MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 37277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016051	CTC	2	6	28637	28642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478664
502	NC_016051	AGG	2	6	28758	28763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478664
503	NC_016051	CTC	2	6	28775	28780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478664
504	NC_016051	CTC	2	6	28786	28791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478664
505	NC_016051	TTC	2	6	28859	28864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478664
506	NC_016051	CCG	2	6	28911	28916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478664
507	NC_016051	TCC	2	6	28923	28928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478664
508	NC_016051	CGG	2	6	28957	28962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478664
509	NC_016051	CCG	2	6	29030	29035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478664
510	NC_016051	CA	3	6	29085	29090	50 %	0 %	0 %	50 %	223478664
511	NC_016051	TCG	2	6	29097	29102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478664
512	NC_016051	CGT	2	6	29143	29148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478664
513	NC_016051	GAG	2	6	29204	29209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478664
514	NC_016051	CGCTCC	2	12	29214	29225	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	223478664
515	NC_016051	TCA	2	6	29295	29300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478664
516	NC_016051	GCG	2	6	29319	29324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478664
517	NC_016051	TGC	2	6	29326	29331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478664
518	NC_016051	CTA	2	6	29338	29343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478664
519	NC_016051	ATCTAC	2	12	29426	29437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478664
520	NC_016051	GGA	2	6	29497	29502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478664
521	NC_016051	AGG	2	6	29519	29524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478664
522	NC_016051	GGA	2	6	29611	29616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478664
523	NC_016051	GAGG	2	8	29632	29639	25 %	0 %	75 %	0 %	223478664
524	NC_016051	TGC	2	6	29688	29693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478664
525	NC_016051	G	6	6	29709	29714	0 %	0 %	100 %	0 %	223478664
526	NC_016051	TGT	2	6	29715	29720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478664
527	NC_016051	CTTCAT	2	12	29785	29796	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	350525686
528	NC_016051	AGG	2	6	29831	29836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350525686
529	NC_016051	ATA	2	6	29861	29866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350525686
530	NC_016051	AAG	2	6	29888	29893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350525686
531	NC_016051	CTTC	2	8	29968	29975	0 %	50 %	0 %	50 %	350525686
532	NC_016051	CAG	2	6	29998	30003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525686
533	NC_016051	TCG	2	6	30018	30023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525686
534	NC_016051	CCT	2	6	30031	30036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525686
535	NC_016051	AAT	2	6	30055	30060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350525686
536	NC_016051	TGG	2	6	30126	30131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525686
537	NC_016051	TAC	2	6	30176	30181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350525686
538	NC_016051	TCG	2	6	30204	30209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350525686
539	NC_016051	TGG	2	6	30264	30269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350525686
540	NC_016051	CGC	2	6	30376	30381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350525686
541	NC_016051	CA	3	6	30391	30396	50 %	0 %	0 %	50 %	350525686
542	NC_016051	CTT	2	6	30427	30432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525686
543	NC_016051	CGG	2	6	30448	30453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350525686
544	NC_016051	CTC	2	6	30473	30478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350525686
545	NC_016051	TTC	2	6	30560	30565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350525686
546	NC_016051	CGA	2	6	30576	30581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350525686
547	NC_016051	AAT	2	6	30589	30594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350525686
548	NC_016051	AGA	2	6	30706	30711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478529
549	NC_016051	GCG	2	6	30742	30747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478529
550	NC_016051	GCC	2	6	30758	30763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478529
551	NC_016051	ATG	2	6	30801	30806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478529
552	NC_016051	CCCCG	2	10	30812	30821	0 %	0 %	20 %	80 %	223478529
553	NC_016051	ATC	2	6	30879	30884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478529
554	NC_016051	GAT	2	6	30896	30901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478529
555	NC_016051	CGG	2	6	30947	30952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478529
556	NC_016051	CGT	2	6	30974	30979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478529
557	NC_016051	CGAT	2	8	31003	31010	25 %	25 %	25 %	25 %	223478529
558	NC_016051	AG	3	6	31116	31121	50 %	0 %	50 %	0 %	223478529
559	NC_016051	GAA	2	6	31139	31144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478529
560	NC_016051	GGT	2	6	31192	31197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478529
561	NC_016051	GAG	2	6	31247	31252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478982
562	NC_016051	CTC	2	6	31254	31259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478982
563	NC_016051	AGG	2	6	31269	31274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478982
564	NC_016051	AGG	2	6	31299	31304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478982
565	NC_016051	CTC	2	6	31322	31327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478982
566	NC_016051	GA	3	6	31364	31369	50 %	0 %	50 %	0 %	223478982
567	NC_016051	GCGA	2	8	31421	31428	25 %	0 %	50 %	25 %	223478982
568	NC_016051	AGG	2	6	31473	31478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478982
569	NC_016051	TTC	2	6	31628	31633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478982
570	NC_016051	CG	3	6	31683	31688	0 %	0 %	50 %	50 %	223478982
571	NC_016051	AGGA	2	8	31709	31716	50 %	0 %	50 %	0 %	223478982
572	NC_016051	ACG	2	6	31770	31775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478982
573	NC_016051	GGA	2	6	31844	31849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478492
574	NC_016051	GTT	2	6	31901	31906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478492
575	NC_016051	GCA	2	6	31916	31921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478492
576	NC_016051	ATC	2	6	32127	32132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	223478492
577	NC_016051	GCC	2	6	32265	32270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478492
578	NC_016051	GAG	2	6	32298	32303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478492
579	NC_016051	CGG	2	6	32309	32314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	223478492
580	NC_016051	GGA	2	6	32343	32348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478492
581	NC_016051	AGG	2	6	32352	32357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478492
582	NC_016051	GGCGTT	2	12	32478	32489	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	223478492
583	NC_016051	AAG	2	6	32496	32501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478492
584	NC_016051	ACG	2	6	32557	32562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478492
585	NC_016051	AGGA	2	8	32565	32572	50 %	0 %	50 %	0 %	223478492
586	NC_016051	AAGG	2	8	32622	32629	50 %	0 %	50 %	0 %	223478492
587	NC_016051	AGG	2	6	32655	32660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478492
588	NC_016051	AGC	2	6	32692	32697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478492
589	NC_016051	GCC	2	6	32711	32716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478492
590	NC_016051	CGT	2	6	32831	32836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478492
591	NC_016051	GAGCCA	2	12	32882	32893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478492
592	NC_016051	GAG	2	6	32910	32915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478492
593	NC_016051	CTC	2	6	32916	32921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478492
594	NC_016051	TGA	2	6	32994	32999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478492
595	NC_016051	AAG	2	6	33038	33043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478693
596	NC_016051	AAG	2	6	33083	33088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478693
597	NC_016051	GAA	2	6	33163	33168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478693
598	NC_016051	GAC	2	6	33358	33363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478693
599	NC_016051	GTC	2	6	33464	33469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478693
600	NC_016051	CGGA	2	8	33486	33493	25 %	0 %	50 %	25 %	223478693
601	NC_016051	ACC	2	6	33504	33509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478693
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603	NC_016051	AAG	2	6	33566	33571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478693
604	NC_016051	AAG	2	6	33608	33613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478693
605	NC_016051	CCG	2	6	33627	33632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	223478693
606	NC_016051	AAG	2	6	33635	33640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	223478693
607	NC_016051	GCCG	2	8	33649	33656	0 %	0 %	50 %	50 %	223478693
608	NC_016051	GAAG	2	8	33658	33665	50 %	0 %	50 %	0 %	223478693
609	NC_016051	TCC	2	6	33671	33676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478693
610	NC_016051	ACC	2	6	34297	34302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	223478696
611	NC_016051	GGA	2	6	34304	34309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478696
612	NC_016051	GAC	2	6	34347	34352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478696
613	NC_016051	TCG	2	6	34382	34387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478696
614	NC_016051	AGT	2	6	34469	34474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478696
615	NC_016051	CTC	3	9	34485	34493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	223478696
616	NC_016051	GTT	2	6	34630	34635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	223478696
617	NC_016051	CT	3	6	34642	34647	0 %	50 %	0 %	50 %	223478696
618	NC_016051	GTG	2	6	34657	34662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478696
619	NC_016051	TGA	2	6	34665	34670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	223478696
620	NC_016051	GTC	2	6	34672	34677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478696
621	NC_016051	GTG	2	6	34678	34683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	223478696
622	NC_016051	GTC	3	9	34696	34704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478696
623	NC_016051	G	6	6	34710	34715	0 %	0 %	100 %	0 %	223478696
624	NC_016051	GC	3	6	34790	34795	0 %	0 %	50 %	50 %	223478696
625	NC_016051	TCCG	2	8	34821	34828	0 %	25 %	25 %	50 %	223478696
626	NC_016051	TGC	2	6	34922	34927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478696
627	NC_016051	CGA	2	6	34979	34984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478696
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632	NC_016051	TCT	2	6	35324	35329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	223478696
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751	NC_016051	ACCT	2	8	40975	40982	25 %	25 %	0 %	50 %	223478804
752	NC_016051	GAG	2	6	40999	41004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478804
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754	NC_016051	GA	3	6	41119	41124	50 %	0 %	50 %	0 %	223478804
755	NC_016051	GAG	2	6	41131	41136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	223478804
756	NC_016051	TCG	2	6	41156	41161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	223478804
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762	NC_016051	GCA	2	6	41438	41443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	223478804
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878	NC_016051	GAAG	2	8	47795	47802	50 %	0 %	50 %	0 %	223478881
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