MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 22113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015714	AGA	2	6	246308	246313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706217
4502	NC_015714	ACC	2	6	246362	246367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706217
4503	NC_015714	AGG	2	6	246539	246544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706217
4504	NC_015714	GAA	2	6	246645	246650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706217
4505	NC_015714	GTGC	2	8	246697	246704	0 %	25 %	50 %	25 %	338706217
4506	NC_015714	GAC	2	6	246750	246755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706217
4507	NC_015714	GCT	2	6	246768	246773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706217
4508	NC_015714	GAAG	2	8	246798	246805	50 %	0 %	50 %	0 %	338706217
4509	NC_015714	TTC	2	6	246813	246818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706217
4510	NC_015714	GGAG	2	8	246879	246886	25 %	0 %	75 %	0 %	338706217
4511	NC_015714	GGT	2	6	246912	246917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706217
4512	NC_015714	GC	3	6	246997	247002	0 %	0 %	50 %	50 %	338706217
4513	NC_015714	TCCT	2	8	247004	247011	0 %	50 %	0 %	50 %	338706217
4514	NC_015714	GAA	2	6	247012	247017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706217
4515	NC_015714	GAT	2	6	247033	247038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706217
4516	NC_015714	GCAG	2	8	247206	247213	25 %	0 %	50 %	25 %	338706217
4517	NC_015714	TGC	2	6	247238	247243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706217
4518	NC_015714	GACG	2	8	247246	247253	25 %	0 %	50 %	25 %	338706217
4519	NC_015714	ATT	2	6	247262	247267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706217
4520	NC_015714	GCA	2	6	247371	247376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706217
4521	NC_015714	CGGCG	2	10	247449	247458	0 %	0 %	60 %	40 %	338706217
4522	NC_015714	GAT	2	6	247492	247497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706217
4523	NC_015714	GAA	2	6	247666	247671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706217
4524	NC_015714	AATT	2	8	247812	247819	50 %	50 %	0 %	0 %	338706218
4525	NC_015714	T	6	6	247850	247855	0 %	100 %	0 %	0 %	338706218
4526	NC_015714	TAC	2	6	247872	247877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
4527	NC_015714	GGAATG	2	12	247881	247892	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338706218
4528	NC_015714	TAC	2	6	248029	248034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
4529	NC_015714	A	6	6	248145	248150	100 %	0 %	0 %	0 %	338706218
4530	NC_015714	GGC	2	6	248203	248208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706218
4531	NC_015714	CGG	2	6	248213	248218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706218
4532	NC_015714	ACCTTG	2	12	248255	248266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706218
4533	NC_015714	TTG	2	6	248273	248278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706218
4534	NC_015714	GAT	2	6	248295	248300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
4535	NC_015714	TGC	2	6	248330	248335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706218
4536	NC_015714	GAT	2	6	248388	248393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
4537	NC_015714	G	6	6	248449	248454	0 %	0 %	100 %	0 %	338706218
4538	NC_015714	ATC	2	6	248548	248553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
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4540	NC_015714	GAAA	2	8	248841	248848	75 %	0 %	25 %	0 %	338706218
4541	NC_015714	TGG	2	6	249002	249007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706218
4542	NC_015714	TG	3	6	249036	249041	0 %	50 %	50 %	0 %	338706218
4543	NC_015714	GGC	2	6	249102	249107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706218
4544	NC_015714	TGT	2	6	249131	249136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706218
4545	NC_015714	TAT	2	6	249211	249216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706218
4546	NC_015714	CT	3	6	249231	249236	0 %	50 %	0 %	50 %	338706218
4547	NC_015714	GGA	2	6	249273	249278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706218
4548	NC_015714	ATG	2	6	249283	249288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
4549	NC_015714	ACT	2	6	249367	249372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
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4551	NC_015714	AATT	2	8	249455	249462	50 %	50 %	0 %	0 %	338706218
4552	NC_015714	CTT	2	6	249546	249551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706218
4553	NC_015714	GAC	2	6	249571	249576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706218
4554	NC_015714	ATC	2	6	249577	249582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
4555	NC_015714	G	6	6	249655	249660	0 %	0 %	100 %	0 %	338706218
4556	NC_015714	CGT	2	6	249690	249695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706218
4557	NC_015714	GAG	2	6	249718	249723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706218
4558	NC_015714	ATG	2	6	249736	249741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
4559	NC_015714	GGAT	2	8	249762	249769	25 %	25 %	50 %	0 %	338706218
4560	NC_015714	ATG	2	6	249784	249789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
4561	NC_015714	GC	3	6	249802	249807	0 %	0 %	50 %	50 %	338706218
4562	NC_015714	ATC	2	6	249874	249879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
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4564	NC_015714	CGT	2	6	250006	250011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706218
4565	NC_015714	TGG	2	6	250034	250039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706218
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4568	NC_015714	ATT	2	6	250105	250110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706218
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4570	NC_015714	CGA	2	6	250206	250211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706218
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4572	NC_015714	GAG	2	6	250289	250294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706218
4573	NC_015714	TG	5	10	250295	250304	0 %	50 %	50 %	0 %	338706218
4574	NC_015714	CAA	2	6	250329	250334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706218
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4578	NC_015714	CG	4	8	250621	250628	0 %	0 %	50 %	50 %	338706218
4579	NC_015714	ACCAC	2	10	250652	250661	40 %	0 %	0 %	60 %	338706218
4580	NC_015714	ATCG	2	8	250708	250715	25 %	25 %	25 %	25 %	338706218
4581	NC_015714	GTA	2	6	250771	250776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
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4584	NC_015714	TGG	2	6	250931	250936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706218
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4586	NC_015714	TGA	2	6	250995	251000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
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4589	NC_015714	GAA	2	6	251056	251061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706218
4590	NC_015714	GC	3	6	251063	251068	0 %	0 %	50 %	50 %	338706218
4591	NC_015714	G	6	6	251134	251139	0 %	0 %	100 %	0 %	338706218
4592	NC_015714	ATT	2	6	251157	251162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706218
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4596	NC_015714	GGCG	2	8	251340	251347	0 %	0 %	75 %	25 %	338706218
4597	NC_015714	TG	3	6	251354	251359	0 %	50 %	50 %	0 %	338706218
4598	NC_015714	TGA	2	6	251423	251428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
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4602	NC_015714	GC	3	6	251629	251634	0 %	0 %	50 %	50 %	338706218
4603	NC_015714	GGC	2	6	251658	251663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706218
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4605	NC_015714	TGA	2	6	251748	251753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
4606	NC_015714	TG	3	6	251756	251761	0 %	50 %	50 %	0 %	338706218
4607	NC_015714	GCG	2	6	251814	251819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706218
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4613	NC_015714	TGA	2	6	252176	252181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706219
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4615	NC_015714	TCTGC	2	10	252205	252214	0 %	40 %	20 %	40 %	338706219
4616	NC_015714	G	6	6	252362	252367	0 %	0 %	100 %	0 %	338706219
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