MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 22113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_015714	TCT	2	6	272954	272959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706238
5003	NC_015714	TGA	2	6	273004	273009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706238
5004	NC_015714	TCC	2	6	273050	273055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706238
5005	NC_015714	GCA	2	6	273061	273066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706238
5006	NC_015714	GCG	2	6	273101	273106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706238
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5009	NC_015714	GTT	2	6	273286	273291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706238
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5011	NC_015714	GC	3	6	273376	273381	0 %	0 %	50 %	50 %	338706238
5012	NC_015714	TGC	2	6	273447	273452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706238
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5016	NC_015714	GGT	2	6	273646	273651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706238
5017	NC_015714	GAA	2	6	273659	273664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706238
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5019	NC_015714	TGC	2	6	273693	273698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706238
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5021	NC_015714	AGG	2	6	273766	273771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706238
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5023	NC_015714	GCAG	2	8	273820	273827	25 %	0 %	50 %	25 %	338706238
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5040	NC_015714	GTC	2	6	274635	274640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706239
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5043	NC_015714	AGATG	2	10	274760	274769	40 %	20 %	40 %	0 %	338706239
5044	NC_015714	TG	3	6	274791	274796	0 %	50 %	50 %	0 %	338706239
5045	NC_015714	CG	3	6	274843	274848	0 %	0 %	50 %	50 %	338706239
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5056	NC_015714	AGGC	2	8	275931	275938	25 %	0 %	50 %	25 %	338706240
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5071	NC_015714	GAA	3	9	276767	276775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706240
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5108	NC_015714	GT	3	6	283624	283629	0 %	50 %	50 %	0 %	338706243
5109	NC_015714	CG	3	6	283639	283644	0 %	0 %	50 %	50 %	338706243
5110	NC_015714	T	6	6	283706	283711	0 %	100 %	0 %	0 %	338706243
5111	NC_015714	AC	3	6	283812	283817	50 %	0 %	0 %	50 %	338706243
5112	NC_015714	TTA	2	6	283926	283931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706243
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5114	NC_015714	CG	3	6	284029	284034	0 %	0 %	50 %	50 %	338706243
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5118	NC_015714	GAA	2	6	284154	284159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706243
5119	NC_015714	TCG	2	6	284182	284187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706243
5120	NC_015714	TGC	2	6	284348	284353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706243
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5122	NC_015714	GGGA	2	8	284406	284413	25 %	0 %	75 %	0 %	338706243
5123	NC_015714	GTA	2	6	284424	284429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706243
5124	NC_015714	ATT	2	6	284461	284466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706243
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5128	NC_015714	CTGT	2	8	284648	284655	0 %	50 %	25 %	25 %	338706244
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5137	NC_015714	TGCGT	2	10	285105	285114	0 %	40 %	40 %	20 %	338706244
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5231	NC_015714	GCA	2	6	290155	290160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706250
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5244	NC_015714	T	7	7	291136	291142	0 %	100 %	0 %	0 %	338706251
5245	NC_015714	CCA	2	6	291185	291190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706251
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5247	NC_015714	GTT	2	6	291236	291241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706251
5248	NC_015714	CAT	2	6	291242	291247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706251
5249	NC_015714	CCA	2	6	291308	291313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706251
5250	NC_015714	TCTGC	2	10	291389	291398	0 %	40 %	20 %	40 %	338706251
5251	NC_015714	CTT	2	6	291443	291448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706251
5252	NC_015714	CGG	2	6	291486	291491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706251
5253	NC_015714	GTA	2	6	291528	291533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706251
5254	NC_015714	TGC	2	6	291583	291588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706251
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5256	NC_015714	TGA	2	6	291689	291694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706251
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5281	NC_015714	TTCT	2	8	292980	292987	0 %	75 %	0 %	25 %	338706252
5282	NC_015714	CGC	2	6	293004	293009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706252
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5285	NC_015714	CAT	2	6	293114	293119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706252
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5290	NC_015714	GGT	2	6	293355	293360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706252
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5300	NC_015714	GAG	2	6	293651	293656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706252
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5341	NC_015714	CG	4	8	295775	295782	0 %	0 %	50 %	50 %	338706254
5342	NC_015714	ATA	2	6	295839	295844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706254
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5349	NC_015714	GC	3	6	296233	296238	0 %	0 %	50 %	50 %	338706254
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5352	NC_015714	GTGG	2	8	296333	296340	0 %	25 %	75 %	0 %	338706254
5353	NC_015714	CGTG	2	8	296529	296536	0 %	25 %	50 %	25 %	338706255
5354	NC_015714	GC	4	8	296596	296603	0 %	0 %	50 %	50 %	338706255
5355	NC_015714	GTTG	2	8	296629	296636	0 %	50 %	50 %	0 %	338706255
5356	NC_015714	TTGAT	2	10	296682	296691	20 %	60 %	20 %	0 %	338706255
5357	NC_015714	GT	3	6	296718	296723	0 %	50 %	50 %	0 %	338706255
5358	NC_015714	TACG	2	8	296752	296759	25 %	25 %	25 %	25 %	338706255
5359	NC_015714	T	7	7	296874	296880	0 %	100 %	0 %	0 %	338706255
5360	NC_015714	TGC	2	6	296899	296904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706255
5361	NC_015714	CTT	2	6	296934	296939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706255
5362	NC_015714	GGT	2	6	296942	296947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706255
5363	NC_015714	TG	3	6	297197	297202	0 %	50 %	50 %	0 %	338706256
5364	NC_015714	CGTGC	2	10	297243	297252	0 %	20 %	40 %	40 %	338706256
5365	NC_015714	GCG	2	6	297291	297296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706256
5366	NC_015714	GC	3	6	297309	297314	0 %	0 %	50 %	50 %	338706256
5367	NC_015714	GCT	2	6	297322	297327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706256
5368	NC_015714	GT	5	10	297352	297361	0 %	50 %	50 %	0 %	338706256
5369	NC_015714	CGA	2	6	297371	297376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706256
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5495	NC_015714	TGC	2	6	303546	303551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706260
5496	NC_015714	AAG	2	6	303568	303573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706260
5497	NC_015714	A	7	7	303604	303610	100 %	0 %	0 %	0 %	338706260
5498	NC_015714	GA	3	6	303690	303695	50 %	0 %	50 %	0 %	338706260
5499	NC_015714	GTG	2	6	303766	303771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706260
5500	NC_015714	CG	3	6	303788	303793	0 %	0 %	50 %	50 %	338706260

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