MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 71411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015578	CCA	2	6	196295	196300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996640
3502	NC_015578	TGC	2	6	196328	196333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996640
3503	NC_015578	CAT	2	6	196371	196376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996640
3504	NC_015578	T	7	7	196385	196391	0 %	100 %	0 %	0 %	333996640
3505	NC_015578	ATGCCG	2	12	196492	196503	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333996640
3506	NC_015578	TGT	2	6	196634	196639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996640
3507	NC_015578	TCG	2	6	196663	196668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996640
3508	NC_015578	AAT	2	6	196672	196677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996640
3509	NC_015578	AT	3	6	196826	196831	50 %	50 %	0 %	0 %	333996640
3510	NC_015578	CAT	2	6	196838	196843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996640
3511	NC_015578	AGG	2	6	196855	196860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996640
3512	NC_015578	ATG	2	6	196948	196953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996640
3513	NC_015578	G	6	6	196961	196966	0 %	0 %	100 %	0 %	333996640
3514	NC_015578	TCATT	2	10	197057	197066	20 %	60 %	0 %	20 %	333996640
3515	NC_015578	GCA	2	6	197069	197074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996640
3516	NC_015578	AGG	2	6	197089	197094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996640
3517	NC_015578	TCC	2	6	197119	197124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996640
3518	NC_015578	AAAGA	2	10	197125	197134	80 %	0 %	20 %	0 %	333996640
3519	NC_015578	TTCC	2	8	197139	197146	0 %	50 %	0 %	50 %	333996640
3520	NC_015578	GTC	2	6	197151	197156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996640
3521	NC_015578	ATG	2	6	197215	197220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996640
3522	NC_015578	TTC	2	6	197301	197306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996640
3523	NC_015578	TCG	2	6	197323	197328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996640
3524	NC_015578	T	6	6	197338	197343	0 %	100 %	0 %	0 %	333996640
3525	NC_015578	GCA	2	6	197536	197541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996640
3526	NC_015578	GAA	2	6	197555	197560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996640
3527	NC_015578	AGG	2	6	197624	197629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996640
3528	NC_015578	GGC	2	6	197640	197645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996640
3529	NC_015578	CAG	2	6	197655	197660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996640
3530	NC_015578	AGC	2	6	197683	197688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996640
3531	NC_015578	TCGG	2	8	197768	197775	0 %	25 %	50 %	25 %	333996640
3532	NC_015578	TGC	2	6	197853	197858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996640
3533	NC_015578	TTC	2	6	198051	198056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996640
3534	NC_015578	GCG	2	6	198094	198099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996640
3535	NC_015578	GC	3	6	198139	198144	0 %	0 %	50 %	50 %	333996640
3536	NC_015578	TGTA	2	8	198145	198152	25 %	50 %	25 %	0 %	333996640
3537	NC_015578	ATC	2	6	198156	198161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996640
3538	NC_015578	GTG	2	6	198232	198237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996640
3539	NC_015578	TGC	2	6	198298	198303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996640
3540	NC_015578	TA	3	6	198343	198348	50 %	50 %	0 %	0 %	333996640
3541	NC_015578	CGG	2	6	198350	198355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996640
3542	NC_015578	GTT	2	6	198406	198411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996640
3543	NC_015578	A	6	6	198429	198434	100 %	0 %	0 %	0 %	333996640
3544	NC_015578	TAA	2	6	198461	198466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996640
3545	NC_015578	GAC	2	6	198649	198654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996641
3546	NC_015578	AGGG	2	8	198751	198758	25 %	0 %	75 %	0 %	333996641
3547	NC_015578	CGG	2	6	198883	198888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996641
3548	NC_015578	T	6	6	199107	199112	0 %	100 %	0 %	0 %	333996641
3549	NC_015578	TCA	2	6	199143	199148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996641
3550	NC_015578	GGTG	2	8	199209	199216	0 %	25 %	75 %	0 %	333996641
3551	NC_015578	TCG	2	6	199241	199246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996641
3552	NC_015578	CCGGG	2	10	199263	199272	0 %	0 %	60 %	40 %	333996641
3553	NC_015578	AGG	2	6	199280	199285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996641
3554	NC_015578	TGAT	2	8	199286	199293	25 %	50 %	25 %	0 %	333996641
3555	NC_015578	ATA	2	6	199334	199339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996641
3556	NC_015578	AAG	2	6	199342	199347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996641
3557	NC_015578	T	7	7	199365	199371	0 %	100 %	0 %	0 %	333996641
3558	NC_015578	TAT	2	6	199396	199401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996642
3559	NC_015578	CGG	2	6	199426	199431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996642
3560	NC_015578	T	6	6	199500	199505	0 %	100 %	0 %	0 %	333996642
3561	NC_015578	CGA	2	6	199603	199608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996643
3562	NC_015578	CCG	2	6	199685	199690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996643
3563	NC_015578	CTC	2	6	199701	199706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996643
3564	NC_015578	CCTCCC	2	12	199778	199789	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	333996643
3565	NC_015578	CGG	3	9	199827	199835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996643
3566	NC_015578	C	9	9	199857	199865	0 %	0 %	0 %	100 %	333996643
3567	NC_015578	CAC	2	6	199890	199895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996643
3568	NC_015578	CGG	2	6	199908	199913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996643
3569	NC_015578	GAA	3	9	199922	199930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996643
3570	NC_015578	GAT	3	9	199931	199939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3571	NC_015578	G	6	6	199972	199977	0 %	0 %	100 %	0 %	333996643
3572	NC_015578	CCA	2	6	199997	200002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996643
3573	NC_015578	CGG	2	6	200043	200048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996643
3574	NC_015578	GAA	2	6	200078	200083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996643
3575	NC_015578	CGC	2	6	200116	200121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996643
3576	NC_015578	TCA	2	6	200187	200192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996643
3577	NC_015578	TGA	2	6	200329	200334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3578	NC_015578	GAT	2	6	200354	200359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3579	NC_015578	GGA	3	9	200380	200388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996643
3580	NC_015578	TGA	2	6	200446	200451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3581	NC_015578	TGC	2	6	200455	200460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996643
3582	NC_015578	TGA	2	6	200476	200481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3583	NC_015578	TGA	2	6	200539	200544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3584	NC_015578	TGC	2	6	200548	200553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996643
3585	NC_015578	TGA	2	6	200569	200574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3586	NC_015578	TGA	2	6	200632	200637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3587	NC_015578	GCC	2	6	200642	200647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996643
3588	NC_015578	TGA	2	6	200662	200667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3589	NC_015578	GGC	2	6	200735	200740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996643
3590	NC_015578	TGA	2	6	200779	200784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3591	NC_015578	TTCC	2	8	200809	200816	0 %	50 %	0 %	50 %	333996643
3592	NC_015578	GAT	2	6	200858	200863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3593	NC_015578	ATGG	2	8	200942	200949	25 %	25 %	50 %	0 %	333996643
3594	NC_015578	TTG	2	6	200951	200956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996643
3595	NC_015578	TGA	2	6	200968	200973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3596	NC_015578	GATG	2	8	201031	201038	25 %	25 %	50 %	0 %	333996643
3597	NC_015578	GAA	2	6	201107	201112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996643
3598	NC_015578	AGA	2	6	201172	201177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996643
3599	NC_015578	CGG	2	6	201253	201258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996643
3600	NC_015578	GGA	2	6	201331	201336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996643
3601	NC_015578	GAA	2	6	201416	201421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996643
3602	NC_015578	AGC	2	6	201502	201507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996643
3603	NC_015578	GAAAA	2	10	201560	201569	80 %	0 %	20 %	0 %	333996643
3604	NC_015578	ATC	2	6	201653	201658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996643
3605	NC_015578	GGC	2	6	201667	201672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996643
3606	NC_015578	GAA	2	6	201878	201883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996643
3607	NC_015578	GCA	2	6	201901	201906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996643
3608	NC_015578	A	6	6	201920	201925	100 %	0 %	0 %	0 %	333996643
3609	NC_015578	TCC	2	6	201990	201995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996643
3610	NC_015578	TCT	2	6	202003	202008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996643
3611	NC_015578	TGA	2	6	202021	202026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3612	NC_015578	GGAC	2	8	202030	202037	25 %	0 %	50 %	25 %	333996643
3613	NC_015578	ATA	2	6	202053	202058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996643
3614	NC_015578	TCCC	2	8	202081	202088	0 %	25 %	0 %	75 %	333996643
3615	NC_015578	GAA	2	6	202094	202099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996643
3616	NC_015578	ATGG	2	8	202134	202141	25 %	25 %	50 %	0 %	333996643
3617	NC_015578	GAT	2	6	202162	202167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996643
3618	NC_015578	GCA	2	6	202213	202218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996643
3619	NC_015578	G	6	6	202276	202281	0 %	0 %	100 %	0 %	333996643
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3621	NC_015578	C	6	6	202386	202391	0 %	0 %	0 %	100 %	333996643
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3989	NC_015578	A	6	6	226270	226275	100 %	0 %	0 %	0 %	333996662
3990	NC_015578	C	6	6	226284	226289	0 %	0 %	0 %	100 %	333996662
3991	NC_015578	T	7	7	226345	226351	0 %	100 %	0 %	0 %	333996662
3992	NC_015578	CTG	3	9	226386	226394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996662
3993	NC_015578	CAT	2	6	226515	226520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996663
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3996	NC_015578	A	6	6	226587	226592	100 %	0 %	0 %	0 %	333996663
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3998	NC_015578	CCG	2	6	226886	226891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996664
3999	NC_015578	TTCT	2	8	226920	226927	0 %	75 %	0 %	25 %	333996664
4000	NC_015578	CAG	2	6	226971	226976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996664

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