MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 71411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015578	ATC	2	6	161751	161756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996612
3002	NC_015578	TTC	2	6	161890	161895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996612
3003	NC_015578	GTT	2	6	161924	161929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996612
3004	NC_015578	CCT	2	6	162120	162125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996613
3005	NC_015578	CAG	2	6	162145	162150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996613
3006	NC_015578	GGT	2	6	162156	162161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996613
3007	NC_015578	GCC	2	6	162196	162201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996613
3008	NC_015578	GCGG	2	8	162242	162249	0 %	0 %	75 %	25 %	333996613
3009	NC_015578	T	6	6	162258	162263	0 %	100 %	0 %	0 %	333996613
3010	NC_015578	CGG	2	6	162264	162269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996613
3011	NC_015578	GGC	2	6	162295	162300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996613
3012	NC_015578	TCA	2	6	162339	162344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996613
3013	NC_015578	TCC	2	6	162402	162407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996613
3014	NC_015578	T	6	6	162434	162439	0 %	100 %	0 %	0 %	333996613
3015	NC_015578	TTCTG	2	10	162577	162586	0 %	60 %	20 %	20 %	333996613
3016	NC_015578	CAA	2	6	162609	162614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333996613
3017	NC_015578	GCC	2	6	162675	162680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996613
3018	NC_015578	CTCGC	2	10	162716	162725	0 %	20 %	20 %	60 %	333996613
3019	NC_015578	G	6	6	162761	162766	0 %	0 %	100 %	0 %	333996613
3020	NC_015578	TCC	2	6	162773	162778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996613
3021	NC_015578	GGA	2	6	162801	162806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996613
3022	NC_015578	ATA	2	6	162820	162825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996613
3023	NC_015578	AGTCC	2	10	162850	162859	20 %	20 %	20 %	40 %	333996613
3024	NC_015578	CCG	2	6	162873	162878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996613
3025	NC_015578	CGG	2	6	162942	162947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996613
3026	NC_015578	CCG	2	6	163046	163051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996613
3027	NC_015578	GGAA	2	8	163052	163059	50 %	0 %	50 %	0 %	333996613
3028	NC_015578	GC	3	6	163060	163065	0 %	0 %	50 %	50 %	333996613
3029	NC_015578	CGC	2	6	163113	163118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996613
3030	NC_015578	CCG	2	6	163197	163202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996613
3031	NC_015578	A	6	6	163219	163224	100 %	0 %	0 %	0 %	333996613
3032	NC_015578	CAGG	2	8	163245	163252	25 %	0 %	50 %	25 %	333996613
3033	NC_015578	GCC	2	6	163276	163281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996613
3034	NC_015578	GCCCT	2	10	163377	163386	0 %	20 %	20 %	60 %	333996613
3035	NC_015578	TAT	2	6	163396	163401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996613
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3037	NC_015578	T	6	6	163726	163731	0 %	100 %	0 %	0 %	333996614
3038	NC_015578	TTTA	2	8	163746	163753	25 %	75 %	0 %	0 %	333996614
3039	NC_015578	T	6	6	163762	163767	0 %	100 %	0 %	0 %	333996614
3040	NC_015578	TCC	2	6	163775	163780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996614
3041	NC_015578	GTT	2	6	163852	163857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996614
3042	NC_015578	TGG	2	6	163874	163879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996614
3043	NC_015578	TCA	2	6	163988	163993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996614
3044	NC_015578	G	7	7	164013	164019	0 %	0 %	100 %	0 %	333996614
3045	NC_015578	TACC	2	8	164028	164035	25 %	25 %	0 %	50 %	333996614
3046	NC_015578	TCCT	2	8	164100	164107	0 %	50 %	0 %	50 %	333996614
3047	NC_015578	TTCCGC	2	12	164216	164227	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333996615
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3049	NC_015578	TGA	2	6	164276	164281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996615
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3051	NC_015578	TAT	2	6	164577	164582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996615
3052	NC_015578	CTC	2	6	164589	164594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996615
3053	NC_015578	CTG	2	6	164605	164610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996615
3054	NC_015578	GAT	2	6	164664	164669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996615
3055	NC_015578	CCG	2	6	164690	164695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996615
3056	NC_015578	TTGC	2	8	164697	164704	0 %	50 %	25 %	25 %	333996615
3057	NC_015578	TAA	2	6	164744	164749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996615
3058	NC_015578	TTCA	2	8	164803	164810	25 %	50 %	0 %	25 %	333996615
3059	NC_015578	TA	3	6	164814	164819	50 %	50 %	0 %	0 %	333996615
3060	NC_015578	TCA	2	6	164994	164999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996615
3061	NC_015578	TTC	2	6	165077	165082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996615
3062	NC_015578	CTT	2	6	165117	165122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996615
3063	NC_015578	AAT	2	6	165194	165199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996615
3064	NC_015578	CTGGG	2	10	165214	165223	0 %	20 %	60 %	20 %	333996615
3065	NC_015578	GAT	2	6	165261	165266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996615
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3067	NC_015578	GGC	2	6	165457	165462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996616
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3069	NC_015578	GCGG	2	8	165721	165728	0 %	0 %	75 %	25 %	333996616
3070	NC_015578	GCC	2	6	165736	165741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996616
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3074	NC_015578	TCT	2	6	166135	166140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996617
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3080	NC_015578	AAT	2	6	166458	166463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996617
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3089	NC_015578	TCT	2	6	166904	166909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996618
3090	NC_015578	T	7	7	167046	167052	0 %	100 %	0 %	0 %	333996618
3091	NC_015578	TGA	2	6	167061	167066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996618
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3093	NC_015578	TGC	2	6	167082	167087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996618
3094	NC_015578	GCA	2	6	167097	167102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996618
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3096	NC_015578	CGG	2	6	167208	167213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996618
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3098	NC_015578	AGG	2	6	167237	167242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996618
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3102	NC_015578	TTG	2	6	167387	167392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996618
3103	NC_015578	CTGG	2	8	167482	167489	0 %	25 %	50 %	25 %	333996618
3104	NC_015578	TTC	2	6	167524	167529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996618
3105	NC_015578	CTG	2	6	167601	167606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996618
3106	NC_015578	TTTCTG	2	12	167694	167705	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333996618
3107	NC_015578	TCA	2	6	167918	167923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996618
3108	NC_015578	GAG	2	6	167965	167970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996618
3109	NC_015578	GGCC	2	8	167979	167986	0 %	0 %	50 %	50 %	333996618
3110	NC_015578	TCC	2	6	168014	168019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996618
3111	NC_015578	GCC	2	6	168020	168025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996618
3112	NC_015578	CG	4	8	168044	168051	0 %	0 %	50 %	50 %	333996618
3113	NC_015578	CCTG	2	8	168117	168124	0 %	25 %	25 %	50 %	333996618
3114	NC_015578	GCC	2	6	168144	168149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996618
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3118	NC_015578	GCC	2	6	168296	168301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996618
3119	NC_015578	GCT	2	6	168314	168319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996618
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3123	NC_015578	TGC	2	6	168477	168482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996618
3124	NC_015578	CCG	3	9	168489	168497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996618
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3132	NC_015578	TTC	2	6	168742	168747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996618
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3232	NC_015578	AGC	2	6	175677	175682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996626
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3237	NC_015578	CTA	2	6	175900	175905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996626
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3240	NC_015578	CG	3	6	175981	175986	0 %	0 %	50 %	50 %	333996626
3241	NC_015578	CTA	2	6	176045	176050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996626
3242	NC_015578	A	6	6	176335	176340	100 %	0 %	0 %	0 %	333996627
3243	NC_015578	TGCC	2	8	176343	176350	0 %	25 %	25 %	50 %	333996627
3244	NC_015578	GGC	2	6	176382	176387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996627
3245	NC_015578	GAA	2	6	176481	176486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996627
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3353	NC_015578	ATAA	2	8	188311	188318	75 %	25 %	0 %	0 %	333996634
3354	NC_015578	ATC	2	6	188371	188376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996634
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3357	NC_015578	ATC	2	6	188465	188470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996634
3358	NC_015578	A	6	6	188491	188496	100 %	0 %	0 %	0 %	333996634
3359	NC_015578	T	7	7	188545	188551	0 %	100 %	0 %	0 %	333996634
3360	NC_015578	TCA	2	6	188562	188567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996634
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3362	NC_015578	ACC	2	6	188725	188730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996635
3363	NC_015578	GCCG	2	8	188773	188780	0 %	0 %	50 %	50 %	333996635
3364	NC_015578	TCC	2	6	188839	188844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996635
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3366	NC_015578	TAC	2	6	189183	189188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996635
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3488	NC_015578	TA	3	6	195612	195617	50 %	50 %	0 %	0 %	333996640
3489	NC_015578	CCG	2	6	195652	195657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996640
3490	NC_015578	TCT	2	6	195688	195693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996640
3491	NC_015578	CCG	2	6	195734	195739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996640
3492	NC_015578	GGT	2	6	195771	195776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996640
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3494	NC_015578	GAT	2	6	195939	195944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996640
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3496	NC_015578	GAT	2	6	195984	195989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996640
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