MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 22113

< Previous12...33343536373839404142434445Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22001	NC_015714	TGC	2	6	1126346	1126351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706984
22002	NC_015714	TCTG	2	8	1126527	1126534	0 %	50 %	25 %	25 %	338706984
22003	NC_015714	CG	3	6	1126575	1126580	0 %	0 %	50 %	50 %	338706984
22004	NC_015714	TGCC	2	8	1126594	1126601	0 %	25 %	25 %	50 %	338706984
22005	NC_015714	GCT	2	6	1126602	1126607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706984
22006	NC_015714	AGG	2	6	1126654	1126659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706984
22007	NC_015714	T	6	6	1126668	1126673	0 %	100 %	0 %	0 %	338706984
22008	NC_015714	CAG	2	6	1126712	1126717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706985
22009	NC_015714	T	6	6	1126738	1126743	0 %	100 %	0 %	0 %	338706985
22010	NC_015714	T	7	7	1126760	1126766	0 %	100 %	0 %	0 %	338706985
22011	NC_015714	CTC	2	6	1126784	1126789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706985
22012	NC_015714	A	6	6	1126810	1126815	100 %	0 %	0 %	0 %	338706985
22013	NC_015714	AGG	2	6	1126828	1126833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706985
22014	NC_015714	TGT	2	6	1126857	1126862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706986
22015	NC_015714	TGCG	3	12	1126881	1126892	0 %	25 %	50 %	25 %	338706986
22016	NC_015714	ACG	2	6	1126931	1126936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706986
22017	NC_015714	CAC	2	6	1126950	1126955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706986
22018	NC_015714	AC	3	6	1126971	1126976	50 %	0 %	0 %	50 %	338706986
22019	NC_015714	CAT	2	6	1127016	1127021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706986
22020	NC_015714	ACCGC	2	10	1127077	1127086	20 %	0 %	20 %	60 %	338706986
22021	NC_015714	TGC	2	6	1127088	1127093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706986
22022	NC_015714	TC	3	6	1127146	1127151	0 %	50 %	0 %	50 %	338706986
22023	NC_015714	CCTGT	2	10	1127275	1127284	0 %	40 %	20 %	40 %	338706986
22024	NC_015714	CT	3	6	1127295	1127300	0 %	50 %	0 %	50 %	338706986
22025	NC_015714	TC	4	8	1127372	1127379	0 %	50 %	0 %	50 %	338706986
22026	NC_015714	CA	3	6	1127574	1127579	50 %	0 %	0 %	50 %	338706986
22027	NC_015714	CG	3	6	1127633	1127638	0 %	0 %	50 %	50 %	338706986
22028	NC_015714	CTT	2	6	1127648	1127653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706986
22029	NC_015714	CAA	2	6	1127657	1127662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706986
22030	NC_015714	ATC	2	6	1127782	1127787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706986
22031	NC_015714	ACC	2	6	1127932	1127937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706986
22032	NC_015714	A	6	6	1127963	1127968	100 %	0 %	0 %	0 %	338706986
22033	NC_015714	CT	3	6	1128052	1128057	0 %	50 %	0 %	50 %	338706986
22034	NC_015714	CGTG	2	8	1128137	1128144	0 %	25 %	50 %	25 %	338706986
22035	NC_015714	GCAC	2	8	1128241	1128248	25 %	0 %	25 %	50 %	338706986
22036	NC_015714	CA	3	6	1128305	1128310	50 %	0 %	0 %	50 %	338706986
22037	NC_015714	AC	3	6	1128312	1128317	50 %	0 %	0 %	50 %	338706986
22038	NC_015714	TCCA	2	8	1128320	1128327	25 %	25 %	0 %	50 %	338706986
22039	NC_015714	GAA	2	6	1128337	1128342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706986
22040	NC_015714	GC	3	6	1128484	1128489	0 %	0 %	50 %	50 %	338706986
22041	NC_015714	ATG	2	6	1128538	1128543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706986
22042	NC_015714	CA	3	6	1128548	1128553	50 %	0 %	0 %	50 %	338706986
22043	NC_015714	AGC	2	6	1128618	1128623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706986
22044	NC_015714	TTC	2	6	1128675	1128680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706986
22045	NC_015714	CA	3	6	1128752	1128757	50 %	0 %	0 %	50 %	338706986
22046	NC_015714	ATG	2	6	1128850	1128855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706986
22047	NC_015714	ACG	2	6	1128881	1128886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706986
22048	NC_015714	CCG	2	6	1128902	1128907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706986
22049	NC_015714	TGA	2	6	1128968	1128973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706986
22050	NC_015714	T	7	7	1129057	1129063	0 %	100 %	0 %	0 %	338706986
22051	NC_015714	ACA	2	6	1129064	1129069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706986
22052	NC_015714	AGC	2	6	1129086	1129091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706986
22053	NC_015714	CTT	2	6	1129107	1129112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706986
22054	NC_015714	GCA	4	12	1129138	1129149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706986
22055	NC_015714	TCA	2	6	1129210	1129215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706986
22056	NC_015714	A	8	8	1129331	1129338	100 %	0 %	0 %	0 %	338706987
22057	NC_015714	CCG	2	6	1129351	1129356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706987
22058	NC_015714	CAAC	2	8	1129417	1129424	50 %	0 %	0 %	50 %	338706987
22059	NC_015714	CCT	2	6	1129438	1129443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706987
22060	NC_015714	GA	3	6	1129536	1129541	50 %	0 %	50 %	0 %	338706987
22061	NC_015714	ACA	2	6	1129692	1129697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706987
22062	NC_015714	TGAG	2	8	1129775	1129782	25 %	25 %	50 %	0 %	338706987
22063	NC_015714	CAA	2	6	1129802	1129807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706987
22064	NC_015714	TGCAC	2	10	1129840	1129849	20 %	20 %	20 %	40 %	338706987
22065	NC_015714	CAC	2	6	1129851	1129856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706987
22066	NC_015714	ATCCG	2	10	1129995	1130004	20 %	20 %	20 %	40 %	338706987
22067	NC_015714	T	6	6	1130018	1130023	0 %	100 %	0 %	0 %	338706987
22068	NC_015714	GTC	2	6	1130255	1130260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706988
22069	NC_015714	CG	3	6	1130341	1130346	0 %	0 %	50 %	50 %	338706988
22070	NC_015714	TCT	2	6	1130382	1130387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706988
22071	NC_015714	GC	3	6	1130434	1130439	0 %	0 %	50 %	50 %	338706988
22072	NC_015714	AAC	2	6	1130448	1130453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706988
22073	NC_015714	ATA	2	6	1130492	1130497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706988
22074	NC_015714	AGC	2	6	1130618	1130623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706988
22075	NC_015714	T	7	7	1130693	1130699	0 %	100 %	0 %	0 %	338706988
22076	NC_015714	CGTG	2	8	1130946	1130953	0 %	25 %	50 %	25 %	338706989
22077	NC_015714	GGAC	2	8	1130979	1130986	25 %	0 %	50 %	25 %	338706989
22078	NC_015714	GATT	2	8	1131018	1131025	25 %	50 %	25 %	0 %	338706989
22079	NC_015714	A	6	6	1131031	1131036	100 %	0 %	0 %	0 %	338706989
22080	NC_015714	CTA	2	6	1131045	1131050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706989
22081	NC_015714	TGA	2	6	1131068	1131073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706989
22082	NC_015714	TGG	2	6	1131107	1131112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706989
22083	NC_015714	GCA	2	6	1131145	1131150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706989
22084	NC_015714	GAC	2	6	1131340	1131345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706989
22085	NC_015714	TGG	2	6	1131357	1131362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706989
22086	NC_015714	GC	3	6	1131376	1131381	0 %	0 %	50 %	50 %	338706989
22087	NC_015714	GTG	2	6	1131409	1131414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706989
22088	NC_015714	CTT	2	6	1131417	1131422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706989
22089	NC_015714	AGC	2	6	1131585	1131590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706990
22090	NC_015714	TGC	2	6	1131614	1131619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706990
22091	NC_015714	TGCG	2	8	1131637	1131644	0 %	25 %	50 %	25 %	338706990
22092	NC_015714	TTC	2	6	1131710	1131715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706990
22093	NC_015714	GCT	2	6	1131748	1131753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706990
22094	NC_015714	ACC	2	6	1131810	1131815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706990
22095	NC_015714	GT	3	6	1131870	1131875	0 %	50 %	50 %	0 %	338706990
22096	NC_015714	CAGG	2	8	1131884	1131891	25 %	0 %	50 %	25 %	338706990
22097	NC_015714	ACG	2	6	1131918	1131923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706990
22098	NC_015714	CAA	2	6	1131955	1131960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706990
22099	NC_015714	ACT	2	6	1132076	1132081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706990
22100	NC_015714	TGC	2	6	1132225	1132230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706990
22101	NC_015714	GTA	2	6	1132268	1132273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706990
22102	NC_015714	A	6	6	1132539	1132544	100 %	0 %	0 %	0 %	338706990
22103	NC_015714	GC	3	6	1132567	1132572	0 %	0 %	50 %	50 %	338706990
22104	NC_015714	ATT	2	6	1132596	1132601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706990
22105	NC_015714	T	6	6	1132620	1132625	0 %	100 %	0 %	0 %	338706991
22106	NC_015714	AGT	2	6	1132677	1132682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706991
22107	NC_015714	CGTG	2	8	1132775	1132782	0 %	25 %	50 %	25 %	338706991
22108	NC_015714	TGTC	2	8	1132791	1132798	0 %	50 %	25 %	25 %	338706991
22109	NC_015714	T	6	6	1132871	1132876	0 %	100 %	0 %	0 %	338706991
22110	NC_015714	CAAC	2	8	1132908	1132915	50 %	0 %	0 %	50 %	338706991
22111	NC_015714	C	7	7	1132989	1132995	0 %	0 %	0 %	100 %	338706991
22112	NC_015714	A	7	7	1133135	1133141	100 %	0 %	0 %	0 %	338706991
22113	NC_015714	CG	3	6	1133335	1133340	0 %	0 %	50 %	50 %	338706992

< Previous12...33343536373839404142434445Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.