MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 22113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015714	GT	4	8	27497	27504	0 %	50 %	50 %	0 %	338705999
502	NC_015714	GC	4	8	27539	27546	0 %	0 %	50 %	50 %	338705999
503	NC_015714	T	6	6	27576	27581	0 %	100 %	0 %	0 %	338705999
504	NC_015714	GTG	2	6	27695	27700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706000
505	NC_015714	GTT	2	6	27742	27747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706000
506	NC_015714	TGG	2	6	27759	27764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706000
507	NC_015714	TGG	2	6	27769	27774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706000
508	NC_015714	TATTT	2	10	27794	27803	20 %	80 %	0 %	0 %	338706000
509	NC_015714	CTGCG	2	10	27860	27869	0 %	20 %	40 %	40 %	338706000
510	NC_015714	TGCG	2	8	27876	27883	0 %	25 %	50 %	25 %	338706000
511	NC_015714	GT	4	8	27891	27898	0 %	50 %	50 %	0 %	338706000
512	NC_015714	AC	3	6	27902	27907	50 %	0 %	0 %	50 %	338706000
513	NC_015714	GGT	2	6	27942	27947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706000
514	NC_015714	GTA	2	6	28016	28021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706000
515	NC_015714	GT	3	6	28132	28137	0 %	50 %	50 %	0 %	338706000
516	NC_015714	AGTG	2	8	28138	28145	25 %	25 %	50 %	0 %	338706000
517	NC_015714	ATG	2	6	28184	28189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706000
518	NC_015714	T	6	6	28194	28199	0 %	100 %	0 %	0 %	338706000
519	NC_015714	TTA	2	6	28215	28220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706000
520	NC_015714	AT	4	8	28225	28232	50 %	50 %	0 %	0 %	338706000
521	NC_015714	TCA	2	6	28286	28291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706000
522	NC_015714	T	6	6	28334	28339	0 %	100 %	0 %	0 %	338706000
523	NC_015714	G	6	6	28351	28356	0 %	0 %	100 %	0 %	338706000
524	NC_015714	T	6	6	28438	28443	0 %	100 %	0 %	0 %	338706000
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529	NC_015714	TG	3	6	28593	28598	0 %	50 %	50 %	0 %	338706000
530	NC_015714	GTG	2	6	28775	28780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706000
531	NC_015714	TGA	2	6	28818	28823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706000
532	NC_015714	GGT	2	6	28967	28972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706000
533	NC_015714	GCT	2	6	29214	29219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706001
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535	NC_015714	GC	3	6	29298	29303	0 %	0 %	50 %	50 %	338706001
536	NC_015714	GAT	2	6	29337	29342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706001
537	NC_015714	GTT	2	6	29365	29370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706001
538	NC_015714	ATC	2	6	29391	29396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706001
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540	NC_015714	A	7	7	29418	29424	100 %	0 %	0 %	0 %	338706001
541	NC_015714	GGC	2	6	29523	29528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706001
542	NC_015714	A	6	6	29530	29535	100 %	0 %	0 %	0 %	338706001
543	NC_015714	TCT	2	6	29559	29564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706001
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547	NC_015714	ACC	2	6	30026	30031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706002
548	NC_015714	TGCGC	2	10	30048	30057	0 %	20 %	40 %	40 %	338706002
549	NC_015714	AGT	2	6	30062	30067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706002
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552	NC_015714	CAC	2	6	30402	30407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706002
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554	NC_015714	TC	3	6	30478	30483	0 %	50 %	0 %	50 %	338706002
555	NC_015714	AGC	2	6	30545	30550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706002
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557	NC_015714	TGT	2	6	30620	30625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706002
558	NC_015714	GTG	2	6	30649	30654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706002
559	NC_015714	TG	3	6	30718	30723	0 %	50 %	50 %	0 %	338706002
560	NC_015714	TCCAG	2	10	30874	30883	20 %	20 %	20 %	40 %	338706002
561	NC_015714	TTC	2	6	30886	30891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706002
562	NC_015714	TGC	2	6	30901	30906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706002
563	NC_015714	CGT	2	6	31007	31012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706002
564	NC_015714	AAAG	2	8	31022	31029	75 %	0 %	25 %	0 %	338706002
565	NC_015714	CA	3	6	31044	31049	50 %	0 %	0 %	50 %	338706002
566	NC_015714	GT	3	6	31137	31142	0 %	50 %	50 %	0 %	338706002
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571	NC_015714	TCGT	2	8	31364	31371	0 %	50 %	25 %	25 %	338706002
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574	NC_015714	TGGGG	2	10	31432	31441	0 %	20 %	80 %	0 %	338706002
575	NC_015714	GTT	2	6	31449	31454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706002
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577	NC_015714	TGTC	2	8	31504	31511	0 %	50 %	25 %	25 %	338706002
578	NC_015714	GCT	2	6	31550	31555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706002
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583	NC_015714	TGG	2	6	31709	31714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706002
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587	NC_015714	TGC	2	6	31967	31972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706002
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592	NC_015714	GTAC	2	8	32227	32234	25 %	25 %	25 %	25 %	338706002
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595	NC_015714	T	6	6	32386	32391	0 %	100 %	0 %	0 %	338706002
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598	NC_015714	AC	3	6	32526	32531	50 %	0 %	0 %	50 %	338706002
599	NC_015714	TTCA	2	8	32539	32546	25 %	50 %	0 %	25 %	338706002
600	NC_015714	GTTG	2	8	32568	32575	0 %	50 %	50 %	0 %	338706002
601	NC_015714	CTT	2	6	32601	32606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706002
602	NC_015714	AGT	2	6	32673	32678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706002
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609	NC_015714	AG	3	6	33182	33187	50 %	0 %	50 %	0 %	338706003
610	NC_015714	AG	3	6	33191	33196	50 %	0 %	50 %	0 %	338706003
611	NC_015714	GAT	2	6	33217	33222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706003
612	NC_015714	TGA	2	6	33229	33234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706003
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616	NC_015714	TGCG	2	8	33324	33331	0 %	25 %	50 %	25 %	338706003
617	NC_015714	T	7	7	33354	33360	0 %	100 %	0 %	0 %	338706003
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620	NC_015714	GCA	2	6	33505	33510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706003
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626	NC_015714	AAGAT	2	10	33738	33747	60 %	20 %	20 %	0 %	338706003
627	NC_015714	TTC	2	6	33755	33760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706003
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