MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_016842	CG	5	10	105022	105031	0 %	0 %	50 %	50 %	378972598
2003	NC_016842	GA	3	6	105107	105112	50 %	0 %	50 %	0 %	378972598
2004	NC_016842	GGT	2	6	105120	105125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972598
2005	NC_016842	GCG	2	6	105131	105136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378972598
2006	NC_016842	A	6	6	105206	105211	100 %	0 %	0 %	0 %	378972598
2007	NC_016842	CAGG	2	8	105223	105230	25 %	0 %	50 %	25 %	378972598
2008	NC_016842	GCAG	2	8	105319	105326	25 %	0 %	50 %	25 %	378972598
2009	NC_016842	GCT	2	6	105340	105345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972598
2010	NC_016842	GTGCT	2	10	105401	105410	0 %	40 %	40 %	20 %	378972598
2011	NC_016842	AC	3	6	105412	105417	50 %	0 %	0 %	50 %	378972598
2012	NC_016842	CG	3	6	105449	105454	0 %	0 %	50 %	50 %	378972598
2013	NC_016842	AGCG	2	8	105484	105491	25 %	0 %	50 %	25 %	378972598
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2022	NC_016842	CTA	2	6	105929	105934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378972599
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2033	NC_016842	GC	3	6	106595	106600	0 %	0 %	50 %	50 %	378972601
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2039	NC_016842	TG	4	8	106738	106745	0 %	50 %	50 %	0 %	378972601
2040	NC_016842	GC	3	6	106754	106759	0 %	0 %	50 %	50 %	378972601
2041	NC_016842	GCGTC	2	10	106809	106818	0 %	20 %	40 %	40 %	378972601
2042	NC_016842	AG	3	6	106886	106891	50 %	0 %	50 %	0 %	378972601
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2048	NC_016842	TGG	2	6	107080	107085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972602
2049	NC_016842	T	6	6	107169	107174	0 %	100 %	0 %	0 %	378972602
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2055	NC_016842	ACCTG	2	10	107424	107433	20 %	20 %	20 %	40 %	378972602
2056	NC_016842	A	6	6	107434	107439	100 %	0 %	0 %	0 %	378972602
2057	NC_016842	CGC	2	6	107444	107449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378972602
2058	NC_016842	AGC	2	6	107502	107507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972602
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2109	NC_016842	TCG	2	6	110254	110259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972605
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2125	NC_016842	TCA	2	6	111094	111099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378972605
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2127	NC_016842	GC	3	6	111312	111317	0 %	0 %	50 %	50 %	378972605
2128	NC_016842	CG	3	6	111326	111331	0 %	0 %	50 %	50 %	378972605
2129	NC_016842	AG	3	6	111414	111419	50 %	0 %	50 %	0 %	378972605
2130	NC_016842	GATG	2	8	111513	111520	25 %	25 %	50 %	0 %	378972606
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2499	NC_016842	GGT	2	6	130658	130663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972617
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