MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacter wiegelii Rt8.B1 chromosome

Total Repeats: 55808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015958	AGA	2	6	199901	199906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016627
4002	NC_015958	TAT	2	6	199909	199914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016627
4003	NC_015958	AT	3	6	199966	199971	50 %	50 %	0 %	0 %	345016627
4004	NC_015958	TGTA	2	8	200026	200033	25 %	50 %	25 %	0 %	345016627
4005	NC_015958	AT	3	6	200068	200073	50 %	50 %	0 %	0 %	345016627
4006	NC_015958	GAT	2	6	200099	200104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016627
4007	NC_015958	ATA	2	6	200111	200116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016627
4008	NC_015958	CAGG	2	8	200131	200138	25 %	0 %	50 %	25 %	345016627
4009	NC_015958	AGA	2	6	200170	200175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016627
4010	NC_015958	TTG	2	6	200193	200198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016627
4011	NC_015958	A	7	7	200279	200285	100 %	0 %	0 %	0 %	345016627
4012	NC_015958	AGAA	2	8	200298	200305	75 %	0 %	25 %	0 %	345016627
4013	NC_015958	AAG	2	6	200316	200321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016627
4014	NC_015958	TGG	2	6	200388	200393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345016627
4015	NC_015958	TA	3	6	200442	200447	50 %	50 %	0 %	0 %	345016627
4016	NC_015958	AG	3	6	200450	200455	50 %	0 %	50 %	0 %	345016627
4017	NC_015958	CTA	2	6	200466	200471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016627
4018	NC_015958	AGG	2	6	200479	200484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016627
4019	NC_015958	TATT	2	8	200557	200564	25 %	75 %	0 %	0 %	345016627
4020	NC_015958	GAAG	2	8	200608	200615	50 %	0 %	50 %	0 %	345016627
4021	NC_015958	GAA	2	6	200657	200662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016627
4022	NC_015958	A	6	6	200707	200712	100 %	0 %	0 %	0 %	345016627
4023	NC_015958	TAT	3	9	200713	200721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016627
4024	NC_015958	T	6	6	200817	200822	0 %	100 %	0 %	0 %	345016628
4025	NC_015958	AGA	2	6	200864	200869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016628
4026	NC_015958	AG	3	6	200918	200923	50 %	0 %	50 %	0 %	345016628
4027	NC_015958	A	6	6	200950	200955	100 %	0 %	0 %	0 %	345016628
4028	NC_015958	CTT	2	6	200973	200978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016628
4029	NC_015958	AGA	3	9	201089	201097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016628
4030	NC_015958	CAA	2	6	201162	201167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016628
4031	NC_015958	TAG	2	6	201169	201174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016628
4032	NC_015958	GGT	2	6	201222	201227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345016628
4033	NC_015958	AAT	2	6	201233	201238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016628
4034	NC_015958	TAA	2	6	201244	201249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016628
4035	NC_015958	TAA	2	6	201258	201263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016628
4036	NC_015958	AAG	2	6	202107	202112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016629
4037	NC_015958	AAG	2	6	202128	202133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016629
4038	NC_015958	AT	6	12	202198	202209	50 %	50 %	0 %	0 %	345016629
4039	NC_015958	CTT	2	6	202215	202220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016629
4040	NC_015958	AAGAG	2	10	202228	202237	60 %	0 %	40 %	0 %	345016629
4041	NC_015958	AAT	2	6	202249	202254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016629
4042	NC_015958	CCATTC	2	12	202366	202377	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	345016629
4043	NC_015958	TAG	2	6	202426	202431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016629
4044	NC_015958	CAC	2	6	202479	202484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	345016629
4045	NC_015958	GTA	2	6	202511	202516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016629
4046	NC_015958	TGC	2	6	202538	202543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	345016629
4047	NC_015958	A	6	6	202576	202581	100 %	0 %	0 %	0 %	345016629
4048	NC_015958	AGA	2	6	202585	202590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016629
4049	NC_015958	T	6	6	202634	202639	0 %	100 %	0 %	0 %	345016629
4050	NC_015958	AGT	2	6	202682	202687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016629
4051	NC_015958	AT	3	6	202693	202698	50 %	50 %	0 %	0 %	345016629
4052	NC_015958	TTA	2	6	202714	202719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016629
4053	NC_015958	CAA	2	6	202720	202725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016629
4054	NC_015958	ACCAGA	2	12	204640	204651	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	345016630
4055	NC_015958	GAT	2	6	204656	204661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016630
4056	NC_015958	GTGG	2	8	204791	204798	0 %	25 %	75 %	0 %	345016630
4057	NC_015958	TAG	2	6	204834	204839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016630
4058	NC_015958	TG	3	6	204894	204899	0 %	50 %	50 %	0 %	345016630
4059	NC_015958	AAT	2	6	204910	204915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016630
4060	NC_015958	GGA	2	6	204932	204937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016630
4061	NC_015958	ATGC	2	8	205020	205027	25 %	25 %	25 %	25 %	345016630
4062	NC_015958	AAT	2	6	205099	205104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016630
4063	NC_015958	AGCA	2	8	205156	205163	50 %	0 %	25 %	25 %	345016630
4064	NC_015958	AGA	2	6	205186	205191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016630
4065	NC_015958	GAA	2	6	205259	205264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016630
4066	NC_015958	TTGTAA	2	12	205299	205310	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	345016630
4067	NC_015958	ATA	2	6	205395	205400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016630
4068	NC_015958	ATG	2	6	205485	205490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016630
4069	NC_015958	A	6	6	205519	205524	100 %	0 %	0 %	0 %	345016630
4070	NC_015958	TGA	2	6	205558	205563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016630
4071	NC_015958	AGT	2	6	205609	205614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016630
4072	NC_015958	TA	3	6	205663	205668	50 %	50 %	0 %	0 %	345016631
4073	NC_015958	TAAA	2	8	205672	205679	75 %	25 %	0 %	0 %	345016631
4074	NC_015958	GAA	2	6	205743	205748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016631
4075	NC_015958	AT	3	6	205937	205942	50 %	50 %	0 %	0 %	345016631
4076	NC_015958	CTT	2	6	205951	205956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016631
4077	NC_015958	ATA	2	6	206031	206036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016631
4078	NC_015958	GAT	2	6	206138	206143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016631
4079	NC_015958	GGT	2	6	206151	206156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345016631
4080	NC_015958	TGG	2	6	206213	206218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	345016631
4081	NC_015958	GA	3	6	206265	206270	50 %	0 %	50 %	0 %	345016631
4082	NC_015958	A	7	7	206822	206828	100 %	0 %	0 %	0 %	345016632
4083	NC_015958	AAT	2	6	206830	206835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016632
4084	NC_015958	CAA	2	6	206865	206870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016632
4085	NC_015958	TTG	2	6	206871	206876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016632
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4087	NC_015958	ATT	2	6	206978	206983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016632
4088	NC_015958	A	7	7	207057	207063	100 %	0 %	0 %	0 %	345016632
4089	NC_015958	AGG	2	6	207093	207098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	345016632
4090	NC_015958	AT	3	6	207129	207134	50 %	50 %	0 %	0 %	345016633
4091	NC_015958	TTC	2	6	207158	207163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016633
4092	NC_015958	TATT	2	8	207263	207270	25 %	75 %	0 %	0 %	345016633
4093	NC_015958	TTGG	2	8	207280	207287	0 %	50 %	50 %	0 %	345016633
4094	NC_015958	GCA	2	6	207397	207402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016633
4095	NC_015958	AAT	2	6	207513	207518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016633
4096	NC_015958	AT	3	6	207517	207522	50 %	50 %	0 %	0 %	345016633
4097	NC_015958	ATA	3	9	207568	207576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016633
4098	NC_015958	ATTGA	2	10	207577	207586	40 %	40 %	20 %	0 %	345016633
4099	NC_015958	AAG	2	6	207617	207622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016633
4100	NC_015958	TCT	2	6	207696	207701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	345016633
4101	NC_015958	TAAA	2	8	207719	207726	75 %	25 %	0 %	0 %	345016633
4102	NC_015958	TAA	2	6	207794	207799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016633
4103	NC_015958	ATA	2	6	207839	207844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016633
4104	NC_015958	GTAATG	2	12	207874	207885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016633
4105	NC_015958	TTG	2	6	207896	207901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	345016633
4106	NC_015958	AGC	2	6	207936	207941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016633
4107	NC_015958	CAA	3	9	208019	208027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016633
4108	NC_015958	TAT	2	6	208040	208045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	345016633
4109	NC_015958	ACT	2	6	208090	208095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016633
4110	NC_015958	AGT	2	6	208140	208145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016633
4111	NC_015958	GCG	2	6	208157	208162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	345016633
4112	NC_015958	ATA	2	6	208180	208185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016633
4113	NC_015958	TTCA	2	8	208236	208243	25 %	50 %	0 %	25 %	345016633
4114	NC_015958	AAG	2	6	208256	208261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016633
4115	NC_015958	AAT	2	6	208317	208322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016633
4116	NC_015958	GTA	2	6	208363	208368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016633
4117	NC_015958	ATA	2	6	208369	208374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016633
4118	NC_015958	GAA	2	6	208407	208412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	345016633
4119	NC_015958	TAC	2	6	208414	208419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016633
4120	NC_015958	CGA	2	6	208445	208450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	345016633
4121	NC_015958	AAT	2	6	208458	208463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016633
4122	NC_015958	TAA	2	6	208557	208562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	345016634
4123	NC_015958	CGTTA	2	10	208588	208597	20 %	40 %	20 %	20 %	345016634
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4243	NC_015958	A	6	6	213071	213076	100 %	0 %	0 %	0 %	345016639
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4493	NC_015958	ACT	2	6	224378	224383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016648
4494	NC_015958	CAT	2	6	224420	224425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	345016648
4495	NC_015958	GAT	2	6	224429	224434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	345016648
4496	NC_015958	GAGG	2	8	224452	224459	25 %	0 %	75 %	0 %	345016648
4497	NC_015958	AG	3	6	224467	224472	50 %	0 %	50 %	0 %	345016648
4498	NC_015958	A	6	6	224617	224622	100 %	0 %	0 %	0 %	345016649
4499	NC_015958	A	8	8	224639	224646	100 %	0 %	0 %	0 %	345016649
4500	NC_015958	ACA	2	6	224744	224749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	345016649

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