MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_016842	GCA	2	6	181293	181298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972669
3503	NC_016842	GC	4	8	181323	181330	0 %	0 %	50 %	50 %	378972669
3504	NC_016842	GAAA	2	8	181370	181377	75 %	0 %	25 %	0 %	378972669
3505	NC_016842	CGTG	2	8	181444	181451	0 %	25 %	50 %	25 %	378972669
3506	NC_016842	AAG	2	6	181520	181525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972669
3507	NC_016842	GCT	3	9	181581	181589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972669
3508	NC_016842	AAG	2	6	181626	181631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972669
3509	NC_016842	TG	3	6	181661	181666	0 %	50 %	50 %	0 %	378972669
3510	NC_016842	CAA	2	6	181695	181700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378972669
3511	NC_016842	GT	4	8	181703	181710	0 %	50 %	50 %	0 %	378972669
3512	NC_016842	GGTGA	2	10	181796	181805	20 %	20 %	60 %	0 %	378972669
3513	NC_016842	CAG	2	6	181891	181896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972669
3514	NC_016842	GT	3	6	181907	181912	0 %	50 %	50 %	0 %	378972669
3515	NC_016842	CGT	2	6	181914	181919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972669
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3518	NC_016842	CTT	2	6	182239	182244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378972670
3519	NC_016842	A	7	7	182249	182255	100 %	0 %	0 %	0 %	378972670
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3521	NC_016842	CG	3	6	182290	182295	0 %	0 %	50 %	50 %	378972670
3522	NC_016842	ATC	2	6	182381	182386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378972670
3523	NC_016842	CTG	3	9	182434	182442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972670
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3529	NC_016842	T	7	7	182688	182694	0 %	100 %	0 %	0 %	378972670
3530	NC_016842	GC	3	6	182733	182738	0 %	0 %	50 %	50 %	378972670
3531	NC_016842	A	7	7	182872	182878	100 %	0 %	0 %	0 %	378972670
3532	NC_016842	CAG	2	6	182908	182913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972670
3533	NC_016842	GAA	2	6	182921	182926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972670
3534	NC_016842	GCA	2	6	182955	182960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972670
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3542	NC_016842	GC	3	6	183524	183529	0 %	0 %	50 %	50 %	378972670
3543	NC_016842	TG	3	6	183545	183550	0 %	50 %	50 %	0 %	378972670
3544	NC_016842	CG	5	10	183580	183589	0 %	0 %	50 %	50 %	378972670
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3554	NC_016842	TGG	2	6	183969	183974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972670
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3557	NC_016842	AAG	2	6	184148	184153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972671
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3559	NC_016842	CG	3	6	184227	184232	0 %	0 %	50 %	50 %	378972671
3560	NC_016842	G	6	6	184249	184254	0 %	0 %	100 %	0 %	378972671
3561	NC_016842	GTA	2	6	184292	184297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972671
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3591	NC_016842	AC	3	6	186258	186263	50 %	0 %	0 %	50 %	378972672
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3595	NC_016842	ACG	2	6	186365	186370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972673
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3603	NC_016842	CGCAG	2	10	186700	186709	20 %	0 %	40 %	40 %	378972674
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3606	NC_016842	CAG	3	9	186888	186896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972674
3607	NC_016842	CG	3	6	186908	186913	0 %	0 %	50 %	50 %	378972674
3608	NC_016842	TTG	2	6	187036	187041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972674
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3614	NC_016842	AGG	2	6	187204	187209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378972674
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3621	NC_016842	GGC	2	6	187584	187589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378972675
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3995	NC_016842	CCG	2	6	205973	205978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378972694
3996	NC_016842	TG	4	8	206074	206081	0 %	50 %	50 %	0 %	378972694
3997	NC_016842	CT	3	6	206082	206087	0 %	50 %	0 %	50 %	378972694
3998	NC_016842	AAAAGG	2	12	206089	206100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972694
3999	NC_016842	AGT	2	6	206110	206115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972694
4000	NC_016842	GCGGT	2	10	206316	206325	0 %	20 %	60 %	20 %	378972694

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