MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_016148	AGG	2	6	106790	106795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418949
2002	NC_016148	ATG	2	6	106883	106888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418949
2003	NC_016148	T	6	6	106912	106917	0 %	100 %	0 %	0 %	357418949
2004	NC_016148	TCT	2	6	106925	106930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418949
2005	NC_016148	CGT	2	6	107109	107114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418949
2006	NC_016148	AT	3	6	107115	107120	50 %	50 %	0 %	0 %	357418949
2007	NC_016148	GAT	2	6	107208	107213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418949
2008	NC_016148	TGC	3	9	107288	107296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418949
2009	NC_016148	GTTT	2	8	107331	107338	0 %	75 %	25 %	0 %	357418949
2010	NC_016148	TA	3	6	107424	107429	50 %	50 %	0 %	0 %	357418949
2011	NC_016148	CAG	2	6	107442	107447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418949
2012	NC_016148	GTAGA	2	10	107451	107460	40 %	20 %	40 %	0 %	357418949
2013	NC_016148	GTC	2	6	107503	107508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418949
2014	NC_016148	GAG	2	6	107552	107557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418949
2015	NC_016148	GTC	2	6	107584	107589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418949
2016	NC_016148	TCC	2	6	107597	107602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418949
2017	NC_016148	GAA	2	6	107644	107649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418949
2018	NC_016148	GGA	2	6	107675	107680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418949
2019	NC_016148	ATG	2	6	107708	107713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418949
2020	NC_016148	AAG	2	6	107818	107823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418949
2021	NC_016148	TGA	2	6	107895	107900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418949
2022	NC_016148	TGC	2	6	108215	108220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418950
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2024	NC_016148	G	6	6	108315	108320	0 %	0 %	100 %	0 %	357418950
2025	NC_016148	TCCC	2	8	108332	108339	0 %	25 %	0 %	75 %	357418950
2026	NC_016148	TGA	2	6	108341	108346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418950
2027	NC_016148	ATATG	2	10	108382	108391	40 %	40 %	20 %	0 %	357418950
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2030	NC_016148	GA	3	6	108466	108471	50 %	0 %	50 %	0 %	357418950
2031	NC_016148	TAC	2	6	108510	108515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418950
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2033	NC_016148	TAGA	2	8	108572	108579	50 %	25 %	25 %	0 %	357418950
2034	NC_016148	TAA	2	6	108634	108639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418951
2035	NC_016148	T	6	6	108645	108650	0 %	100 %	0 %	0 %	357418951
2036	NC_016148	TG	3	6	108684	108689	0 %	50 %	50 %	0 %	357418951
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2040	NC_016148	CAG	2	6	108899	108904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418951
2041	NC_016148	GGA	2	6	108973	108978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418951
2042	NC_016148	AGG	2	6	108987	108992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418951
2043	NC_016148	AGG	2	6	109008	109013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418951
2044	NC_016148	AAGGAA	2	12	109085	109096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418951
2045	NC_016148	TGA	2	6	109104	109109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418951
2046	NC_016148	TGC	2	6	109167	109172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418951
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2048	NC_016148	T	6	6	109234	109239	0 %	100 %	0 %	0 %	357418951
2049	NC_016148	TGC	2	6	109290	109295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418951
2050	NC_016148	TGT	2	6	109329	109334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418951
2051	NC_016148	TAGG	2	8	109387	109394	25 %	25 %	50 %	0 %	357418951
2052	NC_016148	GATG	2	8	109407	109414	25 %	25 %	50 %	0 %	357418952
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2054	NC_016148	GTTG	2	8	109491	109498	0 %	50 %	50 %	0 %	357418952
2055	NC_016148	TGG	2	6	109571	109576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418952
2056	NC_016148	T	6	6	109592	109597	0 %	100 %	0 %	0 %	357418952
2057	NC_016148	AAC	2	6	109602	109607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418952
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2059	NC_016148	AT	3	6	109640	109645	50 %	50 %	0 %	0 %	357418952
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2063	NC_016148	ATG	2	6	109790	109795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418953
2064	NC_016148	TAC	2	6	109802	109807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418953
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2069	NC_016148	CT	3	6	110378	110383	0 %	50 %	0 %	50 %	357418953
2070	NC_016148	TGC	2	6	110436	110441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418953
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2073	NC_016148	TGA	2	6	110567	110572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418954
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2114	NC_016148	AG	3	6	112737	112742	50 %	0 %	50 %	0 %	357418956
2115	NC_016148	T	6	6	112750	112755	0 %	100 %	0 %	0 %	357418956
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2493	NC_016148	AGC	2	6	132460	132465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418976
2494	NC_016148	GA	3	6	132471	132476	50 %	0 %	50 %	0 %	357418976
2495	NC_016148	TGG	2	6	132513	132518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418976
2496	NC_016148	CTTG	2	8	132520	132527	0 %	50 %	25 %	25 %	357418976
2497	NC_016148	TCA	3	9	132549	132557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418976
2498	NC_016148	CAG	2	6	132565	132570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418976
2499	NC_016148	AGA	2	6	132630	132635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418976
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