MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 51517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016052	TTC	2	6	20721	20726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516191
502	NC_016052	AAAG	2	8	20739	20746	75 %	0 %	25 %	0 %	352516191
503	NC_016052	CTT	2	6	20753	20758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516191
504	NC_016052	ATT	2	6	20871	20876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516191
505	NC_016052	CAT	2	6	20982	20987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516191
506	NC_016052	ATC	2	6	21012	21017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516191
507	NC_016052	AATTG	2	10	21022	21031	40 %	40 %	20 %	0 %	352516191
508	NC_016052	GAA	2	6	21037	21042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516191
509	NC_016052	TCT	2	6	21052	21057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516191
510	NC_016052	CTTT	2	8	21103	21110	0 %	75 %	0 %	25 %	352516191
511	NC_016052	GTT	2	6	21166	21171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516191
512	NC_016052	ATA	2	6	21193	21198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516191
513	NC_016052	CTT	2	6	21242	21247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516191
514	NC_016052	TTC	2	6	21333	21338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516191
515	NC_016052	TCT	2	6	21424	21429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516191
516	NC_016052	T	7	7	21472	21478	0 %	100 %	0 %	0 %	352516191
517	NC_016052	GCT	2	6	21508	21513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516191
518	NC_016052	TTG	2	6	21522	21527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516191
519	NC_016052	AAT	2	6	21605	21610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516192
520	NC_016052	TAC	2	6	21640	21645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516192
521	NC_016052	GCT	2	6	21669	21674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516192
522	NC_016052	TCA	2	6	21744	21749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516192
523	NC_016052	CGA	2	6	21762	21767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516192
524	NC_016052	GTCG	2	8	21877	21884	0 %	25 %	50 %	25 %	352516192
525	NC_016052	TCA	2	6	21915	21920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516192
526	NC_016052	TAA	2	6	21943	21948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516192
527	NC_016052	CAG	2	6	21968	21973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516192
528	NC_016052	TTC	2	6	21974	21979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516192
529	NC_016052	ATT	2	6	21995	22000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516192
530	NC_016052	ATA	2	6	22020	22025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516192
531	NC_016052	GCTG	2	8	22054	22061	0 %	25 %	50 %	25 %	352516192
532	NC_016052	GCT	2	6	22113	22118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352516192
533	NC_016052	TGT	2	6	22125	22130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516192
534	NC_016052	AGA	2	6	22193	22198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516192
535	NC_016052	TCA	2	6	22254	22259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516192
536	NC_016052	GTT	2	6	22299	22304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516192
537	NC_016052	TTC	2	6	22617	22622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516193
538	NC_016052	CAT	2	6	22679	22684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516193
539	NC_016052	T	6	6	22721	22726	0 %	100 %	0 %	0 %	352516193
540	NC_016052	TCA	2	6	22735	22740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516193
541	NC_016052	AAT	2	6	22773	22778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516193
542	NC_016052	TGA	2	6	22786	22791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516193
543	NC_016052	TTG	2	6	22818	22823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516193
544	NC_016052	AAT	2	6	22839	22844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516193
545	NC_016052	AGC	2	6	22848	22853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516193
546	NC_016052	TTTCTT	2	12	22970	22981	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	352516193
547	NC_016052	TGT	2	6	23259	23264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516193
548	NC_016052	AATA	2	8	23265	23272	75 %	25 %	0 %	0 %	352516193
549	NC_016052	GCC	2	6	23286	23291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352516193
550	NC_016052	ATT	2	6	23463	23468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516193
551	NC_016052	AGT	2	6	23472	23477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516193
552	NC_016052	T	6	6	23494	23499	0 %	100 %	0 %	0 %	352516193
553	NC_016052	A	6	6	23704	23709	100 %	0 %	0 %	0 %	352516194
554	NC_016052	AGT	2	6	23720	23725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516194
555	NC_016052	AAAGAA	2	12	23736	23747	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	352516194
556	NC_016052	CAT	2	6	23772	23777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352516194
557	NC_016052	AGA	2	6	23804	23809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516194
558	NC_016052	CAA	2	6	23866	23871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516194
559	NC_016052	A	7	7	23875	23881	100 %	0 %	0 %	0 %	352516194
560	NC_016052	ATG	2	6	23922	23927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516194
561	NC_016052	T	6	6	23978	23983	0 %	100 %	0 %	0 %	352516194
562	NC_016052	TAT	2	6	24005	24010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516194
563	NC_016052	ATT	2	6	24019	24024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516194
564	NC_016052	TAA	2	6	24091	24096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516194
565	NC_016052	A	7	7	24095	24101	100 %	0 %	0 %	0 %	352516194
566	NC_016052	GATCAA	2	12	24147	24158	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	352516194
567	NC_016052	A	6	6	24229	24234	100 %	0 %	0 %	0 %	352516195
568	NC_016052	AGA	2	6	24328	24333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516195
569	NC_016052	AAC	2	6	24367	24372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516195
570	NC_016052	TGT	2	6	24412	24417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516195
571	NC_016052	A	6	6	24422	24427	100 %	0 %	0 %	0 %	352516195
572	NC_016052	GAT	2	6	24496	24501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516195
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575	NC_016052	CAAAT	2	10	24617	24626	60 %	20 %	0 %	20 %	352516195
576	NC_016052	TATT	2	8	24665	24672	25 %	75 %	0 %	0 %	352516195
577	NC_016052	TCCA	2	8	24743	24750	25 %	25 %	0 %	50 %	352516195
578	NC_016052	AT	3	6	24768	24773	50 %	50 %	0 %	0 %	352516195
579	NC_016052	TTA	2	6	24821	24826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516195
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582	NC_016052	GTATT	2	10	24929	24938	20 %	60 %	20 %	0 %	352516195
583	NC_016052	A	6	6	24982	24987	100 %	0 %	0 %	0 %	352516195
584	NC_016052	AAGT	2	8	25047	25054	50 %	25 %	25 %	0 %	352516195
585	NC_016052	T	7	7	25068	25074	0 %	100 %	0 %	0 %	352516195
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588	NC_016052	AACG	2	8	25191	25198	50 %	0 %	25 %	25 %	352516195
589	NC_016052	AGC	2	6	25294	25299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516195
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591	NC_016052	CGAT	2	8	25326	25333	25 %	25 %	25 %	25 %	352516195
592	NC_016052	TAGCTA	2	12	25335	25346	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	352516195
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594	NC_016052	AGC	2	6	25449	25454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516195
595	NC_016052	TA	4	8	25491	25498	50 %	50 %	0 %	0 %	352516195
596	NC_016052	A	6	6	25501	25506	100 %	0 %	0 %	0 %	352516195
597	NC_016052	GTT	2	6	25544	25549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516195
598	NC_016052	TGA	2	6	25564	25569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516195
599	NC_016052	GA	3	6	25608	25613	50 %	0 %	50 %	0 %	352516196
600	NC_016052	TTC	2	6	25675	25680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352516196
601	NC_016052	CTTGG	2	10	25687	25696	0 %	40 %	40 %	20 %	352516196
602	NC_016052	CAG	2	6	25709	25714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516196
603	NC_016052	AATG	2	8	25718	25725	50 %	25 %	25 %	0 %	352516196
604	NC_016052	ATA	3	9	25731	25739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352516196
605	NC_016052	T	6	6	25767	25772	0 %	100 %	0 %	0 %	352516196
606	NC_016052	ATTT	2	8	25773	25780	25 %	75 %	0 %	0 %	352516196
607	NC_016052	ATT	2	6	25783	25788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516196
608	NC_016052	ATT	2	6	25895	25900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516196
609	NC_016052	TGA	2	6	25971	25976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516196
610	NC_016052	CGA	2	6	26020	26025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516196
611	NC_016052	A	6	6	26030	26035	100 %	0 %	0 %	0 %	352516196
612	NC_016052	GAAA	2	8	26052	26059	75 %	0 %	25 %	0 %	352516196
613	NC_016052	ACA	2	6	26074	26079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352516196
614	NC_016052	AGA	2	6	26098	26103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516196
615	NC_016052	AT	3	6	26230	26235	50 %	50 %	0 %	0 %	352516196
616	NC_016052	GAC	2	6	26271	26276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352516196
617	NC_016052	AGA	2	6	26308	26313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516196
618	NC_016052	ATG	2	6	26334	26339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352516196
619	NC_016052	TTA	2	6	26375	26380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352516196
620	NC_016052	GTT	2	6	26501	26506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352516196
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622	NC_016052	TGGTAG	2	12	26592	26603	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	352516196
623	NC_016052	AAG	2	6	26604	26609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352516196
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