MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 51517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016052	AAG	2	6	66327	66332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516235
1502	NC_016052	TTA	2	6	66341	66346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516235
1503	NC_016052	GTT	2	6	66463	66468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516235
1504	NC_016052	GGGC	2	8	66491	66498	0 %	0 %	75 %	25 %	352516235
1505	NC_016052	ATC	2	6	66518	66523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516235
1506	NC_016052	ATC	2	6	66540	66545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516235
1507	NC_016052	TAT	2	6	66632	66637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516235
1508	NC_016052	GAA	2	6	66668	66673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516235
1509	NC_016052	A	7	7	66686	66692	100 %	0 %	0 %	0 %	352516235
1510	NC_016052	TAT	2	6	66739	66744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516235
1511	NC_016052	GCCT	2	8	66757	66764	0 %	25 %	25 %	50 %	352516235
1512	NC_016052	A	6	6	66815	66820	100 %	0 %	0 %	0 %	352516235
1513	NC_016052	A	7	7	66845	66851	100 %	0 %	0 %	0 %	352516235
1514	NC_016052	TTTA	2	8	66920	66927	25 %	75 %	0 %	0 %	352516235
1515	NC_016052	CTG	2	6	67005	67010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516236
1516	NC_016052	GTT	2	6	67028	67033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516236
1517	NC_016052	A	7	7	67064	67070	100 %	0 %	0 %	0 %	352516236
1518	NC_016052	A	6	6	67131	67136	100 %	0 %	0 %	0 %	352516236
1519	NC_016052	GAA	2	6	67157	67162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516236
1520	NC_016052	ATT	2	6	67225	67230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516236
1521	NC_016052	AGG	2	6	67288	67293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352516236
1522	NC_016052	A	7	7	67361	67367	100 %	0 %	0 %	0 %	352516236
1523	NC_016052	TGG	2	6	67375	67380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516236
1524	NC_016052	CAT	2	6	67410	67415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516236
1525	NC_016052	TGA	2	6	67417	67422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516236
1526	NC_016052	TTA	2	6	67466	67471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516236
1527	NC_016052	AGA	3	9	67561	67569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516236
1528	NC_016052	CAA	2	6	67583	67588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516236
1529	NC_016052	AGA	2	6	67693	67698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516236
1530	NC_016052	GAA	2	6	67787	67792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516236
1531	NC_016052	GAA	2	6	67806	67811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516236
1532	NC_016052	ATG	2	6	67891	67896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516236
1533	NC_016052	AGAA	2	8	67934	67941	75 %	0 %	25 %	0 %	352516237
1534	NC_016052	ACTT	2	8	67966	67973	25 %	50 %	0 %	25 %	352516237
1535	NC_016052	GAA	2	6	67980	67985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516237
1536	NC_016052	A	6	6	67989	67994	100 %	0 %	0 %	0 %	352516237
1537	NC_016052	TTG	2	6	68022	68027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516237
1538	NC_016052	TGCAAA	2	12	68093	68104	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	352516237
1539	NC_016052	A	8	8	68102	68109	100 %	0 %	0 %	0 %	352516237
1540	NC_016052	AT	3	6	68145	68150	50 %	50 %	0 %	0 %	352516237
1541	NC_016052	GT	3	6	68254	68259	0 %	50 %	50 %	0 %	352516237
1542	NC_016052	GAT	2	6	68304	68309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516237
1543	NC_016052	CA	3	6	68327	68332	50 %	0 %	0 %	50 %	352516237
1544	NC_016052	CTAA	2	8	68352	68359	50 %	25 %	0 %	25 %	352516237
1545	NC_016052	TAG	2	6	68365	68370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516237
1546	NC_016052	CAAAC	2	10	68388	68397	60 %	0 %	0 %	40 %	352516237
1547	NC_016052	CAAGT	2	10	68422	68431	40 %	20 %	20 %	20 %	352516237
1548	NC_016052	AAG	2	6	68491	68496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516237
1549	NC_016052	TAT	2	6	68534	68539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516237
1550	NC_016052	AAAG	2	8	68543	68550	75 %	0 %	25 %	0 %	352516237
1551	NC_016052	GTT	2	6	68570	68575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516237
1552	NC_016052	ATG	2	6	68578	68583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516237
1553	NC_016052	GCT	2	6	68670	68675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516237
1554	NC_016052	GCT	2	6	68712	68717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516237
1555	NC_016052	TTGA	2	8	68769	68776	25 %	50 %	25 %	0 %	352516237
1556	NC_016052	ATA	2	6	68845	68850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516237
1557	NC_016052	CGT	2	6	68916	68921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516237
1558	NC_016052	AGA	2	6	68951	68956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516237
1559	NC_016052	AGA	2	6	69059	69064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516237
1560	NC_016052	AAG	2	6	69070	69075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516237
1561	NC_016052	TGAATT	2	12	69104	69115	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	352516237
1562	NC_016052	TGAA	2	8	69130	69137	50 %	25 %	25 %	0 %	352516237
1563	NC_016052	GAAA	2	8	69155	69162	75 %	0 %	25 %	0 %	352516237
1564	NC_016052	A	6	6	69160	69165	100 %	0 %	0 %	0 %	352516237
1565	NC_016052	ACGG	2	8	69195	69202	25 %	0 %	50 %	25 %	352516237
1566	NC_016052	T	7	7	69203	69209	0 %	100 %	0 %	0 %	352516237
1567	NC_016052	GTT	2	6	69214	69219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516237
1568	NC_016052	A	7	7	69225	69231	100 %	0 %	0 %	0 %	352516237
1569	NC_016052	A	6	6	69322	69327	100 %	0 %	0 %	0 %	352516238
1570	NC_016052	TCA	2	6	69366	69371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516238
1571	NC_016052	A	7	7	69425	69431	100 %	0 %	0 %	0 %	352516238
1572	NC_016052	AAG	2	6	69482	69487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516238
1573	NC_016052	TGC	2	6	69492	69497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516238
1574	NC_016052	GAT	2	6	69574	69579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516238
1575	NC_016052	AGA	2	6	69648	69653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516238
1576	NC_016052	ATC	2	6	69713	69718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516238
1577	NC_016052	TGAT	2	8	69788	69795	25 %	50 %	25 %	0 %	352516238
1578	NC_016052	ATT	2	6	69803	69808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516238
1579	NC_016052	GAA	3	9	69847	69855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516238
1580	NC_016052	GAA	2	6	69889	69894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516238
1581	NC_016052	A	6	6	69902	69907	100 %	0 %	0 %	0 %	352516238
1582	NC_016052	TGAT	2	8	69908	69915	25 %	50 %	25 %	0 %	352516238
1583	NC_016052	ATA	2	6	69941	69946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516238
1584	NC_016052	TGA	2	6	70069	70074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516239
1585	NC_016052	TCG	2	6	70144	70149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516239
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1587	NC_016052	AGTT	2	8	70179	70186	25 %	50 %	25 %	0 %	352516239
1588	NC_016052	ATG	2	6	70209	70214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516239
1589	NC_016052	GAA	2	6	70220	70225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516239
1590	NC_016052	TGT	2	6	70312	70317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516239
1591	NC_016052	GCA	2	6	70330	70335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516239
1592	NC_016052	ATC	2	6	70373	70378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516239
1593	NC_016052	CAAA	2	8	70481	70488	75 %	0 %	0 %	25 %	352516239
1594	NC_016052	CAAG	2	8	70526	70533	50 %	0 %	25 %	25 %	352516239
1595	NC_016052	TAT	2	6	70576	70581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516239
1596	NC_016052	TGA	2	6	70684	70689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516239
1597	NC_016052	GAA	2	6	70766	70771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516239
1598	NC_016052	AGC	2	6	70819	70824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516239
1599	NC_016052	GCAA	2	8	70834	70841	50 %	0 %	25 %	25 %	352516239
1600	NC_016052	ATA	2	6	70859	70864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516239
1601	NC_016052	TAA	2	6	70891	70896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516239
1602	NC_016052	GAA	3	9	70898	70906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516239
1603	NC_016052	GCT	2	6	70916	70921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516239
1604	NC_016052	GAA	2	6	70931	70936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516239
1605	NC_016052	A	6	6	70949	70954	100 %	0 %	0 %	0 %	352516239
1606	NC_016052	AGA	2	6	70965	70970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516239
1607	NC_016052	A	6	6	70970	70975	100 %	0 %	0 %	0 %	352516239
1608	NC_016052	T	7	7	70983	70989	0 %	100 %	0 %	0 %	352516239
1609	NC_016052	TTG	2	6	70998	71003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516239
1610	NC_016052	TCTT	2	8	71035	71042	0 %	75 %	0 %	25 %	352516239
1611	NC_016052	GCT	2	6	71138	71143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516239
1612	NC_016052	TGA	2	6	71164	71169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516239
1613	NC_016052	AAG	3	9	71172	71180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516239
1614	NC_016052	AAG	2	6	71205	71210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516239
1615	NC_016052	AAG	2	6	71232	71237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516239
1616	NC_016052	TA	3	6	71244	71249	50 %	50 %	0 %	0 %	352516239
1617	NC_016052	GAT	2	6	71279	71284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516239
1618	NC_016052	AAAG	2	8	71339	71346	75 %	0 %	25 %	0 %	352516239
1619	NC_016052	TTC	2	6	71353	71358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516239
1620	NC_016052	GAA	2	6	71363	71368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516239
1621	NC_016052	CAG	2	6	71385	71390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516239
1622	NC_016052	ATT	2	6	71396	71401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516239
1623	NC_016052	TGA	2	6	71413	71418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516239
1624	NC_016052	GAA	2	6	71423	71428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516239
1625	NC_016052	GTG	2	6	71429	71434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516239
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1627	NC_016052	TGC	2	6	71518	71523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516239
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1998	NC_016052	AATT	2	8	88123	88130	50 %	50 %	0 %	0 %	352516253
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