MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016148	CTG	2	6	80126	80131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418921
1502	NC_016148	GAG	2	6	80147	80152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418921
1503	NC_016148	CT	3	6	80155	80160	0 %	50 %	0 %	50 %	357418921
1504	NC_016148	ATG	2	6	80216	80221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418921
1505	NC_016148	GGA	2	6	80284	80289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418921
1506	NC_016148	GGA	2	6	80292	80297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418921
1507	NC_016148	CTG	3	9	80342	80350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418921
1508	NC_016148	CTA	2	6	80369	80374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418921
1509	NC_016148	AGG	2	6	80447	80452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418921
1510	NC_016148	CTG	2	6	80467	80472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418921
1511	NC_016148	G	6	6	80498	80503	0 %	0 %	100 %	0 %	357418921
1512	NC_016148	TGGACG	2	12	80669	80680	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	357418921
1513	NC_016148	GGC	2	6	80688	80693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418921
1514	NC_016148	TGG	2	6	80768	80773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418921
1515	NC_016148	G	6	6	80845	80850	0 %	0 %	100 %	0 %	357418922
1516	NC_016148	AGG	2	6	80867	80872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418922
1517	NC_016148	GGA	2	6	80915	80920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418922
1518	NC_016148	GAA	4	12	80933	80944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418922
1519	NC_016148	AGA	2	6	80951	80956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418922
1520	NC_016148	GTG	2	6	81142	81147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418922
1521	NC_016148	T	6	6	81149	81154	0 %	100 %	0 %	0 %	357418922
1522	NC_016148	TTGT	2	8	81181	81188	0 %	75 %	25 %	0 %	357418922
1523	NC_016148	CAT	2	6	81191	81196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418922
1524	NC_016148	CTT	2	6	81256	81261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418922
1525	NC_016148	GCT	2	6	81345	81350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418922
1526	NC_016148	GCA	2	6	81432	81437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418922
1527	NC_016148	GGTTGG	2	12	81475	81486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418922
1528	NC_016148	CAGA	2	8	81585	81592	50 %	0 %	25 %	25 %	357418922
1529	NC_016148	GAT	2	6	81653	81658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418922
1530	NC_016148	CCCA	2	8	81696	81703	25 %	0 %	0 %	75 %	357418922
1531	NC_016148	CCA	2	6	81733	81738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418922
1532	NC_016148	GGT	2	6	81752	81757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418922
1533	NC_016148	GGA	2	6	81803	81808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418922
1534	NC_016148	GGA	2	6	81827	81832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418922
1535	NC_016148	GAG	2	6	81876	81881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418922
1536	NC_016148	A	6	6	81939	81944	100 %	0 %	0 %	0 %	357418922
1537	NC_016148	AG	3	6	82119	82124	50 %	0 %	50 %	0 %	357418923
1538	NC_016148	A	6	6	82235	82240	100 %	0 %	0 %	0 %	357418923
1539	NC_016148	GTG	2	6	82262	82267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418923
1540	NC_016148	CCA	2	6	82286	82291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418923
1541	NC_016148	CT	3	6	82366	82371	0 %	50 %	0 %	50 %	357418923
1542	NC_016148	TGA	2	6	82423	82428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418923
1543	NC_016148	GC	3	6	82486	82491	0 %	0 %	50 %	50 %	357418923
1544	NC_016148	GAA	2	6	82511	82516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418923
1545	NC_016148	GAA	2	6	82562	82567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418923
1546	NC_016148	AGATG	2	10	82573	82582	40 %	20 %	40 %	0 %	357418923
1547	NC_016148	GAG	2	6	82622	82627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418923
1548	NC_016148	GGA	2	6	82636	82641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418923
1549	NC_016148	ATA	2	6	82664	82669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418923
1550	NC_016148	GA	3	6	82703	82708	50 %	0 %	50 %	0 %	357418923
1551	NC_016148	AAGT	2	8	83091	83098	50 %	25 %	25 %	0 %	357418924
1552	NC_016148	GAT	2	6	83125	83130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418924
1553	NC_016148	TGA	2	6	83214	83219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418924
1554	NC_016148	CTT	2	6	83231	83236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418924
1555	NC_016148	TAA	2	6	83253	83258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418924
1556	NC_016148	T	6	6	83324	83329	0 %	100 %	0 %	0 %	357418925
1557	NC_016148	GGT	2	6	83373	83378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418925
1558	NC_016148	GCT	2	6	83383	83388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418925
1559	NC_016148	TGG	2	6	83414	83419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418925
1560	NC_016148	T	6	6	83429	83434	0 %	100 %	0 %	0 %	357418925
1561	NC_016148	T	6	6	83459	83464	0 %	100 %	0 %	0 %	357418925
1562	NC_016148	GGA	2	6	83478	83483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418925
1563	NC_016148	GCT	2	6	83488	83493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418925
1564	NC_016148	CTTCTG	2	12	83540	83551	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	357418925
1565	NC_016148	AGA	2	6	83565	83570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418925
1566	NC_016148	GGTT	2	8	83628	83635	0 %	50 %	50 %	0 %	357418925
1567	NC_016148	CAG	2	6	83677	83682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418925
1568	NC_016148	GGAG	2	8	83706	83713	25 %	0 %	75 %	0 %	357418925
1569	NC_016148	GGT	2	6	83742	83747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418925
1570	NC_016148	AGG	2	6	83807	83812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418925
1571	NC_016148	TGG	2	6	83888	83893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418925
1572	NC_016148	GGT	2	6	83931	83936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418925
1573	NC_016148	GAG	2	6	83975	83980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418925
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1577	NC_016148	AAG	2	6	84195	84200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418925
1578	NC_016148	GGA	2	6	84213	84218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418925
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1580	NC_016148	GACC	2	8	84324	84331	25 %	0 %	25 %	50 %	357418925
1581	NC_016148	GCA	2	6	84360	84365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418925
1582	NC_016148	TCC	2	6	84378	84383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418925
1583	NC_016148	TAA	2	6	84416	84421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418925
1584	NC_016148	AGG	2	6	84446	84451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418925
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1588	NC_016148	CTT	2	6	84730	84735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418925
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1591	NC_016148	GAG	2	6	84802	84807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418925
1592	NC_016148	CAT	2	6	84816	84821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418925
1593	NC_016148	GGA	2	6	84834	84839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418925
1594	NC_016148	GGC	2	6	84869	84874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418926
1595	NC_016148	AT	3	6	84915	84920	50 %	50 %	0 %	0 %	357418926
1596	NC_016148	GCG	2	6	84995	85000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418926
1597	NC_016148	GAAG	2	8	85010	85017	50 %	0 %	50 %	0 %	357418926
1598	NC_016148	TTG	2	6	85119	85124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418926
1599	NC_016148	CTT	2	6	85199	85204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418926
1600	NC_016148	CAGGG	2	10	85415	85424	20 %	0 %	60 %	20 %	357418926
1601	NC_016148	ATA	2	6	85446	85451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418926
1602	NC_016148	GGAA	2	8	85461	85468	50 %	0 %	50 %	0 %	357418926
1603	NC_016148	GAG	2	6	85521	85526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418926
1604	NC_016148	AAG	2	6	85533	85538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418926
1605	NC_016148	AGAT	2	8	85564	85571	50 %	25 %	25 %	0 %	357418926
1606	NC_016148	GGT	2	6	85589	85594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418926
1607	NC_016148	CGA	2	6	85643	85648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418926
1608	NC_016148	GA	4	8	85652	85659	50 %	0 %	50 %	0 %	357418926
1609	NC_016148	CAG	2	6	85679	85684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418926
1610	NC_016148	GAG	2	6	85746	85751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418926
1611	NC_016148	CAG	2	6	85755	85760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418926
1612	NC_016148	GA	3	6	85798	85803	50 %	0 %	50 %	0 %	357418926
1613	NC_016148	GTG	2	6	85819	85824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418926
1614	NC_016148	A	6	6	85863	85868	100 %	0 %	0 %	0 %	357418927
1615	NC_016148	G	6	6	85926	85931	0 %	0 %	100 %	0 %	357418927
1616	NC_016148	AGAT	2	8	85937	85944	50 %	25 %	25 %	0 %	357418927
1617	NC_016148	TGC	2	6	85959	85964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418927
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1621	NC_016148	AG	3	6	86089	86094	50 %	0 %	50 %	0 %	357418927
1622	NC_016148	AAG	2	6	86114	86119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418927
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1624	NC_016148	AAG	2	6	86143	86148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418927
1625	NC_016148	AGGA	2	8	86159	86166	50 %	0 %	50 %	0 %	357418927
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