %	0 %	0 %	378973611
1072	NC_016843	AT	3	6	56806	56811	50 %	50 %	0 %	0 %	378973611
1073	NC_016843	TTC	2	6	56861	56866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973611
1074	NC_016843	CTGCA	2	10	56885	56894	20 %	20 %	20 %	40 %	378973611
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1077	NC_016843	GC	3	6	56933	56938	0 %	0 %	50 %	50 %	378973611
1078	NC_016843	T	8	8	56967	56974	0 %	100 %	0 %	0 %	378973611
1079	NC_016843	CT	3	6	56977	56982	0 %	50 %	0 %	50 %	378973611
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1082	NC_016843	TTG	2	6	57128	57133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378973612
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1086	NC_016843	GAT	2	6	57292	57297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973612
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1088	NC_016843	CG	4	8	57326	57333	0 %	0 %	50 %	50 %	378973612
1089	NC_016843	ACA	2	6	57407	57412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973612
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1094	NC_016843	A	6	6	57924	57929	100 %	0 %	0 %	0 %	378973613
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1098	NC_016843	CTG	2	6	58245	58250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973613
1099	NC_016843	CTT	2	6	58251	58256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973613
1100	NC_016843	CCG	2	6	58305	58310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973613
1101	NC_016843	A	8	8	58350	58357	100 %	0 %	0 %	0 %	378973613
1102	NC_016843	AGA	2	6	58382	58387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973613
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1109	NC_016843	GCAGG	2	10	58859	58868	20 %	0 %	60 %	20 %	378973614
1110	NC_016843	GTA	3	9	58878	58886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973614
1111	NC_016843	AG	3	6	58914	58919	50 %	0 %	50 %	0 %	378973614
1112	NC_016843	AGT	2	6	58985	58990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973614
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1115	NC_016843	TGA	2	6	59195	59200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973614
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1117	NC_016843	AGG	2	6	59256	59261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973614
1118	NC_016843	TCA	2	6	59392	59397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973614
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1120	NC_016843	GC	3	6	59606	59611	0 %	0 %	50 %	50 %	378973615
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1123	NC_016843	GCT	2	6	59873	59878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973615
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1125	NC_016843	AGA	2	6	59902	59907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973615
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1128	NC_016843	TGA	2	6	59942	59947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973615
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1246	NC_016843	TG	3	6	66228	66233	0 %	50 %	50 %	0 %	378973622
1247	NC_016843	CGC	2	6	66242	66247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973622
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1250	NC_016843	TC	3	6	66367	66372	0 %	50 %	0 %	50 %	378973622
1251	NC_016843	CTTT	2	8	66420	66427	0 %	75 %	0 %	25 %	378973622
1252	NC_016843	AC	3	6	66470	66475	50 %	0 %	0 %	50 %	378973622
1253	NC_016843	TGC	2	6	66501	66506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973622
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