MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 22113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015714	CAGG	2	8	215919	215926	25 %	0 %	50 %	25 %	338706188
4002	NC_015714	A	6	6	215975	215980	100 %	0 %	0 %	0 %	338706188
4003	NC_015714	A	6	6	215986	215991	100 %	0 %	0 %	0 %	338706188
4004	NC_015714	CG	4	8	215992	215999	0 %	0 %	50 %	50 %	338706188
4005	NC_015714	GAA	2	6	216033	216038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706188
4006	NC_015714	CG	3	6	216047	216052	0 %	0 %	50 %	50 %	338706188
4007	NC_015714	A	6	6	216083	216088	100 %	0 %	0 %	0 %	338706188
4008	NC_015714	GAAG	2	8	216096	216103	50 %	0 %	50 %	0 %	338706188
4009	NC_015714	GGTC	2	8	216170	216177	0 %	25 %	50 %	25 %	338706189
4010	NC_015714	GT	3	6	216189	216194	0 %	50 %	50 %	0 %	338706189
4011	NC_015714	AAG	2	6	216249	216254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706189
4012	NC_015714	GC	3	6	216275	216280	0 %	0 %	50 %	50 %	338706189
4013	NC_015714	GGT	2	6	216372	216377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706190
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4015	NC_015714	CG	3	6	216610	216615	0 %	0 %	50 %	50 %	338706191
4016	NC_015714	GCGT	2	8	216774	216781	0 %	25 %	50 %	25 %	338706191
4017	NC_015714	AGG	2	6	216794	216799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706191
4018	NC_015714	GCT	2	6	216822	216827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706191
4019	NC_015714	TCG	2	6	216836	216841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706191
4020	NC_015714	GCG	2	6	216874	216879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706191
4021	NC_015714	AGC	2	6	216947	216952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706191
4022	NC_015714	TAG	2	6	217073	217078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706191
4023	NC_015714	TCC	2	6	217118	217123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706191
4024	NC_015714	CAGA	2	8	217159	217166	50 %	0 %	25 %	25 %	338706191
4025	NC_015714	ATT	2	6	217322	217327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706192
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4029	NC_015714	CAGC	2	8	217466	217473	25 %	0 %	25 %	50 %	338706192
4030	NC_015714	A	6	6	217474	217479	100 %	0 %	0 %	0 %	338706192
4031	NC_015714	CTAT	2	8	217506	217513	25 %	50 %	0 %	25 %	338706192
4032	NC_015714	A	6	6	217564	217569	100 %	0 %	0 %	0 %	338706192
4033	NC_015714	GAC	2	6	217598	217603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706192
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4035	NC_015714	GAA	2	6	217672	217677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706192
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4037	NC_015714	TAT	2	6	217804	217809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706192
4038	NC_015714	CTG	2	6	217821	217826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706192
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4040	NC_015714	ATT	2	6	217871	217876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706192
4041	NC_015714	G	8	8	217892	217899	0 %	0 %	100 %	0 %	338706192
4042	NC_015714	AAGTC	2	10	217944	217953	40 %	20 %	20 %	20 %	338706192
4043	NC_015714	G	6	6	217975	217980	0 %	0 %	100 %	0 %	338706192
4044	NC_015714	GA	3	6	218080	218085	50 %	0 %	50 %	0 %	338706192
4045	NC_015714	GCG	2	6	218087	218092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706192
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4048	NC_015714	TGA	2	6	218221	218226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706192
4049	NC_015714	TGG	2	6	218314	218319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706192
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4058	NC_015714	CGA	2	6	219028	219033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706192
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4095	NC_015714	GC	3	6	220888	220893	0 %	0 %	50 %	50 %	338706195
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4106	NC_015714	TA	3	6	221295	221300	50 %	50 %	0 %	0 %	338706195
4107	NC_015714	T	7	7	221301	221307	0 %	100 %	0 %	0 %	338706195
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4122	NC_015714	T	7	7	222253	222259	0 %	100 %	0 %	0 %	338706196
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4244	NC_015714	AGAAA	2	10	234103	234112	80 %	0 %	20 %	0 %	338706202
4245	NC_015714	A	7	7	234110	234116	100 %	0 %	0 %	0 %	338706202
4246	NC_015714	ACTA	2	8	234127	234134	50 %	25 %	0 %	25 %	338706202
4247	NC_015714	TG	3	6	234141	234146	0 %	50 %	50 %	0 %	338706202
4248	NC_015714	AGC	2	6	234191	234196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706202
4249	NC_015714	AGGAGA	2	12	234245	234256	50 %	0 %	50 %	0 %	338706202
4250	NC_015714	AGG	2	6	234280	234285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706202
4251	NC_015714	AGC	2	6	234296	234301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706202
4252	NC_015714	AG	3	6	234320	234325	50 %	0 %	50 %	0 %	338706202
4253	NC_015714	ACAT	2	8	234330	234337	50 %	25 %	0 %	25 %	338706202
4254	NC_015714	GCA	2	6	234531	234536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706203
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4256	NC_015714	TGA	2	6	234562	234567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706203
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4258	NC_015714	T	6	6	234712	234717	0 %	100 %	0 %	0 %	338706203
4259	NC_015714	AGT	2	6	234905	234910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706203
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4262	NC_015714	CGG	2	6	234941	234946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706203
4263	NC_015714	GAC	2	6	235007	235012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706203
4264	NC_015714	AAACG	2	10	235034	235043	60 %	0 %	20 %	20 %	338706203
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4271	NC_015714	GAAG	2	8	235318	235325	50 %	0 %	50 %	0 %	338706204
4272	NC_015714	GAAA	2	8	235398	235405	75 %	0 %	25 %	0 %	338706204
4273	NC_015714	AAG	2	6	235439	235444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706204
4274	NC_015714	CCA	2	6	235455	235460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706204
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4278	NC_015714	AGC	2	6	235517	235522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706204
4279	NC_015714	GTAT	2	8	235525	235532	25 %	50 %	25 %	0 %	338706204
4280	NC_015714	AGG	2	6	235536	235541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706204
4281	NC_015714	TCC	2	6	235544	235549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706204
4282	NC_015714	CCT	2	6	235584	235589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706204
4283	NC_015714	A	6	6	235591	235596	100 %	0 %	0 %	0 %	338706204
4284	NC_015714	CAA	2	6	235661	235666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706204
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4340	NC_015714	CGG	2	6	238064	238069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706206
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4349	NC_015714	GCA	2	6	238430	238435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706206
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4354	NC_015714	GGCA	2	8	238646	238653	25 %	0 %	50 %	25 %	338706206
4355	NC_015714	CTG	2	6	238671	238676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706206
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4357	NC_015714	CAG	2	6	238701	238706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706206
4358	NC_015714	GC	3	6	238710	238715	0 %	0 %	50 %	50 %	338706206
4359	NC_015714	CGG	2	6	238741	238746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706206
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4362	NC_015714	GCGGGT	2	12	238971	238982	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	338706207
4363	NC_015714	TGC	2	6	239063	239068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706207
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4367	NC_015714	GCA	2	6	239212	239217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706207
4368	NC_015714	GT	3	6	239258	239263	0 %	50 %	50 %	0 %	338706207
4369	NC_015714	TGCG	2	8	239264	239271	0 %	25 %	50 %	25 %	338706207
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4371	NC_015714	CG	3	6	239388	239393	0 %	0 %	50 %	50 %	338706207
4372	NC_015714	CGTG	2	8	239410	239417	0 %	25 %	50 %	25 %	338706207
4373	NC_015714	CA	3	6	239444	239449	50 %	0 %	0 %	50 %	338706207
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4485	NC_015714	TTCG	2	8	245435	245442	0 %	50 %	25 %	25 %	338706217
4486	NC_015714	GGAAAC	2	12	245523	245534	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338706217
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4488	NC_015714	TGG	2	6	245682	245687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706217
4489	NC_015714	ACGC	2	8	245810	245817	25 %	0 %	25 %	50 %	338706217
4490	NC_015714	GTT	2	6	245869	245874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706217
4491	NC_015714	CTA	2	6	245916	245921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706217
4492	NC_015714	CGG	2	6	245939	245944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706217
4493	NC_015714	CGGA	2	8	245951	245958	25 %	0 %	50 %	25 %	338706217
4494	NC_015714	G	6	6	245993	245998	0 %	0 %	100 %	0 %	338706217
4495	NC_015714	TTTCTG	2	12	246059	246070	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338706217
4496	NC_015714	TC	3	6	246073	246078	0 %	50 %	0 %	50 %	338706217
4497	NC_015714	ATG	3	9	246095	246103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706217
4498	NC_015714	CG	3	6	246170	246175	0 %	0 %	50 %	50 %	338706217
4499	NC_015714	AGA	2	6	246266	246271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706217
4500	NC_015714	CCG	2	6	246284	246289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706217

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