MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. Gauthier chromosome

Total Repeats: 22493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_016843	CAA	2	6	295593	295598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378973854
5503	NC_016843	CAT	2	6	295608	295613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378973854
5504	NC_016843	CTC	2	6	295617	295622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378973854
5505	NC_016843	AGA	2	6	295632	295637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973854
5506	NC_016843	TGA	2	6	295651	295656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378973854
5507	NC_016843	GC	3	6	295676	295681	0 %	0 %	50 %	50 %	378973854
5508	NC_016843	CTG	2	6	295742	295747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973854
5509	NC_016843	ACG	2	6	295874	295879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973854
5510	NC_016843	CGT	2	6	295943	295948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378973854
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5512	NC_016843	GC	4	8	295999	296006	0 %	0 %	50 %	50 %	378973854
5513	NC_016843	GC	3	6	296024	296029	0 %	0 %	50 %	50 %	378973854
5514	NC_016843	G	7	7	296035	296041	0 %	0 %	100 %	0 %	378973854
5515	NC_016843	CTT	2	6	296076	296081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378973854
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5517	NC_016843	CG	4	8	296113	296120	0 %	0 %	50 %	50 %	378973854
5518	NC_016843	GAG	2	6	296145	296150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973854
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5521	NC_016843	GCC	2	6	296344	296349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378973854
5522	NC_016843	AGTTA	2	10	296443	296452	40 %	40 %	20 %	0 %	378973854
5523	NC_016843	CGTC	2	8	296494	296501	0 %	25 %	25 %	50 %	378973854
5524	NC_016843	AGA	2	6	296511	296516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378973854
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5532	NC_016843	CG	3	6	296874	296879	0 %	0 %	50 %	50 %	378973854
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5543	NC_016843	G	6	6	297807	297812	0 %	0 %	100 %	0 %	378973854
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5546	NC_016843	CATG	2	8	298130	298137	25 %	25 %	25 %	25 %	378973855
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5551	NC_016843	CG	4	8	298269	298276	0 %	0 %	50 %	50 %	378973855
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5556	NC_016843	CAG	2	6	298524	298529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378973855
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5558	NC_016843	GAG	2	6	298626	298631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973855
5559	NC_016843	CT	3	6	298690	298695	0 %	50 %	0 %	50 %	378973855
5560	NC_016843	GC	3	6	298727	298732	0 %	0 %	50 %	50 %	378973855
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5563	NC_016843	GCG	2	6	298791	298796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973855
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5565	NC_016843	AGG	2	6	298849	298854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378973855
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5571	NC_016843	TACG	2	8	299246	299253	25 %	25 %	25 %	25 %	378973856
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5594	NC_016843	GC	3	6	300749	300754	0 %	0 %	50 %	50 %	378973857
5595	NC_016843	GT	3	6	300825	300830	0 %	50 %	50 %	0 %	378973857
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5622	NC_016843	A	7	7	302175	302181	100 %	0 %	0 %	0 %	378973858
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5998	NC_016843	GCG	2	6	318801	318806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378973872
5999	NC_016843	T	7	7	318808	318814	0 %	100 %	0 %	0 %	378973872
6000	NC_016843	GC	3	6	318930	318935	0 %	0 %	50 %	50 %	378973872

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