MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016843	TTGC	2	8	584538	584545	0 %	50 %	25 %	25 %	378974116
11502	NC_016843	A	6	6	584554	584559	100 %	0 %	0 %	0 %	378974116
11503	NC_016843	CG	3	6	584560	584565	0 %	0 %	50 %	50 %	378974116
11504	NC_016843	TTGC	2	8	584568	584575	0 %	50 %	25 %	25 %	378974116
11505	NC_016843	CGA	2	6	584615	584620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974116
11506	NC_016843	AGGCA	2	10	584637	584646	40 %	0 %	40 %	20 %	378974116
11507	NC_016843	TGC	2	6	584650	584655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974116
11508	NC_016843	CGC	2	6	584684	584689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974116
11509	NC_016843	CTG	2	6	584704	584709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974116
11510	NC_016843	GA	3	6	584771	584776	50 %	0 %	50 %	0 %	378974116
11511	NC_016843	GCG	2	6	584790	584795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974116
11512	NC_016843	CGCA	2	8	584896	584903	25 %	0 %	25 %	50 %	378974116
11513	NC_016843	CG	3	6	584961	584966	0 %	0 %	50 %	50 %	378974116
11514	NC_016843	GAA	2	6	585011	585016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974116
11515	NC_016843	CG	3	6	585054	585059	0 %	0 %	50 %	50 %	378974116
11516	NC_016843	CTC	2	6	585069	585074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974116
11517	NC_016843	CA	3	6	585135	585140	50 %	0 %	0 %	50 %	378974116
11518	NC_016843	CGC	2	6	585188	585193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974117
11519	NC_016843	GGGC	2	8	585196	585203	0 %	0 %	75 %	25 %	378974117
11520	NC_016843	CA	4	8	585235	585242	50 %	0 %	0 %	50 %	378974117
11521	NC_016843	ATA	2	6	585254	585259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974117
11522	NC_016843	CGA	2	6	585312	585317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974117
11523	NC_016843	GA	3	6	585316	585321	50 %	0 %	50 %	0 %	378974117
11524	NC_016843	T	6	6	585360	585365	0 %	100 %	0 %	0 %	378974117
11525	NC_016843	AGA	2	6	585449	585454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974117
11526	NC_016843	AGA	2	6	585504	585509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974117
11527	NC_016843	AAT	2	6	585535	585540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974117
11528	NC_016843	A	7	7	585584	585590	100 %	0 %	0 %	0 %	378974117
11529	NC_016843	A	6	6	585604	585609	100 %	0 %	0 %	0 %	378974117
11530	NC_016843	GTAC	2	8	585617	585624	25 %	25 %	25 %	25 %	378974117
11531	NC_016843	TG	3	6	585735	585740	0 %	50 %	50 %	0 %	378974117
11532	NC_016843	CAG	2	6	585748	585753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974117
11533	NC_016843	AGCAGA	2	12	585776	585787	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378974117
11534	NC_016843	GC	3	6	585847	585852	0 %	0 %	50 %	50 %	378974117
11535	NC_016843	GC	3	6	585960	585965	0 %	0 %	50 %	50 %	378974117
11536	NC_016843	CA	3	6	585979	585984	50 %	0 %	0 %	50 %	378974117
11537	NC_016843	CTT	2	6	586027	586032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974117
11538	NC_016843	GACA	2	8	586042	586049	50 %	0 %	25 %	25 %	378974117
11539	NC_016843	GC	3	6	586066	586071	0 %	0 %	50 %	50 %	378974117
11540	NC_016843	TAA	2	6	586111	586116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974117
11541	NC_016843	CG	3	6	586147	586152	0 %	0 %	50 %	50 %	378974117
11542	NC_016843	TCA	2	6	586326	586331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974117
11543	NC_016843	CCT	2	6	586332	586337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974117
11544	NC_016843	CGG	2	6	586384	586389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378974117
11545	NC_016843	ACC	2	6	586595	586600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974117
11546	NC_016843	AG	3	6	586737	586742	50 %	0 %	50 %	0 %	378974117
11547	NC_016843	GTG	2	6	586770	586775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378974117
11548	NC_016843	C	6	6	586810	586815	0 %	0 %	0 %	100 %	378974117
11549	NC_016843	GAA	2	6	586816	586821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974117
11550	NC_016843	AG	3	6	586864	586869	50 %	0 %	50 %	0 %	378974117
11551	NC_016843	GAT	2	6	586881	586886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378974118
11552	NC_016843	ACCGC	2	10	586915	586924	20 %	0 %	20 %	60 %	378974118
11553	NC_016843	ACTC	2	8	586937	586944	25 %	25 %	0 %	50 %	378974118
11554	NC_016843	GCA	2	6	586946	586951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974119
11555	NC_016843	CTT	3	9	587013	587021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378974119
11556	NC_016843	CCG	2	6	587076	587081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974119
11557	NC_016843	GCA	2	6	587174	587179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974119
11558	NC_016843	ATC	2	6	587182	587187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378974119
11559	NC_016843	T	6	6	587267	587272	0 %	100 %	0 %	0 %	378974119
11560	NC_016843	CA	3	6	587325	587330	50 %	0 %	0 %	50 %	378974119
11561	NC_016843	GCA	2	6	587513	587518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974119
11562	NC_016843	GCGCTC	2	12	587575	587586	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378974119
11563	NC_016843	GCT	2	6	587720	587725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974120
11564	NC_016843	CAG	2	6	587747	587752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974120
11565	NC_016843	GC	3	6	587760	587765	0 %	0 %	50 %	50 %	378974120
11566	NC_016843	ACAG	2	8	587770	587777	50 %	0 %	25 %	25 %	378974120
11567	NC_016843	CCA	3	9	587921	587929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974120
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11569	NC_016843	GCC	2	6	587983	587988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974120
11570	NC_016843	GAA	2	6	588064	588069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974120
11571	NC_016843	CAA	2	6	588086	588091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974120
11572	NC_016843	CCA	2	6	588134	588139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378974120
11573	NC_016843	GT	3	6	588149	588154	0 %	50 %	50 %	0 %	378974120
11574	NC_016843	GC	3	6	588183	588188	0 %	0 %	50 %	50 %	378974120
11575	NC_016843	T	6	6	588193	588198	0 %	100 %	0 %	0 %	378974120
11576	NC_016843	TGTTCC	2	12	588243	588254	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378974120
11577	NC_016843	CGGTA	2	10	588293	588302	20 %	20 %	40 %	20 %	378974120
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11582	NC_016843	CAA	2	6	588512	588517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378974120
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11584	NC_016843	AGA	2	6	588732	588737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974120
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11587	NC_016843	AGGAC	2	10	588850	588859	40 %	0 %	40 %	20 %	378974120
11588	NC_016843	TCC	2	6	588885	588890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378974120
11589	NC_016843	AGG	2	6	588928	588933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378974120
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11592	NC_016843	CCACG	2	10	589373	589382	20 %	0 %	20 %	60 %	378974120
11593	NC_016843	CACG	2	8	589388	589395	25 %	0 %	25 %	50 %	378974120
11594	NC_016843	CGC	2	6	589461	589466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974120
11595	NC_016843	CACG	2	8	589509	589516	25 %	0 %	25 %	50 %	378974120
11596	NC_016843	CA	4	8	589624	589631	50 %	0 %	0 %	50 %	378974121
11597	NC_016843	CG	3	6	589659	589664	0 %	0 %	50 %	50 %	378974121
11598	NC_016843	TGCG	2	8	589683	589690	0 %	25 %	50 %	25 %	378974121
11599	NC_016843	CAAA	2	8	589745	589752	75 %	0 %	0 %	25 %	378974121
11600	NC_016843	A	7	7	589884	589890	100 %	0 %	0 %	0 %	378974121
11601	NC_016843	GT	4	8	589968	589975	0 %	50 %	50 %	0 %	378974121
11602	NC_016843	TC	3	6	590062	590067	0 %	50 %	0 %	50 %	378974121
11603	NC_016843	AC	3	6	590076	590081	50 %	0 %	0 %	50 %	378974121
11604	NC_016843	ATA	2	6	590143	590148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378974121
11605	NC_016843	GCA	2	6	590210	590215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378974121
11606	NC_016843	TCG	2	6	590224	590229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974121
11607	NC_016843	GAA	2	6	590295	590300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378974121
11608	NC_016843	GC	3	6	590313	590318	0 %	0 %	50 %	50 %	378974121
11609	NC_016843	CTG	2	6	590319	590324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974121
11610	NC_016843	GC	3	6	590343	590348	0 %	0 %	50 %	50 %	378974121
11611	NC_016843	CGC	2	6	590387	590392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378974121
11612	NC_016843	GC	3	6	590391	590396	0 %	0 %	50 %	50 %	378974121
11613	NC_016843	T	6	6	590469	590474	0 %	100 %	0 %	0 %	378974121
11614	NC_016843	AG	3	6	590484	590489	50 %	0 %	50 %	0 %	378974121
11615	NC_016843	GC	3	6	590502	590507	0 %	0 %	50 %	50 %	378974121
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11618	NC_016843	AC	3	6	590605	590610	50 %	0 %	0 %	50 %	378974121
11619	NC_016843	GGAT	2	8	590721	590728	25 %	25 %	50 %	0 %	378974122
11620	NC_016843	TGC	2	6	590736	590741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378974122
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