MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pertenue str. SamoaD chromosome

Total Repeats: 22495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_016842	GTC	2	6	295130	295135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972787
5503	NC_016842	GC	3	6	295154	295159	0 %	0 %	50 %	50 %	378972787
5504	NC_016842	TTCT	2	8	295176	295183	0 %	75 %	0 %	25 %	378972787
5505	NC_016842	CGC	2	6	295200	295205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378972787
5506	NC_016842	GCG	2	6	295264	295269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378972787
5507	NC_016842	CAA	2	6	295295	295300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378972787
5508	NC_016842	CAT	2	6	295310	295315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378972787
5509	NC_016842	CTC	2	6	295319	295324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378972787
5510	NC_016842	AGA	2	6	295334	295339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378972787
5511	NC_016842	TGA	2	6	295353	295358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972787
5512	NC_016842	GC	3	6	295378	295383	0 %	0 %	50 %	50 %	378972787
5513	NC_016842	CTG	2	6	295444	295449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972787
5514	NC_016842	ACG	2	6	295576	295581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972787
5515	NC_016842	CGT	2	6	295645	295650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972787
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5517	NC_016842	GC	4	8	295701	295708	0 %	0 %	50 %	50 %	378972787
5518	NC_016842	GC	3	6	295726	295731	0 %	0 %	50 %	50 %	378972787
5519	NC_016842	G	7	7	295737	295743	0 %	0 %	100 %	0 %	378972787
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5523	NC_016842	GAG	2	6	295847	295852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378972787
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5527	NC_016842	AGTTA	2	10	296145	296154	40 %	40 %	20 %	0 %	378972787
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5542	NC_016842	GAT	2	6	297064	297069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378972787
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5554	NC_016842	TCG	2	6	297909	297914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378972788
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5556	NC_016842	CG	4	8	297971	297978	0 %	0 %	50 %	50 %	378972788
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5561	NC_016842	CAG	2	6	298226	298231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378972788
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5563	NC_016842	GAG	2	6	298328	298333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378972788
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5565	NC_016842	GC	3	6	298429	298434	0 %	0 %	50 %	50 %	378972788
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5999	NC_016842	GC	3	6	318393	318398	0 %	0 %	50 %	50 %	378972805
6000	NC_016842	GCC	2	6	318400	318405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378972805

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