MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovirga lienii DSM 17291 chromosome

Total Repeats: 34540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016148	AGT	2	6	50911	50916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418897
1002	NC_016148	ATA	2	6	50957	50962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418897
1003	NC_016148	CCG	2	6	50984	50989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418897
1004	NC_016148	GAAA	2	8	51006	51013	75 %	0 %	25 %	0 %	357418897
1005	NC_016148	AAG	2	6	51059	51064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418897
1006	NC_016148	CAG	2	6	51153	51158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418897
1007	NC_016148	A	6	6	51301	51306	100 %	0 %	0 %	0 %	357418898
1008	NC_016148	AAG	2	6	51310	51315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418898
1009	NC_016148	AACA	2	8	51321	51328	75 %	0 %	0 %	25 %	357418898
1010	NC_016148	GAG	2	6	51336	51341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418898
1011	NC_016148	TATC	2	8	51360	51367	25 %	50 %	0 %	25 %	357418898
1012	NC_016148	GAT	2	6	51416	51421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418898
1013	NC_016148	CAG	2	6	51510	51515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418898
1014	NC_016148	CCG	2	6	51516	51521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357418898
1015	NC_016148	GAG	2	6	51615	51620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418898
1016	NC_016148	TCC	2	6	51646	51651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418898
1017	NC_016148	GGA	2	6	51674	51679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418898
1018	NC_016148	ATA	2	6	51699	51704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418898
1019	NC_016148	TGG	2	6	51920	51925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418899
1020	NC_016148	TGT	2	6	51942	51947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418899
1021	NC_016148	GA	3	6	52051	52056	50 %	0 %	50 %	0 %	357418899
1022	NC_016148	GGA	2	6	52073	52078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418899
1023	NC_016148	AAG	2	6	52128	52133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418899
1024	NC_016148	GGT	2	6	52187	52192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418899
1025	NC_016148	TG	3	6	52271	52276	0 %	50 %	50 %	0 %	357418900
1026	NC_016148	GAG	2	6	52362	52367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418900
1027	NC_016148	TGGT	2	8	52771	52778	0 %	50 %	50 %	0 %	357418901
1028	NC_016148	TG	3	6	52870	52875	0 %	50 %	50 %	0 %	357418901
1029	NC_016148	AGC	2	6	52920	52925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418901
1030	NC_016148	GGT	2	6	52926	52931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418901
1031	NC_016148	TCTT	2	8	52972	52979	0 %	75 %	0 %	25 %	357418901
1032	NC_016148	TTC	2	6	53019	53024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418901
1033	NC_016148	C	6	6	53024	53029	0 %	0 %	0 %	100 %	357418901
1034	NC_016148	GGA	2	6	53093	53098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418901
1035	NC_016148	CT	3	6	53132	53137	0 %	50 %	0 %	50 %	357418901
1036	NC_016148	GTA	2	6	53155	53160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418901
1037	NC_016148	ATA	2	6	53251	53256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418901
1038	NC_016148	TTC	2	6	53323	53328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418901
1039	NC_016148	GGC	2	6	53499	53504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418901
1040	NC_016148	GCTG	2	8	53622	53629	0 %	25 %	50 %	25 %	357418901
1041	NC_016148	GCG	2	6	53660	53665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418901
1042	NC_016148	GGTGAC	2	12	53668	53679	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	357418901
1043	NC_016148	CCA	2	6	53780	53785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418901
1044	NC_016148	TCTG	2	8	53801	53808	0 %	50 %	25 %	25 %	357418901
1045	NC_016148	AGG	2	6	53840	53845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418901
1046	NC_016148	ATGA	2	8	53854	53861	50 %	25 %	25 %	0 %	357418902
1047	NC_016148	A	6	6	53916	53921	100 %	0 %	0 %	0 %	357418902
1048	NC_016148	TGG	2	6	53957	53962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418902
1049	NC_016148	TGC	2	6	54236	54241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418903
1050	NC_016148	TGG	2	6	54301	54306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418903
1051	NC_016148	G	6	6	54368	54373	0 %	0 %	100 %	0 %	357418903
1052	NC_016148	TGG	2	6	54382	54387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418903
1053	NC_016148	GGT	2	6	54453	54458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418903
1054	NC_016148	GA	3	6	54462	54467	50 %	0 %	50 %	0 %	357418903
1055	NC_016148	GGC	2	6	54473	54478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418903
1056	NC_016148	GAG	2	6	54516	54521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418903
1057	NC_016148	TGG	2	6	54535	54540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418903
1058	NC_016148	TTGGC	2	10	54781	54790	0 %	40 %	40 %	20 %	357418903
1059	NC_016148	A	6	6	54847	54852	100 %	0 %	0 %	0 %	357418903
1060	NC_016148	AGGC	2	8	55066	55073	25 %	0 %	50 %	25 %	357418903
1061	NC_016148	ATA	2	6	55136	55141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418903
1062	NC_016148	GAA	2	6	55406	55411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418904
1063	NC_016148	GGA	2	6	55477	55482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418904
1064	NC_016148	CCT	2	6	55505	55510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418904
1065	NC_016148	TGA	4	12	55663	55674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418904
1066	NC_016148	GCG	2	6	55734	55739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418904
1067	NC_016148	G	6	6	55765	55770	0 %	0 %	100 %	0 %	357418904
1068	NC_016148	TA	3	6	55793	55798	50 %	50 %	0 %	0 %	357418904
1069	NC_016148	AGA	2	6	55896	55901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418904
1070	NC_016148	ACG	2	6	55949	55954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418904
1071	NC_016148	ATA	2	6	55964	55969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418904
1072	NC_016148	GGA	2	6	56011	56016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418904
1073	NC_016148	CTC	2	6	56037	56042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418904
1074	NC_016148	GA	3	6	56064	56069	50 %	0 %	50 %	0 %	357418904
1075	NC_016148	GAG	2	6	56104	56109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418904
1076	NC_016148	AAT	2	6	56254	56259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357418904
1077	NC_016148	CTC	2	6	56271	56276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418904
1078	NC_016148	CAG	2	6	56279	56284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418904
1079	NC_016148	TGG	2	6	56316	56321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418904
1080	NC_016148	A	7	7	56357	56363	100 %	0 %	0 %	0 %	357418904
1081	NC_016148	AAGG	2	8	56417	56424	50 %	0 %	50 %	0 %	357418904
1082	NC_016148	CAG	2	6	56432	56437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357418904
1083	NC_016148	ATG	2	6	56474	56479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418904
1084	NC_016148	AAG	2	6	56510	56515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418904
1085	NC_016148	GAT	2	6	56589	56594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418904
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1087	NC_016148	TCT	2	6	56642	56647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418905
1088	NC_016148	TCT	2	6	56656	56661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418905
1089	NC_016148	GGC	2	6	56756	56761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418905
1090	NC_016148	AT	3	6	56792	56797	50 %	50 %	0 %	0 %	357418905
1091	NC_016148	TC	3	6	56807	56812	0 %	50 %	0 %	50 %	357418905
1092	NC_016148	ATT	2	6	56934	56939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418905
1093	NC_016148	TC	3	6	57019	57024	0 %	50 %	0 %	50 %	357418905
1094	NC_016148	TAT	2	6	57059	57064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418905
1095	NC_016148	CAA	2	6	57079	57084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357418905
1096	NC_016148	T	6	6	57148	57153	0 %	100 %	0 %	0 %	357418906
1097	NC_016148	CGT	2	6	57205	57210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418906
1098	NC_016148	AGGCC	2	10	57220	57229	20 %	0 %	40 %	40 %	357418906
1099	NC_016148	TTC	2	6	57263	57268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418906
1100	NC_016148	CCT	2	6	57319	57324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418906
1101	NC_016148	TCC	2	6	57362	57367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418906
1102	NC_016148	TC	3	6	57390	57395	0 %	50 %	0 %	50 %	357418906
1103	NC_016148	CAT	2	6	57491	57496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418906
1104	NC_016148	TCCT	2	8	57508	57515	0 %	50 %	0 %	50 %	357418906
1105	NC_016148	TTCC	2	8	57635	57642	0 %	50 %	0 %	50 %	357418906
1106	NC_016148	TCG	2	6	57684	57689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418906
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1109	NC_016148	GAG	2	6	57819	57824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418906
1110	NC_016148	TAT	2	6	57830	57835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418906
1111	NC_016148	TTCCT	2	10	57837	57846	0 %	60 %	0 %	40 %	357418906
1112	NC_016148	GGC	2	6	57848	57853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418906
1113	NC_016148	TC	3	6	57898	57903	0 %	50 %	0 %	50 %	357418906
1114	NC_016148	GA	5	10	57942	57951	50 %	0 %	50 %	0 %	357418906
1115	NC_016148	TC	3	6	58004	58009	0 %	50 %	0 %	50 %	357418906
1116	NC_016148	TAT	2	6	58172	58177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357418906
1117	NC_016148	CTT	2	6	58183	58188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418906
1118	NC_016148	TCCC	2	8	58225	58232	0 %	25 %	0 %	75 %	357418906
1119	NC_016148	TGTA	2	8	58238	58245	25 %	50 %	25 %	0 %	357418906
1120	NC_016148	AGA	2	6	58246	58251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418906
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1122	NC_016148	TGG	2	6	58467	58472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357418906
1123	NC_016148	TTG	2	6	58592	58597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418907
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1125	NC_016148	GGC	2	6	58669	58674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418907
1126	NC_016148	TGC	2	6	58690	58695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418907
1127	NC_016148	GGC	2	6	58702	58707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357418907
1128	NC_016148	CTT	2	6	58725	58730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418907
1129	NC_016148	AGG	2	6	58841	58846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418907
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1131	NC_016148	AGG	2	6	58994	58999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357418907
1132	NC_016148	TGT	2	6	59184	59189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418907
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1135	NC_016148	TTG	2	6	59321	59326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418907
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1143	NC_016148	GTA	2	6	59947	59952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357418907
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1148	NC_016148	CTGT	2	8	60154	60161	0 %	50 %	25 %	25 %	357418907
1149	NC_016148	TGTCTA	2	12	60183	60194	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	357418907
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1152	NC_016148	TGT	2	6	60390	60395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357418907
1153	NC_016148	TGTA	2	8	60398	60405	25 %	50 %	25 %	0 %	357418907
1154	NC_016148	CTA	2	6	60435	60440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418907
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1161	NC_016148	TAC	2	6	60640	60645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418907
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1237	NC_016148	TA	3	6	64826	64831	50 %	50 %	0 %	0 %	357418912
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1241	NC_016148	GTCCTG	2	12	65028	65039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357418912
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1243	NC_016148	CCT	2	6	65078	65083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357418912
1244	NC_016148	TA	3	6	65111	65116	50 %	50 %	0 %	0 %	357418912
1245	NC_016148	CAT	2	6	65127	65132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357418912
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1247	NC_016148	TATC	2	8	65246	65253	25 %	50 %	0 %	25 %	357418912
1248	NC_016148	TC	3	6	65252	65257	0 %	50 %	0 %	50 %	357418912
1249	NC_016148	AAG	2	6	65347	65352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357418912
1250	NC_016148	G	6	6	65405	65410	0 %	0 %	100 %	0 %	357418912
1251	NC_016148	T	6	6	65467	65472	0 %	100 %	0 %	0 %	357418912
1252	NC_016148	CTT	2	6	65572	65577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357418912
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1254	NC_016148	CCA	2	6	65669	65674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357418912
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