MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 51517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016052	CAG	2	6	43855	43860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516214
1002	NC_016052	CCT	2	6	43866	43871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352516214
1003	NC_016052	CTT	2	6	43900	43905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516214
1004	NC_016052	ACA	2	6	43962	43967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516214
1005	NC_016052	GTGC	2	8	43992	43999	0 %	25 %	50 %	25 %	352516214
1006	NC_016052	ATA	2	6	44003	44008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516214
1007	NC_016052	GGCA	2	8	44033	44040	25 %	0 %	50 %	25 %	352516214
1008	NC_016052	TGG	2	6	44065	44070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516214
1009	NC_016052	ATC	2	6	44100	44105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516214
1010	NC_016052	ATC	2	6	44135	44140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516214
1011	NC_016052	TGC	2	6	44208	44213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516214
1012	NC_016052	T	6	6	44308	44313	0 %	100 %	0 %	0 %	352516214
1013	NC_016052	TCT	2	6	44341	44346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516214
1014	NC_016052	TAG	2	6	44350	44355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516214
1015	NC_016052	TGT	2	6	44363	44368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516214
1016	NC_016052	T	6	6	44379	44384	0 %	100 %	0 %	0 %	352516214
1017	NC_016052	TTC	2	6	44396	44401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516214
1018	NC_016052	TAC	2	6	44411	44416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516214
1019	NC_016052	CAT	2	6	44417	44422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516214
1020	NC_016052	GTT	2	6	44435	44440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516214
1021	NC_016052	CTTT	2	8	44451	44458	0 %	75 %	0 %	25 %	352516214
1022	NC_016052	TCA	2	6	44484	44489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516214
1023	NC_016052	A	6	6	44554	44559	100 %	0 %	0 %	0 %	352516214
1024	NC_016052	TG	3	6	44613	44618	0 %	50 %	50 %	0 %	352516214
1025	NC_016052	AT	3	6	44635	44640	50 %	50 %	0 %	0 %	352516214
1026	NC_016052	T	6	6	44687	44692	0 %	100 %	0 %	0 %	352516214
1027	NC_016052	CTT	2	6	44788	44793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516214
1028	NC_016052	T	7	7	44801	44807	0 %	100 %	0 %	0 %	352516214
1029	NC_016052	ATT	2	6	44850	44855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516214
1030	NC_016052	GAA	2	6	44866	44871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516214
1031	NC_016052	ATAA	2	8	44886	44893	75 %	25 %	0 %	0 %	352516214
1032	NC_016052	AGC	2	6	44942	44947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516214
1033	NC_016052	GAT	2	6	44998	45003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516214
1034	NC_016052	GT	3	6	45006	45011	0 %	50 %	50 %	0 %	352516214
1035	NC_016052	TAA	2	6	45017	45022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516214
1036	NC_016052	TCT	2	6	45159	45164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516214
1037	NC_016052	ATTG	2	8	45172	45179	25 %	50 %	25 %	0 %	352516214
1038	NC_016052	T	6	6	45190	45195	0 %	100 %	0 %	0 %	352516214
1039	NC_016052	T	7	7	45215	45221	0 %	100 %	0 %	0 %	352516214
1040	NC_016052	ATC	2	6	45275	45280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516214
1041	NC_016052	AGTG	2	8	45282	45289	25 %	25 %	50 %	0 %	352516214
1042	NC_016052	TGAC	2	8	45315	45322	25 %	25 %	25 %	25 %	352516214
1043	NC_016052	GAC	2	6	45400	45405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516214
1044	NC_016052	TGA	2	6	45522	45527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516214
1045	NC_016052	T	7	7	45547	45553	0 %	100 %	0 %	0 %	352516214
1046	NC_016052	T	7	7	45568	45574	0 %	100 %	0 %	0 %	352516214
1047	NC_016052	GTA	2	6	45596	45601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516214
1048	NC_016052	AG	3	6	45605	45610	50 %	0 %	50 %	0 %	352516214
1049	NC_016052	T	6	6	45618	45623	0 %	100 %	0 %	0 %	352516214
1050	NC_016052	AT	3	6	45642	45647	50 %	50 %	0 %	0 %	352516214
1051	NC_016052	ATT	2	6	45806	45811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516214
1052	NC_016052	TAA	2	6	45872	45877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516214
1053	NC_016052	T	6	6	45897	45902	0 %	100 %	0 %	0 %	352516214
1054	NC_016052	ATA	2	6	45917	45922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516214
1055	NC_016052	TTTGC	2	10	45940	45949	0 %	60 %	20 %	20 %	352516214
1056	NC_016052	TTGCC	2	10	45967	45976	0 %	40 %	20 %	40 %	352516214
1057	NC_016052	CAAA	2	8	45978	45985	75 %	0 %	0 %	25 %	352516214
1058	NC_016052	TTC	2	6	45998	46003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516214
1059	NC_016052	TCC	2	6	46070	46075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352516214
1060	NC_016052	GACA	2	8	46113	46120	50 %	0 %	25 %	25 %	352516214
1061	NC_016052	TGT	2	6	46184	46189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516214
1062	NC_016052	GAA	2	6	46510	46515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516215
1063	NC_016052	GGC	2	6	46543	46548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352516215
1064	NC_016052	CAA	2	6	46580	46585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516215
1065	NC_016052	GTTTT	2	10	46592	46601	0 %	80 %	20 %	0 %	352516215
1066	NC_016052	AAG	2	6	46625	46630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516215
1067	NC_016052	TGA	2	6	46635	46640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516215
1068	NC_016052	AAG	2	6	46730	46735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516215
1069	NC_016052	A	8	8	46783	46790	100 %	0 %	0 %	0 %	352516215
1070	NC_016052	TAT	2	6	46842	46847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516215
1071	NC_016052	TAT	2	6	46854	46859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516215
1072	NC_016052	TGG	2	6	46911	46916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516215
1073	NC_016052	TTG	2	6	46925	46930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516215
1074	NC_016052	CTG	3	9	47120	47128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516215
1075	NC_016052	AGAT	2	8	47162	47169	50 %	25 %	25 %	0 %	352516215
1076	NC_016052	TAT	2	6	47307	47312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516215
1077	NC_016052	TGGT	2	8	47340	47347	0 %	50 %	50 %	0 %	352516215
1078	NC_016052	GTTG	2	8	47402	47409	0 %	50 %	50 %	0 %	352516215
1079	NC_016052	GCT	2	6	47427	47432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516215
1080	NC_016052	TTA	2	6	47447	47452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516215
1081	NC_016052	CAT	2	6	47461	47466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516215
1082	NC_016052	AGTT	2	8	47489	47496	25 %	50 %	25 %	0 %	352516215
1083	NC_016052	GAT	2	6	47535	47540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516215
1084	NC_016052	TAT	2	6	47580	47585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516215
1085	NC_016052	GAA	2	6	47611	47616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516215
1086	NC_016052	AT	3	6	47691	47696	50 %	50 %	0 %	0 %	352516215
1087	NC_016052	TGC	2	6	47709	47714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516215
1088	NC_016052	GAT	2	6	47715	47720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516215
1089	NC_016052	TTTA	2	8	47739	47746	25 %	75 %	0 %	0 %	352516215
1090	NC_016052	TGG	2	6	47784	47789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516215
1091	NC_016052	TTA	2	6	47807	47812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516215
1092	NC_016052	TGG	3	9	47823	47831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516215
1093	NC_016052	TAA	2	6	47916	47921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516215
1094	NC_016052	CAG	2	6	47942	47947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516215
1095	NC_016052	TCT	2	6	47992	47997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516215
1096	NC_016052	A	6	6	48032	48037	100 %	0 %	0 %	0 %	352516215
1097	NC_016052	ATT	2	6	48047	48052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516215
1098	NC_016052	A	6	6	48112	48117	100 %	0 %	0 %	0 %	352516216
1099	NC_016052	AGA	2	6	48149	48154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516216
1100	NC_016052	AAACA	2	10	48199	48208	80 %	0 %	0 %	20 %	352516216
1101	NC_016052	GCAA	2	8	48376	48383	50 %	0 %	25 %	25 %	352516216
1102	NC_016052	AAG	2	6	48463	48468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516216
1103	NC_016052	TAAA	2	8	48492	48499	75 %	25 %	0 %	0 %	352516216
1104	NC_016052	AAT	2	6	48730	48735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516217
1105	NC_016052	AATT	2	8	48754	48761	50 %	50 %	0 %	0 %	352516217
1106	NC_016052	TGT	2	6	48774	48779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516217
1107	NC_016052	AGA	2	6	48787	48792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516217
1108	NC_016052	TAA	2	6	48889	48894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516217
1109	NC_016052	T	6	6	48898	48903	0 %	100 %	0 %	0 %	352516217
1110	NC_016052	GCT	2	6	48938	48943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516217
1111	NC_016052	A	7	7	48949	48955	100 %	0 %	0 %	0 %	352516217
1112	NC_016052	TTG	2	6	48966	48971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516217
1113	NC_016052	A	8	8	48992	48999	100 %	0 %	0 %	0 %	352516217
1114	NC_016052	GGC	2	6	49022	49027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352516217
1115	NC_016052	GTA	2	6	49029	49034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516217
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1117	NC_016052	CAA	2	6	49175	49180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516217
1118	NC_016052	TGT	2	6	49257	49262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516217
1119	NC_016052	AGA	2	6	49282	49287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516217
1120	NC_016052	ATT	2	6	49310	49315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516217
1121	NC_016052	CAA	2	6	49316	49321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516217
1122	NC_016052	ATG	2	6	49334	49339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516217
1123	NC_016052	TGA	2	6	49362	49367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516217
1124	NC_016052	TGA	2	6	49450	49455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516217
1125	NC_016052	TA	3	6	49458	49463	50 %	50 %	0 %	0 %	352516217
1126	NC_016052	GAA	2	6	49748	49753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516218
1127	NC_016052	AGA	2	6	49762	49767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516218
1128	NC_016052	GTTA	2	8	49769	49776	25 %	50 %	25 %	0 %	352516218
1129	NC_016052	ATG	2	6	49785	49790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516218
1130	NC_016052	TTA	2	6	49859	49864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516218
1131	NC_016052	GCA	2	6	49878	49883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516218
1132	NC_016052	TGG	2	6	50122	50127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516218
1133	NC_016052	GAATG	2	10	50200	50209	40 %	20 %	40 %	0 %	352516218
1134	NC_016052	ACA	2	6	50245	50250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516218
1135	NC_016052	CA	3	6	50287	50292	50 %	0 %	0 %	50 %	352516218
1136	NC_016052	AGG	2	6	50346	50351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352516218
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1141	NC_016052	ACC	2	6	50545	50550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352516219
1142	NC_016052	GGT	2	6	50595	50600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352516219
1143	NC_016052	AGG	2	6	50643	50648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352516219
1144	NC_016052	TGA	2	6	50669	50674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516219
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1147	NC_016052	TGT	2	6	50786	50791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516219
1148	NC_016052	ATGT	2	8	50815	50822	25 %	50 %	25 %	0 %	352516219
1149	NC_016052	TGA	2	6	50832	50837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516219
1150	NC_016052	CTG	2	6	50941	50946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516219
1151	NC_016052	TAT	2	6	50955	50960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516219
1152	NC_016052	GT	3	6	51023	51028	0 %	50 %	50 %	0 %	352516219
1153	NC_016052	TTAG	2	8	51058	51065	25 %	50 %	25 %	0 %	352516219
1154	NC_016052	AC	3	6	51080	51085	50 %	0 %	0 %	50 %	352516219
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1166	NC_016052	AGA	2	6	51567	51572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516220
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1227	NC_016052	TAAA	2	8	54047	54054	75 %	25 %	0 %	0 %	352516222
1228	NC_016052	A	6	6	54089	54094	100 %	0 %	0 %	0 %	352516222
1229	NC_016052	A	6	6	54459	54464	100 %	0 %	0 %	0 %	352516223
1230	NC_016052	GCG	2	6	54467	54472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352516223
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1234	NC_016052	TCAA	2	8	54577	54584	50 %	25 %	0 %	25 %	352516223
1235	NC_016052	AGT	2	6	54587	54592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516223
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1241	NC_016052	CGT	2	6	54992	54997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516223
1242	NC_016052	TG	3	6	55055	55060	0 %	50 %	50 %	0 %	352516223
1243	NC_016052	CGA	2	6	55066	55071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516223
1244	NC_016052	TGAT	2	8	55074	55081	25 %	50 %	25 %	0 %	352516223
1245	NC_016052	AAG	2	6	55119	55124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516223
1246	NC_016052	CTT	2	6	55146	55151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516223
1247	NC_016052	TAT	2	6	55164	55169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516223
1248	NC_016052	GTT	2	6	55217	55222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516223
1249	NC_016052	AGA	2	6	55243	55248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516223
1250	NC_016052	A	7	7	55347	55353	100 %	0 %	0 %	0 %	352516223
1251	NC_016052	TAAA	2	8	55364	55371	75 %	25 %	0 %	0 %	352516223
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