MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 22113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015714	GCG	2	6	189356	189361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706147
3502	NC_015714	GTG	2	6	189449	189454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706147
3503	NC_015714	GTT	2	6	189527	189532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706148
3504	NC_015714	TGA	2	6	189663	189668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706148
3505	NC_015714	TGG	2	6	189705	189710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706148
3506	NC_015714	GGT	2	6	189723	189728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706148
3507	NC_015714	AAG	2	6	189746	189751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706148
3508	NC_015714	AG	3	6	189829	189834	50 %	0 %	50 %	0 %	338706148
3509	NC_015714	TGCTT	2	10	189843	189852	0 %	60 %	20 %	20 %	338706148
3510	NC_015714	TGG	2	6	189872	189877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706148
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3512	NC_015714	AGG	2	6	189916	189921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706148
3513	NC_015714	TGC	2	6	189927	189932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706148
3514	NC_015714	GCGCG	2	10	189946	189955	0 %	0 %	60 %	40 %	338706148
3515	NC_015714	GAAG	2	8	189960	189967	50 %	0 %	50 %	0 %	338706148
3516	NC_015714	ATT	2	6	189970	189975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706148
3517	NC_015714	TGG	3	9	190035	190043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706149
3518	NC_015714	GAT	2	6	190055	190060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706149
3519	NC_015714	TCT	2	6	190074	190079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706149
3520	NC_015714	CCT	2	6	190105	190110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706149
3521	NC_015714	TAGT	2	8	190129	190136	25 %	50 %	25 %	0 %	338706149
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3533	NC_015714	GC	3	6	190796	190801	0 %	0 %	50 %	50 %	338706149
3534	NC_015714	GGTGAG	2	12	190871	190882	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	338706149
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3540	NC_015714	CAT	2	6	191131	191136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706149
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3542	NC_015714	GATAGC	2	12	191309	191320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338706149
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3544	NC_015714	TCC	2	6	191380	191385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706150
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3549	NC_015714	CTG	2	6	191546	191551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706150
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3552	NC_015714	GCG	2	6	191696	191701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706150
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3554	NC_015714	GCCA	2	8	191841	191848	25 %	0 %	25 %	50 %	338706150
3555	NC_015714	A	6	6	191869	191874	100 %	0 %	0 %	0 %	338706150
3556	NC_015714	GAA	2	6	191881	191886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706150
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3565	NC_015714	GAT	2	6	192426	192431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706150
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3622	NC_015714	GA	3	6	195094	195099	50 %	0 %	50 %	0 %	338706152
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3994	NC_015714	GTT	2	6	215577	215582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706187
3995	NC_015714	GAAG	2	8	215600	215607	50 %	0 %	50 %	0 %	338706187
3996	NC_015714	CAC	2	6	215715	215720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706188
3997	NC_015714	GCG	2	6	215745	215750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706188
3998	NC_015714	CG	3	6	215749	215754	0 %	0 %	50 %	50 %	338706188
3999	NC_015714	AG	3	6	215757	215762	50 %	0 %	50 %	0 %	338706188
4000	NC_015714	G	7	7	215886	215892	0 %	0 %	100 %	0 %	338706188

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