MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016842	CAA	2	6	80249	80254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378972574
1502	NC_016842	CA	3	6	80267	80272	50 %	0 %	0 %	50 %	378972574
1503	NC_016842	ACA	2	6	80305	80310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378972574
1504	NC_016842	CG	3	6	80311	80316	0 %	0 %	50 %	50 %	378972574
1505	NC_016842	TTG	2	6	80374	80379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972575
1506	NC_016842	GTT	2	6	80649	80654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972576
1507	NC_016842	GTG	2	6	80660	80665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972576
1508	NC_016842	TGC	2	6	80680	80685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972576
1509	NC_016842	TGT	2	6	80690	80695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972576
1510	NC_016842	CGTGT	2	10	80702	80711	0 %	40 %	40 %	20 %	378972576
1511	NC_016842	CTT	2	6	80720	80725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378972576
1512	NC_016842	GGC	2	6	80786	80791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378972576
1513	NC_016842	GT	3	6	80815	80820	0 %	50 %	50 %	0 %	378972576
1514	NC_016842	CTT	2	6	80834	80839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378972576
1515	NC_016842	GC	3	6	80917	80922	0 %	0 %	50 %	50 %	378972576
1516	NC_016842	GTG	2	6	80960	80965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972576
1517	NC_016842	CG	3	6	81014	81019	0 %	0 %	50 %	50 %	378972576
1518	NC_016842	T	6	6	81043	81048	0 %	100 %	0 %	0 %	378972576
1519	NC_016842	ATG	2	6	81257	81262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972576
1520	NC_016842	CG	3	6	81295	81300	0 %	0 %	50 %	50 %	378972576
1521	NC_016842	CAG	2	6	81337	81342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972576
1522	NC_016842	TAC	2	6	81359	81364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378972576
1523	NC_016842	CGC	2	6	81366	81371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378972576
1524	NC_016842	GTGC	2	8	81643	81650	0 %	25 %	50 %	25 %	378972576
1525	NC_016842	GGC	2	6	81661	81666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378972576
1526	NC_016842	CA	3	6	81683	81688	50 %	0 %	0 %	50 %	378972576
1527	NC_016842	TGC	2	6	81693	81698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972576
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1530	NC_016842	G	6	6	81896	81901	0 %	0 %	100 %	0 %	378972576
1531	NC_016842	GTGA	2	8	81949	81956	25 %	25 %	50 %	0 %	378972576
1532	NC_016842	TGC	2	6	81983	81988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972576
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1534	NC_016842	CGT	2	6	82006	82011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972576
1535	NC_016842	CGCA	2	8	82016	82023	25 %	0 %	25 %	50 %	378972576
1536	NC_016842	T	7	7	82276	82282	0 %	100 %	0 %	0 %	378972577
1537	NC_016842	ACG	2	6	82382	82387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972577
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1539	NC_016842	T	7	7	82477	82483	0 %	100 %	0 %	0 %	378972577
1540	NC_016842	GAT	3	9	82504	82512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972577
1541	NC_016842	GTG	3	9	82520	82528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972577
1542	NC_016842	TG	3	6	82660	82665	0 %	50 %	50 %	0 %	378972577
1543	NC_016842	TTGC	2	8	82694	82701	0 %	50 %	25 %	25 %	378972577
1544	NC_016842	GCG	2	6	82736	82741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378972577
1545	NC_016842	TCC	2	6	82824	82829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378972577
1546	NC_016842	TGG	2	6	82879	82884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972577
1547	NC_016842	GAG	2	6	83029	83034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378972577
1548	NC_016842	T	7	7	83097	83103	0 %	100 %	0 %	0 %	378972578
1549	NC_016842	CT	3	6	83166	83171	0 %	50 %	0 %	50 %	378972578
1550	NC_016842	CTT	2	6	83187	83192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378972578
1551	NC_016842	GCC	2	6	83221	83226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378972578
1552	NC_016842	T	6	6	83234	83239	0 %	100 %	0 %	0 %	378972578
1553	NC_016842	CAA	2	6	83244	83249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378972578
1554	NC_016842	CAT	2	6	83279	83284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378972578
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1556	NC_016842	GGT	2	6	83332	83337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972578
1557	NC_016842	GCA	2	6	83357	83362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972578
1558	NC_016842	ATGCA	2	10	83367	83376	40 %	20 %	20 %	20 %	378972578
1559	NC_016842	GTT	2	6	83416	83421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972578
1560	NC_016842	CCG	2	6	83438	83443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378972578
1561	NC_016842	TG	3	6	83467	83472	0 %	50 %	50 %	0 %	378972578
1562	NC_016842	TG	3	6	83548	83553	0 %	50 %	50 %	0 %	378972578
1563	NC_016842	TTG	2	6	83568	83573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378972578
1564	NC_016842	TGGA	2	8	83610	83617	25 %	25 %	50 %	0 %	378972578
1565	NC_016842	GAT	2	6	83629	83634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972578
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1567	NC_016842	CACTTT	2	12	83769	83780	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	378972578
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1569	NC_016842	GCA	3	9	83819	83827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972578
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1573	NC_016842	TGTA	2	8	84005	84012	25 %	50 %	25 %	0 %	378972579
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1575	NC_016842	GGGT	2	8	84023	84030	0 %	25 %	75 %	0 %	378972579
1576	NC_016842	GA	4	8	84066	84073	50 %	0 %	50 %	0 %	378972579
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1584	NC_016842	GA	3	6	84605	84610	50 %	0 %	50 %	0 %	378972579
1585	NC_016842	A	7	7	84631	84637	100 %	0 %	0 %	0 %	378972579
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1596	NC_016842	GGAGTA	2	12	85171	85182	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378972579
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1599	NC_016842	CAGA	2	8	85271	85278	50 %	0 %	25 %	25 %	378972579
1600	NC_016842	CGTGAA	2	12	85390	85401	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378972579
1601	NC_016842	AAG	2	6	85490	85495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972579
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1603	NC_016842	TGA	2	6	85609	85614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972580
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1606	NC_016842	T	6	6	85652	85657	0 %	100 %	0 %	0 %	378972580
1607	NC_016842	GC	3	6	85684	85689	0 %	0 %	50 %	50 %	378972580
1608	NC_016842	GGAT	2	8	85712	85719	25 %	25 %	50 %	0 %	378972580
1609	NC_016842	ACG	2	6	85721	85726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972580
1610	NC_016842	GGT	2	6	85921	85926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972580
1611	NC_016842	GT	3	6	85969	85974	0 %	50 %	50 %	0 %	378972580
1612	NC_016842	A	6	6	85987	85992	100 %	0 %	0 %	0 %	378972580
1613	NC_016842	GC	3	6	85997	86002	0 %	0 %	50 %	50 %	378972580
1614	NC_016842	CCAT	2	8	86019	86026	25 %	25 %	0 %	50 %	378972580
1615	NC_016842	GTG	2	6	86090	86095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378972580
1616	NC_016842	GCA	2	6	86102	86107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972580
1617	NC_016842	CCA	2	6	86181	86186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378972580
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1619	NC_016842	AGG	2	6	86206	86211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378972580
1620	NC_016842	ATG	2	6	86226	86231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972580
1621	NC_016842	GCACC	2	10	86307	86316	20 %	0 %	20 %	60 %	378972580
1622	NC_016842	AGC	2	6	86371	86376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972580
1623	NC_016842	GGC	2	6	86401	86406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378972580
1624	NC_016842	CG	4	8	86423	86430	0 %	0 %	50 %	50 %	378972580
1625	NC_016842	GCC	2	6	86435	86440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378972580
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