MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema azotonutricium ZAS-9 chromosome

Total Repeats: 65948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015577	TGG	2	6	26783	26788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333993010
502	NC_015577	TAT	2	6	26824	26829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333993010
503	NC_015577	GGC	2	6	26853	26858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333993010
504	NC_015577	TTG	2	6	26876	26881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333993010
505	NC_015577	GAA	2	6	26911	26916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333993010
506	NC_015577	AT	3	6	26935	26940	50 %	50 %	0 %	0 %	333993010
507	NC_015577	GCG	2	6	26980	26985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333993010
508	NC_015577	TGC	2	6	27027	27032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333993010
509	NC_015577	TAC	2	6	27045	27050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333993010
510	NC_015577	CTT	2	6	27051	27056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333993010
511	NC_015577	TGC	2	6	27215	27220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333993010
512	NC_015577	ATG	2	6	27247	27252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333993010
513	NC_015577	ATT	2	6	27253	27258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333993010
514	NC_015577	TGGC	2	8	27263	27270	0 %	25 %	50 %	25 %	333993010
515	NC_015577	AAT	2	6	27274	27279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333993010
516	NC_015577	CTT	2	6	27368	27373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333993010
517	NC_015577	TCC	2	6	27504	27509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333993010
518	NC_015577	AGGCCC	2	12	27521	27532	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333993010
519	NC_015577	TCT	2	6	27542	27547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333993010
520	NC_015577	AAG	2	6	27595	27600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333993010
521	NC_015577	ATT	2	6	27625	27630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333993011
522	NC_015577	TTC	2	6	27631	27636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333993011
523	NC_015577	TTA	2	6	27676	27681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333993011
524	NC_015577	ATT	2	6	27747	27752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333993011
525	NC_015577	GGC	2	6	27803	27808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333993011
526	NC_015577	GCA	2	6	27861	27866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333993011
527	NC_015577	GGC	2	6	27896	27901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333993011
528	NC_015577	GGC	2	6	27959	27964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333993011
529	NC_015577	TTC	2	6	28008	28013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333993011
530	NC_015577	ATG	2	6	28017	28022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333993011
531	NC_015577	CGG	2	6	28058	28063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333993011
532	NC_015577	GAA	2	6	28128	28133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333993011
533	NC_015577	ATA	2	6	28218	28223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333993011
534	NC_015577	TCT	2	6	28253	28258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333993011
535	NC_015577	CGG	2	6	28366	28371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333993011
536	NC_015577	GTTCCT	2	12	28403	28414	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	333993011
537	NC_015577	A	6	6	28549	28554	100 %	0 %	0 %	0 %	333993012
538	NC_015577	GCT	2	6	28575	28580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333993012
539	NC_015577	CAATGA	2	12	28710	28721	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333993012
540	NC_015577	GAATTT	2	12	28732	28743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333993012
541	NC_015577	A	7	7	28797	28803	100 %	0 %	0 %	0 %	333993012
542	NC_015577	GC	3	6	28806	28811	0 %	0 %	50 %	50 %	333993012
543	NC_015577	TCC	2	6	28863	28868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333993013
544	NC_015577	AAT	2	6	28895	28900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333993013
545	NC_015577	GTA	2	6	28938	28943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333993013
546	NC_015577	CGC	2	6	28967	28972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333993013
547	NC_015577	GCC	2	6	28977	28982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333993013
548	NC_015577	CCA	2	6	29005	29010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333993013
549	NC_015577	CAATAC	2	12	29029	29040	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333993013
550	NC_015577	A	7	7	29114	29120	100 %	0 %	0 %	0 %	333993013
551	NC_015577	GGCCA	2	10	29126	29135	20 %	0 %	40 %	40 %	333993013
552	NC_015577	CATT	2	8	29152	29159	25 %	50 %	0 %	25 %	333993013
553	NC_015577	TGG	2	6	29176	29181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333993013
554	NC_015577	TAA	2	6	29260	29265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333993013
555	NC_015577	AT	3	6	29273	29278	50 %	50 %	0 %	0 %	333993013
556	NC_015577	T	6	6	29291	29296	0 %	100 %	0 %	0 %	333993013
557	NC_015577	CCAT	2	8	29475	29482	25 %	25 %	0 %	50 %	333993013
558	NC_015577	ATC	2	6	29629	29634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333993014
559	NC_015577	A	6	6	29681	29686	100 %	0 %	0 %	0 %	333993014
560	NC_015577	GCC	2	6	29695	29700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333993014
561	NC_015577	G	6	6	29707	29712	0 %	0 %	100 %	0 %	333993014
562	NC_015577	TCT	2	6	29729	29734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333993014
563	NC_015577	CAAA	2	8	29738	29745	75 %	0 %	0 %	25 %	333993014
564	NC_015577	GCA	2	6	29753	29758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333993014
565	NC_015577	A	6	6	30003	30008	100 %	0 %	0 %	0 %	333993014
566	NC_015577	GCAG	2	8	30034	30041	25 %	0 %	50 %	25 %	333993014
567	NC_015577	TCA	2	6	30092	30097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333993014
568	NC_015577	CGA	3	9	30159	30167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333993014
569	NC_015577	A	6	6	30167	30172	100 %	0 %	0 %	0 %	333993014
570	NC_015577	AGAA	2	8	30236	30243	75 %	0 %	25 %	0 %	333993014
571	NC_015577	CAC	2	6	30252	30257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333993014
572	NC_015577	GGT	2	6	30363	30368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333993014
573	NC_015577	GAA	2	6	30439	30444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333993014
574	NC_015577	ATC	2	6	30460	30465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333993014
575	NC_015577	CTGC	2	8	30513	30520	0 %	25 %	25 %	50 %	333993014
576	NC_015577	GGC	2	6	30543	30548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333993014
577	NC_015577	TAA	2	6	30695	30700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333993014
578	NC_015577	A	6	6	30699	30704	100 %	0 %	0 %	0 %	333993014
579	NC_015577	CA	3	6	30921	30926	50 %	0 %	0 %	50 %	333993015
580	NC_015577	G	6	6	30984	30989	0 %	0 %	100 %	0 %	333993015
581	NC_015577	ATT	2	6	30996	31001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333993015
582	NC_015577	GA	3	6	31021	31026	50 %	0 %	50 %	0 %	333993015
583	NC_015577	TCA	2	6	31031	31036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333993015
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585	NC_015577	GCC	2	6	31122	31127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333993015
586	NC_015577	GGA	2	6	31179	31184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333993015
587	NC_015577	CATGG	2	10	31230	31239	20 %	20 %	40 %	20 %	333993015
588	NC_015577	TCC	2	6	31300	31305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333993015
589	NC_015577	TCGTCC	2	12	31345	31356	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333993015
590	NC_015577	GC	3	6	31426	31431	0 %	0 %	50 %	50 %	333993015
591	NC_015577	CCG	2	6	31435	31440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333993015
592	NC_015577	TAT	2	6	31448	31453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333993015
593	NC_015577	TAA	2	6	31493	31498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333993015
594	NC_015577	GCA	2	6	31594	31599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333993015
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596	NC_015577	ACA	2	6	31633	31638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333993015
597	NC_015577	A	6	6	31762	31767	100 %	0 %	0 %	0 %	333993015
598	NC_015577	AAT	2	6	32175	32180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333993016
599	NC_015577	AGA	2	6	32186	32191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333993016
600	NC_015577	ATG	2	6	32251	32256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333993016
601	NC_015577	GAATAT	2	12	32307	32318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333993016
602	NC_015577	GGC	2	6	32364	32369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333993016
603	NC_015577	AGA	2	6	32417	32422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333993016
604	NC_015577	AT	3	6	32438	32443	50 %	50 %	0 %	0 %	333993016
605	NC_015577	TAA	2	6	32446	32451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333993016
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607	NC_015577	TGA	2	6	32687	32692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333993017
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609	NC_015577	CTG	2	6	32761	32766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333993017
610	NC_015577	TGGA	2	8	32767	32774	25 %	25 %	50 %	0 %	333993017
611	NC_015577	TCA	2	6	32855	32860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333993017
612	NC_015577	GTGATT	2	12	32895	32906	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333993017
613	NC_015577	CTT	2	6	33015	33020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333993017
614	NC_015577	GGC	2	6	33036	33041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333993017
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620	NC_015577	AG	3	6	33352	33357	50 %	0 %	50 %	0 %	333993018
621	NC_015577	GGC	2	6	33370	33375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333993018
622	NC_015577	GAA	2	6	33379	33384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333993018
623	NC_015577	GGGCG	2	10	33535	33544	0 %	0 %	80 %	20 %	333993018
624	NC_015577	GAA	2	6	33592	33597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333993018
625	NC_015577	CTT	2	6	33598	33603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333993018
626	NC_015577	T	6	6	33602	33607	0 %	100 %	0 %	0 %	333993018
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628	NC_015577	CAG	2	6	33845	33850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333993018
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