MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_016842	TTA	2	6	206492	206497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378972695
4003	NC_016842	TGAGT	2	10	206510	206519	20 %	40 %	40 %	0 %	378972695
4004	NC_016842	CGC	2	6	206613	206618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378972695
4005	NC_016842	AAG	2	6	206625	206630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972695
4006	NC_016842	TGG	2	6	206641	206646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972695
4007	NC_016842	G	6	6	206645	206650	0 %	0 %	100 %	0 %	378972695
4008	NC_016842	GAA	2	6	206699	206704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972695
4009	NC_016842	TC	3	6	206727	206732	0 %	50 %	0 %	50 %	378972695
4010	NC_016842	ATG	3	9	206866	206874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972695
4011	NC_016842	GTT	2	6	206876	206881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972695
4012	NC_016842	T	6	6	206915	206920	0 %	100 %	0 %	0 %	378972695
4013	NC_016842	GC	4	8	206936	206943	0 %	0 %	50 %	50 %	378972695
4014	NC_016842	TGC	2	6	207023	207028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972695
4015	NC_016842	AATG	2	8	207198	207205	50 %	25 %	25 %	0 %	378972696
4016	NC_016842	GAA	2	6	207213	207218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972696
4017	NC_016842	GAA	2	6	207258	207263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972696
4018	NC_016842	GCA	2	6	207280	207285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972696
4019	NC_016842	CGG	2	6	207402	207407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378972697
4020	NC_016842	CG	3	6	207448	207453	0 %	0 %	50 %	50 %	378972697
4021	NC_016842	TA	3	6	207680	207685	50 %	50 %	0 %	0 %	378972697
4022	NC_016842	CAG	2	6	207713	207718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972697
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4025	NC_016842	CG	3	6	207835	207840	0 %	0 %	50 %	50 %	378972697
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4031	NC_016842	TGG	2	6	208344	208349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972698
4032	NC_016842	GGA	2	6	208402	208407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378972698
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4037	NC_016842	TGA	2	6	208707	208712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972699
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4040	NC_016842	TGT	2	6	208827	208832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972699
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4043	NC_016842	TGC	2	6	208953	208958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972700
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4050	NC_016842	GAT	2	6	209479	209484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972700
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4053	NC_016842	CGA	2	6	209572	209577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972700
4054	NC_016842	GA	3	6	209591	209596	50 %	0 %	50 %	0 %	378972700
4055	NC_016842	GT	3	6	209711	209716	0 %	50 %	50 %	0 %	378972701
4056	NC_016842	AAG	2	6	209834	209839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972701
4057	NC_016842	AAAGG	2	10	209861	209870	60 %	0 %	40 %	0 %	378972701
4058	NC_016842	GTA	2	6	209894	209899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972701
4059	NC_016842	CTGTT	2	10	209910	209919	0 %	60 %	20 %	20 %	378972701
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4061	NC_016842	CTT	2	6	210079	210084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378972702
4062	NC_016842	CGT	2	6	210091	210096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972702
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4064	NC_016842	TTG	3	9	210134	210142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972702
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4070	NC_016842	GCG	2	6	210287	210292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378972703
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4084	NC_016842	AAG	2	6	211148	211153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972705
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4091	NC_016842	GTA	2	6	211523	211528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972706
4092	NC_016842	TCA	2	6	211553	211558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378972706
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4094	NC_016842	CAGA	2	8	211726	211733	50 %	0 %	25 %	25 %	378972706
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4096	NC_016842	CTT	2	6	211750	211755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378972706
4097	NC_016842	AG	3	6	211785	211790	50 %	0 %	50 %	0 %	378972706
4098	NC_016842	TACGC	2	10	211842	211851	20 %	20 %	20 %	40 %	378972707
4099	NC_016842	GT	3	6	211872	211877	0 %	50 %	50 %	0 %	378972707
4100	NC_016842	GAG	2	6	211898	211903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378972707
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4102	NC_016842	GCGA	2	8	211938	211945	25 %	0 %	50 %	25 %	378972707
4103	NC_016842	CTT	2	6	212080	212085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378972708
4104	NC_016842	AT	3	6	212129	212134	50 %	50 %	0 %	0 %	378972708
4105	NC_016842	AGG	2	6	212155	212160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378972708
4106	NC_016842	GT	3	6	212179	212184	0 %	50 %	50 %	0 %	378972708
4107	NC_016842	GCC	2	6	212248	212253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378972708
4108	NC_016842	GT	3	6	212254	212259	0 %	50 %	50 %	0 %	378972708
4109	NC_016842	TCG	2	6	212279	212284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972708
4110	NC_016842	CT	3	6	212321	212326	0 %	50 %	0 %	50 %	378972708
4111	NC_016842	GGCA	2	8	212340	212347	25 %	0 %	50 %	25 %	378972708
4112	NC_016842	AGC	2	6	212356	212361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972708
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4114	NC_016842	TCT	2	6	212463	212468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378972709
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4118	NC_016842	GC	4	8	212582	212589	0 %	0 %	50 %	50 %	378972709
4119	NC_016842	GTAA	2	8	212811	212818	50 %	25 %	25 %	0 %	378972709
4120	NC_016842	TAAGGG	2	12	212876	212887	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378972709
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4123	NC_016842	TCT	2	6	213167	213172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378972710
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4495	NC_016842	CCT	2	6	237773	237778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378972735
4496	NC_016842	A	6	6	237780	237785	100 %	0 %	0 %	0 %	378972735
4497	NC_016842	CAA	2	6	237850	237855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378972735
4498	NC_016842	CAA	2	6	237957	237962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378972735
4499	NC_016842	TAC	2	6	237975	237980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378972735
4500	NC_016842	AG	4	8	238234	238241	50 %	0 %	50 %	0 %	378972736

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