MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tannerella forsythia ATCC 43037 chromosome

Total Repeats: 58687

< Previous12...106107108109110111112113114115116117118Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_016610	GCT	2	6	3392810	3392815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256805
58502	NC_016610	CATC	2	8	3392953	3392960	25 %	25 %	0 %	50 %	375256805
58503	NC_016610	GAC	2	6	3393043	3393048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256805
58504	NC_016610	G	8	8	3393081	3393088	0 %	0 %	100 %	0 %	375256805
58505	NC_016610	TCGT	2	8	3393178	3393185	0 %	50 %	25 %	25 %	375256806
58506	NC_016610	A	7	7	3393249	3393255	100 %	0 %	0 %	0 %	375256806
58507	NC_016610	GCT	2	6	3393299	3393304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256806
58508	NC_016610	CGA	2	6	3393496	3393501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256806
58509	NC_016610	GCC	2	6	3393591	3393596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375256806
58510	NC_016610	GGTGA	2	10	3393615	3393624	20 %	20 %	60 %	0 %	375256806
58511	NC_016610	CGT	2	6	3393627	3393632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256806
58512	NC_016610	CGA	2	6	3393644	3393649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256806
58513	NC_016610	TGC	2	6	3393709	3393714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256806
58514	NC_016610	CTG	2	6	3393738	3393743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256806
58515	NC_016610	ACAAA	2	10	3393869	3393878	80 %	0 %	0 %	20 %	375256806
58516	NC_016610	GGC	2	6	3393967	3393972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375256806
58517	NC_016610	CAT	2	6	3394034	3394039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375256806
58518	NC_016610	AGG	2	6	3394096	3394101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375256806
58519	NC_016610	TCA	2	6	3394105	3394110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375256806
58520	NC_016610	CACGGG	2	12	3394173	3394184	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	375256806
58521	NC_016610	CTG	2	6	3394235	3394240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256806
58522	NC_016610	TAC	2	6	3394407	3394412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375256806
58523	NC_016610	ATC	2	6	3394437	3394442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375256806
58524	NC_016610	CCATCG	2	12	3394444	3394455	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	375256806
58525	NC_016610	CGA	2	6	3394504	3394509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256806
58526	NC_016610	AGG	2	6	3394549	3394554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375256806
58527	NC_016610	GC	3	6	3394643	3394648	0 %	0 %	50 %	50 %	375256806
58528	NC_016610	AGA	2	6	3394954	3394959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256806
58529	NC_016610	TGA	2	6	3395009	3395014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256807
58530	NC_016610	CCGG	2	8	3395080	3395087	0 %	0 %	50 %	50 %	375256807
58531	NC_016610	T	6	6	3395163	3395168	0 %	100 %	0 %	0 %	375256807
58532	NC_016610	T	7	7	3395225	3395231	0 %	100 %	0 %	0 %	375256807
58533	NC_016610	TGA	2	6	3395336	3395341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256807
58534	NC_016610	CTG	2	6	3395389	3395394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256807
58535	NC_016610	T	6	6	3395533	3395538	0 %	100 %	0 %	0 %	375256807
58536	NC_016610	ATG	2	6	3395563	3395568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256807
58537	NC_016610	TTG	2	6	3395597	3395602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375256807
58538	NC_016610	TCA	3	9	3395615	3395623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375256807
58539	NC_016610	CAT	2	6	3395670	3395675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375256807
58540	NC_016610	GCA	2	6	3395692	3395697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256807
58541	NC_016610	CGG	2	6	3395703	3395708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375256807
58542	NC_016610	CTG	2	6	3395710	3395715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256807
58543	NC_016610	TGCTGA	2	12	3395777	3395788	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375256807
58544	NC_016610	TTTC	2	8	3395791	3395798	0 %	75 %	0 %	25 %	375256807
58545	NC_016610	ATCG	2	8	3395850	3395857	25 %	25 %	25 %	25 %	375256807
58546	NC_016610	TCA	2	6	3395904	3395909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375256807
58547	NC_016610	CAA	2	6	3395911	3395916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375256807
58548	NC_016610	AGA	2	6	3395940	3395945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256807
58549	NC_016610	CGGG	2	8	3395951	3395958	0 %	0 %	75 %	25 %	375256807
58550	NC_016610	CTG	2	6	3396007	3396012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256807
58551	NC_016610	GAACG	2	10	3396027	3396036	40 %	0 %	40 %	20 %	375256807
58552	NC_016610	GTTC	2	8	3396116	3396123	0 %	50 %	25 %	25 %	375256807
58553	NC_016610	GAT	2	6	3396147	3396152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256807
58554	NC_016610	TTC	2	6	3396232	3396237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375256807
58555	NC_016610	TTC	2	6	3396301	3396306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375256807
58556	NC_016610	G	6	6	3396313	3396318	0 %	0 %	100 %	0 %	375256807
58557	NC_016610	TCG	2	6	3396319	3396324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256807
58558	NC_016610	ACG	2	6	3396375	3396380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256807
58559	NC_016610	T	6	6	3396498	3396503	0 %	100 %	0 %	0 %	375256808
58560	NC_016610	ATT	2	6	3396517	3396522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375256808
58561	NC_016610	GAA	2	6	3396658	3396663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256808
58562	NC_016610	ACG	2	6	3396680	3396685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256808
58563	NC_016610	CGT	2	6	3396730	3396735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256808
58564	NC_016610	TA	3	6	3396791	3396796	50 %	50 %	0 %	0 %	375256808
58565	NC_016610	ACAAT	2	10	3396837	3396846	60 %	20 %	0 %	20 %	375256808
58566	NC_016610	GCT	2	6	3396861	3396866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256808
58567	NC_016610	ACG	2	6	3397010	3397015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256808
58568	NC_016610	ACG	2	6	3397073	3397078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256808
58569	NC_016610	TTC	2	6	3397090	3397095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375256808
58570	NC_016610	GAG	2	6	3397187	3397192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375256808
58571	NC_016610	CGG	2	6	3397193	3397198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375256808
58572	NC_016610	CA	3	6	3397212	3397217	50 %	0 %	0 %	50 %	375256808
58573	NC_016610	GAT	2	6	3397407	3397412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256808
58574	NC_016610	CCAT	2	8	3397535	3397542	25 %	25 %	0 %	50 %	375256808
58575	NC_016610	GAAT	2	8	3397568	3397575	50 %	25 %	25 %	0 %	375256808
58576	NC_016610	AAC	2	6	3397601	3397606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375256808
58577	NC_016610	CGA	2	6	3397650	3397655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256808
58578	NC_016610	GGAA	2	8	3397793	3397800	50 %	0 %	50 %	0 %	375256808
58579	NC_016610	GAT	2	6	3397885	3397890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256808
58580	NC_016610	CGA	2	6	3397946	3397951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256808
58581	NC_016610	TGA	2	6	3397988	3397993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256808
58582	NC_016610	GAC	2	6	3398001	3398006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256808
58583	NC_016610	TTC	2	6	3398023	3398028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375256808
58584	NC_016610	GAA	2	6	3398055	3398060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256808
58585	NC_016610	TTG	2	6	3398170	3398175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375256808
58586	NC_016610	CGT	2	6	3398414	3398419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256809
58587	NC_016610	AGC	2	6	3398577	3398582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256809
58588	NC_016610	ATC	2	6	3398717	3398722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375256809
58589	NC_016610	CAA	2	6	3398827	3398832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375256809
58590	NC_016610	CGT	2	6	3398844	3398849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256809
58591	NC_016610	GAA	2	6	3398890	3398895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256809
58592	NC_016610	GAT	2	6	3399151	3399156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256809
58593	NC_016610	CAAA	2	8	3399399	3399406	75 %	0 %	0 %	25 %	375256810
58594	NC_016610	TGC	2	6	3399446	3399451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256810
58595	NC_016610	GGTT	2	8	3399484	3399491	0 %	50 %	50 %	0 %	375256810
58596	NC_016610	GAG	2	6	3399517	3399522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375256810
58597	NC_016610	ATCGGT	2	12	3399580	3399591	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	375256810
58598	NC_016610	GTC	2	6	3399616	3399621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256810
58599	NC_016610	ACA	2	6	3399632	3399637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375256810
58600	NC_016610	CAT	2	6	3399756	3399761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375256810
58601	NC_016610	ACA	2	6	3399781	3399786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375256810
58602	NC_016610	GAA	2	6	3399816	3399821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256810
58603	NC_016610	AAAC	2	8	3399830	3399837	75 %	0 %	0 %	25 %	375256810
58604	NC_016610	GAA	2	6	3399847	3399852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256810
58605	NC_016610	G	6	6	3399890	3399895	0 %	0 %	100 %	0 %	375256810
58606	NC_016610	AAGG	2	8	3399916	3399923	50 %	0 %	50 %	0 %	375256810
58607	NC_016610	GCTT	2	8	3399986	3399993	0 %	50 %	25 %	25 %	375256810
58608	NC_016610	A	7	7	3400138	3400144	100 %	0 %	0 %	0 %	375256810
58609	NC_016610	CTACA	2	10	3400174	3400183	40 %	20 %	0 %	40 %	375256810
58610	NC_016610	TGG	2	6	3400192	3400197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375256810
58611	NC_016610	GGAC	2	8	3400386	3400393	25 %	0 %	50 %	25 %	375256810
58612	NC_016610	CGA	2	6	3400419	3400424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256810
58613	NC_016610	CAA	2	6	3400428	3400433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375256810
58614	NC_016610	CTA	2	6	3400515	3400520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375256810
58615	NC_016610	GTT	2	6	3400530	3400535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375256810
58616	NC_016610	TTC	2	6	3400540	3400545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375256810
58617	NC_016610	A	8	8	3400618	3400625	100 %	0 %	0 %	0 %	375256810
58618	NC_016610	AAAG	2	8	3400660	3400667	75 %	0 %	25 %	0 %	375256810
58619	NC_016610	A	6	6	3400681	3400686	100 %	0 %	0 %	0 %	375256810
58620	NC_016610	GTA	2	6	3400815	3400820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256811
58621	NC_016610	TTA	2	6	3400830	3400835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375256811
58622	NC_016610	CTC	2	6	3400924	3400929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375256811
58623	NC_016610	CTG	2	6	3400934	3400939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256811
58624	NC_016610	A	6	6	3400977	3400982	100 %	0 %	0 %	0 %	375256811
58625	NC_016610	TAT	2	6	3401136	3401141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375256811
58626	NC_016610	GTA	2	6	3401218	3401223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256811
58627	NC_016610	AG	3	6	3401305	3401310	50 %	0 %	50 %	0 %	375256811
58628	NC_016610	ACC	2	6	3401321	3401326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375256811
58629	NC_016610	A	6	6	3401417	3401422	100 %	0 %	0 %	0 %	375256811
58630	NC_016610	C	7	7	3401536	3401542	0 %	0 %	0 %	100 %	375256811
58631	NC_016610	GTT	2	6	3401586	3401591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375256811
58632	NC_016610	TCC	2	6	3401617	3401622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375256811
58633	NC_016610	TTTGC	2	10	3401736	3401745	0 %	60 %	20 %	20 %	375256811
58634	NC_016610	AACG	2	8	3401777	3401784	50 %	0 %	25 %	25 %	375256811
58635	NC_016610	ACC	2	6	3401814	3401819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375256811
58636	NC_016610	CGA	2	6	3401887	3401892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256811
58637	NC_016610	CGT	2	6	3401946	3401951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256811
58638	NC_016610	TTC	2	6	3401952	3401957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375256811
58639	NC_016610	TTG	2	6	3402097	3402102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375256811
58640	NC_016610	TTA	2	6	3402134	3402139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375256811
58641	NC_016610	ATATA	2	10	3402224	3402233	60 %	40 %	0 %	0 %	375256811
58642	NC_016610	GAG	2	6	3402240	3402245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375256811
58643	NC_016610	GTT	2	6	3402258	3402263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375256811
58644	NC_016610	TCCC	2	8	3402271	3402278	0 %	25 %	0 %	75 %	375256811
58645	NC_016610	CAG	2	6	3402297	3402302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256811
58646	NC_016610	A	6	6	3402316	3402321	100 %	0 %	0 %	0 %	375256811
58647	NC_016610	ATC	3	9	3402326	3402334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375256811
58648	NC_016610	GAAG	2	8	3402505	3402512	50 %	0 %	50 %	0 %	375256812
58649	NC_016610	CT	3	6	3402536	3402541	0 %	50 %	0 %	50 %	375256812
58650	NC_016610	TGAA	2	8	3402561	3402568	50 %	25 %	25 %	0 %	375256812
58651	NC_016610	CCG	2	6	3402685	3402690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375256812
58652	NC_016610	CGA	2	6	3402691	3402696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256812
58653	NC_016610	TGC	2	6	3402748	3402753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256812
58654	NC_016610	GAAGA	2	10	3402754	3402763	60 %	0 %	40 %	0 %	375256812
58655	NC_016610	GAA	2	6	3402769	3402774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256812
58656	NC_016610	GAAA	2	8	3402781	3402788	75 %	0 %	25 %	0 %	375256812
58657	NC_016610	ACA	2	6	3402811	3402816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375256813
58658	NC_016610	GTC	2	6	3402864	3402869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256813
58659	NC_016610	GAA	4	12	3402876	3402887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256813
58660	NC_016610	GAA	2	6	3402948	3402953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256813
58661	NC_016610	GAAC	2	8	3402960	3402967	50 %	0 %	25 %	25 %	375256813
58662	NC_016610	TTC	2	6	3402977	3402982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375256813
58663	NC_016610	CGT	2	6	3403018	3403023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375256813
58664	NC_016610	AG	3	6	3403040	3403045	50 %	0 %	50 %	0 %	375256813
58665	NC_016610	TGA	2	6	3403082	3403087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256813
58666	NC_016610	AAT	2	6	3403088	3403093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375256813
58667	NC_016610	GAT	2	6	3403131	3403136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256814
58668	NC_016610	GTA	2	6	3403137	3403142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256814
58669	NC_016610	AAC	2	6	3403267	3403272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375256814
58670	NC_016610	AGA	2	6	3403298	3403303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256814
58671	NC_016610	GAA	2	6	3403410	3403415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256814
58672	NC_016610	AAG	2	6	3403474	3403479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256814
58673	NC_016610	GTA	2	6	3403758	3403763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256815
58674	NC_016610	GCC	2	6	3403866	3403871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375256815
58675	NC_016610	ATG	2	6	3403876	3403881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375256815
58676	NC_016610	A	8	8	3404001	3404008	100 %	0 %	0 %	0 %	375256815
58677	NC_016610	AGA	2	6	3404105	3404110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256815
58678	NC_016610	TTC	2	6	3404147	3404152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375256815
58679	NC_016610	TAT	2	6	3404162	3404167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375256815
58680	NC_016610	ATTT	2	8	3404330	3404337	25 %	75 %	0 %	0 %	375256815
58681	NC_016610	GAA	2	6	3404346	3404351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375256815
58682	NC_016610	ACAAA	2	10	3404378	3404387	80 %	0 %	0 %	20 %	375256815
58683	NC_016610	AT	3	6	3404400	3404405	50 %	50 %	0 %	0 %	375256815
58684	NC_016610	GGA	2	6	3404448	3404453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375256815
58685	NC_016610	AGC	2	6	3404512	3404517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375256815
58686	NC_016610	AAAC	2	8	3404557	3404564	75 %	0 %	0 %	25 %	375256815
58687	NC_016610	ATC	2	6	3404705	3404710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375256815

< Previous12...106107108109110111112113114115116117118Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.