MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 48646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015578	GAA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996463
2	NC_015578	TAT	2	6	537	542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996463
3	NC_015578	GGA	2	6	717	722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996463
4	NC_015578	CGA	2	6	750	755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996463
5	NC_015578	CAA	2	6	756	761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333996463
6	NC_015578	GCC	2	6	766	771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996463
7	NC_015578	GCC	2	6	775	780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996463
8	NC_015578	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996463
9	NC_015578	ATC	2	6	907	912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996463
10	NC_015578	GAA	2	6	1060	1065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996463
11	NC_015578	AAG	2	6	1240	1245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996463
12	NC_015578	CCA	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996463
13	NC_015578	CAG	3	9	1396	1404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996463
14	NC_015578	ATA	2	6	1453	1458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996463
15	NC_015578	GAA	2	6	1508	1513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996463
16	NC_015578	AGA	2	6	1653	1658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996463
17	NC_015578	TAA	2	6	1738	1743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996463
18	NC_015578	ATT	2	6	1773	1778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996464
19	NC_015578	CTA	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996464
20	NC_015578	TAC	2	6	1897	1902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996464
21	NC_015578	TCC	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996465
22	NC_015578	ATC	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996465
23	NC_015578	ATC	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996465
24	NC_015578	ATA	2	6	2305	2310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996465
25	NC_015578	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996465
26	NC_015578	GAT	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996465
27	NC_015578	CAG	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996465
28	NC_015578	TGA	3	9	2378	2386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996465
29	NC_015578	TTC	2	6	2633	2638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996465
30	NC_015578	CGG	2	6	2772	2777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996465
31	NC_015578	TTC	2	6	2813	2818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996465
32	NC_015578	GGA	2	6	2873	2878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996465
33	NC_015578	CTT	2	6	3005	3010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996465
34	NC_015578	GCT	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996466
35	NC_015578	CTT	2	6	3213	3218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996466
36	NC_015578	GCA	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996466
37	NC_015578	GGA	2	6	3364	3369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996466
38	NC_015578	TCT	2	6	3379	3384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996466
39	NC_015578	TTG	2	6	3429	3434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996466
40	NC_015578	CGG	2	6	3449	3454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996466
41	NC_015578	GGA	2	6	3793	3798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996466
42	NC_015578	CGG	2	6	3800	3805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996466
43	NC_015578	GCG	2	6	3910	3915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996466
44	NC_015578	CGC	2	6	3950	3955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996466
45	NC_015578	TGC	2	6	3984	3989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996466
46	NC_015578	GAC	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996466
47	NC_015578	GCG	3	9	4027	4035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996466
48	NC_015578	CCT	2	6	4036	4041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996466
49	NC_015578	TAT	2	6	4130	4135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996466
50	NC_015578	CTT	2	6	4189	4194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996467
51	NC_015578	TCC	2	6	4252	4257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996467
52	NC_015578	ACC	2	6	4340	4345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996467
53	NC_015578	GCC	2	6	4400	4405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996467
54	NC_015578	GCC	2	6	4455	4460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996467
55	NC_015578	GGA	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996467
56	NC_015578	CGG	2	6	4653	4658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996467
57	NC_015578	CGA	2	6	4680	4685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996467
58	NC_015578	GAA	2	6	4714	4719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996467
59	NC_015578	ATT	2	6	4723	4728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996467
60	NC_015578	GAA	2	6	4758	4763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996468
61	NC_015578	TAT	2	6	4809	4814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996468
62	NC_015578	TGA	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996468
63	NC_015578	AGC	2	6	5461	5466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996468
64	NC_015578	GCC	2	6	5482	5487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996468
65	NC_015578	GCT	2	6	5533	5538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996468
66	NC_015578	TGT	2	6	5691	5696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996468
67	NC_015578	ATT	2	6	5716	5721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996468
68	NC_015578	AGC	2	6	5777	5782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996468
69	NC_015578	CTG	2	6	5862	5867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996468
70	NC_015578	GGC	2	6	5872	5877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996468
71	NC_015578	GAT	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996468
72	NC_015578	CCG	2	6	6182	6187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996469
73	NC_015578	AGC	2	6	6376	6381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996469
74	NC_015578	AGG	2	6	6415	6420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996469
75	NC_015578	AGA	2	6	6511	6516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996469
76	NC_015578	TGG	2	6	6592	6597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996469
77	NC_015578	GTC	2	6	6633	6638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996469
78	NC_015578	TGT	2	6	6650	6655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996469
79	NC_015578	GAT	3	9	6657	6665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996469
80	NC_015578	CAG	2	6	6912	6917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996470
81	NC_015578	CAG	2	6	7032	7037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996470
82	NC_015578	TGG	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996470
83	NC_015578	GCC	2	6	7263	7268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996470
84	NC_015578	GCA	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996470
85	NC_015578	GAT	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996470
86	NC_015578	CTG	2	6	7924	7929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996471
87	NC_015578	TGA	2	6	7958	7963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996471
88	NC_015578	GAA	2	6	8179	8184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996471
89	NC_015578	CAG	2	6	8200	8205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996471
90	NC_015578	TGG	2	6	8267	8272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996471
91	NC_015578	CTG	2	6	8377	8382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996471
92	NC_015578	ATC	2	6	8401	8406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996471
93	NC_015578	GGA	2	6	8424	8429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996471
94	NC_015578	TGG	2	6	8531	8536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996471
95	NC_015578	TCC	2	6	8611	8616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996471
96	NC_015578	GCG	2	6	8744	8749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996471
97	NC_015578	TAA	2	6	8756	8761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996471
98	NC_015578	GAT	2	6	8958	8963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996471
99	NC_015578	CAG	2	6	9028	9033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996471
100	NC_015578	GTG	2	6	9040	9045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996471
101	NC_015578	GGT	2	6	9072	9077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996471
102	NC_015578	TGA	2	6	9084	9089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996471
103	NC_015578	GTC	2	6	9180	9185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996471
104	NC_015578	ATT	2	6	9220	9225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996471
105	NC_015578	GAA	2	6	9280	9285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996471
106	NC_015578	TCC	2	6	9287	9292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996471
107	NC_015578	CTT	2	6	9450	9455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996472
108	NC_015578	AAC	2	6	9463	9468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333996472
109	NC_015578	CGG	2	6	9491	9496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996472
110	NC_015578	CAT	2	6	9504	9509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996472
111	NC_015578	TGG	2	6	9587	9592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996472
112	NC_015578	CGG	2	6	9675	9680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996472
113	NC_015578	TGG	2	6	9866	9871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996472
114	NC_015578	GCG	2	6	9943	9948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996472
115	NC_015578	GGC	2	6	10011	10016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996472
116	NC_015578	GGC	2	6	10035	10040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996472
117	NC_015578	ATC	2	6	10045	10050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996472
118	NC_015578	AGG	2	6	10065	10070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996472
119	NC_015578	GGC	2	6	10111	10116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996472
120	NC_015578	GCG	2	6	10144	10149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996472
121	NC_015578	GAA	2	6	10281	10286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996472
122	NC_015578	TTA	2	6	10364	10369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996473
123	NC_015578	GGT	2	6	10418	10423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996473
124	NC_015578	GAC	2	6	10430	10435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996473
125	NC_015578	TGG	2	6	10596	10601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996473
126	NC_015578	CTG	2	6	10631	10636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996473
127	NC_015578	CGC	4	12	10765	10776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996473
128	NC_015578	CGG	2	6	10810	10815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996473
129	NC_015578	CAT	2	6	10831	10836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996473
130	NC_015578	ACC	2	6	10859	10864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996473
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255	NC_015578	CAT	2	6	21827	21832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996484
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259	NC_015578	CGG	2	6	21989	21994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996484
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