MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 1655

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015555	TTGAT	2	10	3761	3770	20 %	60 %	20 %	0 %	333895866
2	NC_015555	TTTAA	2	10	5789	5798	40 %	60 %	0 %	0 %	333895869
3	NC_015555	AAGGG	2	10	7705	7714	40 %	0 %	60 %	0 %	333895870
4	NC_015555	ACTTC	2	10	7961	7970	20 %	40 %	0 %	40 %	333895870
5	NC_015555	AAGGC	2	10	8123	8132	40 %	0 %	40 %	20 %	333895870
6	NC_015555	AAGGT	2	10	10366	10375	40 %	20 %	40 %	0 %	333895871
7	NC_015555	GAAAG	2	10	13145	13154	60 %	0 %	40 %	0 %	333895875
8	NC_015555	ACGAC	2	10	23118	23127	40 %	0 %	20 %	40 %	333895883
9	NC_015555	GATGT	2	10	28656	28665	20 %	40 %	40 %	0 %	333895889
10	NC_015555	TTTTA	2	10	31154	31163	20 %	80 %	0 %	0 %	333895891
11	NC_015555	CAAGC	2	10	31643	31652	40 %	0 %	20 %	40 %	333895891
12	NC_015555	TTACA	2	10	35835	35844	40 %	40 %	0 %	20 %	333895894
13	NC_015555	AAAAG	2	10	36040	36049	80 %	0 %	20 %	0 %	333895894
14	NC_015555	TGAAA	2	10	36292	36301	60 %	20 %	20 %	0 %	333895894
15	NC_015555	AAATT	2	10	37144	37153	60 %	40 %	0 %	0 %	333895895
16	NC_015555	AATCA	2	10	41886	41895	60 %	20 %	0 %	20 %	333895897
17	NC_015555	AATAG	2	10	43387	43396	60 %	20 %	20 %	0 %	333895898
18	NC_015555	TTAAG	2	10	45344	45353	40 %	40 %	20 %	0 %	333895901
19	NC_015555	ATACA	2	10	47195	47204	60 %	20 %	0 %	20 %	333895902
20	NC_015555	GATGG	2	10	48673	48682	20 %	20 %	60 %	0 %	333895904
21	NC_015555	GAAAA	2	10	49380	49389	80 %	0 %	20 %	0 %	333895904
22	NC_015555	GACGA	2	10	56344	56353	40 %	0 %	40 %	20 %	333895909
23	NC_015555	ATAAA	2	10	62007	62016	80 %	20 %	0 %	0 %	333895916
24	NC_015555	ATTAC	2	10	67931	67940	40 %	40 %	0 %	20 %	333895919
25	NC_015555	GTCAG	2	10	69243	69252	20 %	20 %	40 %	20 %	333895920
26	NC_015555	ACAGA	2	10	72349	72358	60 %	0 %	20 %	20 %	333895923
27	NC_015555	AAATG	2	10	72369	72378	60 %	20 %	20 %	0 %	333895923
28	NC_015555	TTTCG	2	10	74518	74527	0 %	60 %	20 %	20 %	333895924
29	NC_015555	AAATT	2	10	75011	75020	60 %	40 %	0 %	0 %	333895925
30	NC_015555	TTTAC	2	10	78382	78391	20 %	60 %	0 %	20 %	333895928
31	NC_015555	ATAAA	2	10	81232	81241	80 %	20 %	0 %	0 %	333895930
32	NC_015555	GTCAA	2	10	85807	85816	40 %	20 %	20 %	20 %	333895931
33	NC_015555	GATAA	2	10	86391	86400	60 %	20 %	20 %	0 %	333895932
34	NC_015555	CATAT	2	10	87030	87039	40 %	40 %	0 %	20 %	333895934
35	NC_015555	GATAG	2	10	87677	87686	40 %	20 %	40 %	0 %	333895934
36	NC_015555	AATAA	2	10	89390	89399	80 %	20 %	0 %	0 %	333895937
37	NC_015555	TAAAG	2	10	91525	91534	60 %	20 %	20 %	0 %	333895939
38	NC_015555	TTGAA	2	10	95476	95485	40 %	40 %	20 %	0 %	333895943
39	NC_015555	TGCTG	2	10	96617	96626	0 %	40 %	40 %	20 %	333895944
40	NC_015555	TATAC	2	10	98513	98522	40 %	40 %	0 %	20 %	333895946
41	NC_015555	TTCAC	2	10	98680	98689	20 %	40 %	0 %	40 %	333895946
42	NC_015555	TTTAC	2	10	101738	101747	20 %	60 %	0 %	20 %	333895950
43	NC_015555	GACGA	2	10	103722	103731	40 %	0 %	40 %	20 %	333895951
44	NC_015555	ATTCA	2	10	104805	104814	40 %	40 %	0 %	20 %	333895952
45	NC_015555	GTATC	2	10	105090	105099	20 %	40 %	20 %	20 %	333895953
46	NC_015555	AAAGA	2	10	110322	110331	80 %	0 %	20 %	0 %	333895959
47	NC_015555	TAATC	2	10	110538	110547	40 %	40 %	0 %	20 %	333895959
48	NC_015555	TATGA	2	10	111100	111109	40 %	40 %	20 %	0 %	333895959
49	NC_015555	ATTTA	2	10	114531	114540	40 %	60 %	0 %	0 %	333895964
50	NC_015555	TATGA	2	10	119643	119652	40 %	40 %	20 %	0 %	333895969
51	NC_015555	TTAGG	2	10	119880	119889	20 %	40 %	40 %	0 %	333895969
52	NC_015555	AGTGA	2	10	119941	119950	40 %	20 %	40 %	0 %	333895970
53	NC_015555	GAGTT	2	10	120152	120161	20 %	40 %	40 %	0 %	333895970
54	NC_015555	CGGTG	2	10	126119	126128	0 %	20 %	60 %	20 %	333895977
55	NC_015555	CGCAT	2	10	129878	129887	20 %	20 %	20 %	40 %	333895981
56	NC_015555	AGGAA	2	10	134752	134761	60 %	0 %	40 %	0 %	333895984
57	NC_015555	TAAAA	2	10	137099	137108	80 %	20 %	0 %	0 %	333895986
58	NC_015555	TGAAT	2	10	137781	137790	40 %	40 %	20 %	0 %	333895987
59	NC_015555	AAATT	2	10	142526	142535	60 %	40 %	0 %	0 %	333895991
60	NC_015555	TGAAT	2	10	144558	144567	40 %	40 %	20 %	0 %	333895992
61	NC_015555	ATCCC	2	10	145890	145899	20 %	20 %	0 %	60 %	333895993
62	NC_015555	GAAAA	2	10	146501	146510	80 %	0 %	20 %	0 %	333895995
63	NC_015555	CTTAA	2	10	149275	149284	40 %	40 %	0 %	20 %	333895999
64	NC_015555	ATGAG	2	10	149507	149516	40 %	20 %	40 %	0 %	333895999
65	NC_015555	ATGAA	2	10	152499	152508	60 %	20 %	20 %	0 %	333896001
66	NC_015555	AGACA	2	10	155782	155791	60 %	0 %	20 %	20 %	333896005
67	NC_015555	GAAGA	2	10	156328	156337	60 %	0 %	40 %	0 %	333896005
68	NC_015555	TTGAT	2	10	156686	156695	20 %	60 %	20 %	0 %	333896006
69	NC_015555	AAAGA	2	10	157331	157340	80 %	0 %	20 %	0 %	333896007
70	NC_015555	AGACG	2	10	158088	158097	40 %	0 %	40 %	20 %	333896007
71	NC_015555	CTAAT	2	10	158316	158325	40 %	40 %	0 %	20 %	333896007
72	NC_015555	TAAAA	2	10	158630	158639	80 %	20 %	0 %	0 %	333896007
73	NC_015555	AACAA	2	10	158888	158897	80 %	0 %	0 %	20 %	333896008
74	NC_015555	GTGAT	2	10	160061	160070	20 %	40 %	40 %	0 %	333896008
75	NC_015555	AGGGA	2	10	160806	160815	40 %	0 %	60 %	0 %	333896009
76	NC_015555	AGTTG	2	10	161945	161954	20 %	40 %	40 %	0 %	333896011
77	NC_015555	TAAAA	2	10	162041	162050	80 %	20 %	0 %	0 %	333896011
78	NC_015555	GCAGA	2	10	162064	162073	40 %	0 %	40 %	20 %	333896011
79	NC_015555	AAAAG	2	10	168313	168322	80 %	0 %	20 %	0 %	333896016
80	NC_015555	TTGGG	2	10	172329	172338	0 %	40 %	60 %	0 %	333896021
81	NC_015555	CTTTA	2	10	172799	172808	20 %	60 %	0 %	20 %	333896021
82	NC_015555	AATAA	2	10	175402	175411	80 %	20 %	0 %	0 %	333896023
83	NC_015555	CATAC	2	10	176360	176369	40 %	20 %	0 %	40 %	333896024
84	NC_015555	GGGAA	2	10	176854	176863	40 %	0 %	60 %	0 %	333896025
85	NC_015555	CTATT	2	10	178270	178279	20 %	60 %	0 %	20 %	333896026
86	NC_015555	AATTT	2	10	179952	179961	40 %	60 %	0 %	0 %	333896027
87	NC_015555	GCAAA	2	10	180118	180127	60 %	0 %	20 %	20 %	333896027
88	NC_015555	TGAAT	2	10	181103	181112	40 %	40 %	20 %	0 %	333896029
89	NC_015555	TAAGA	2	10	182656	182665	60 %	20 %	20 %	0 %	333896030
90	NC_015555	ATGGA	2	10	183985	183994	40 %	20 %	40 %	0 %	333896031
91	NC_015555	GATTA	2	10	184057	184066	40 %	40 %	20 %	0 %	333896031
92	NC_015555	AGAAT	2	10	185286	185295	60 %	20 %	20 %	0 %	333896032
93	NC_015555	GCTTG	2	10	185701	185710	0 %	40 %	40 %	20 %	333896033
94	NC_015555	ATTAT	2	10	185828	185837	40 %	60 %	0 %	0 %	333896033
95	NC_015555	ACAAT	2	10	188251	188260	60 %	20 %	0 %	20 %	333896035
96	NC_015555	GCGAT	2	10	194545	194554	20 %	20 %	40 %	20 %	333896041
97	NC_015555	TTTGT	2	10	200285	200294	0 %	80 %	20 %	0 %	333896046
98	NC_015555	GATGG	2	10	201054	201063	20 %	20 %	60 %	0 %	333896047
99	NC_015555	GAAAA	2	10	201761	201770	80 %	0 %	20 %	0 %	333896047
100	NC_015555	ATAAA	2	10	202472	202481	80 %	20 %	0 %	0 %	333896048
101	NC_015555	ATGAG	2	10	203033	203042	40 %	20 %	40 %	0 %	333896048
102	NC_015555	AAAGT	2	10	204424	204433	60 %	20 %	20 %	0 %	333896050
103	NC_015555	GTTAA	2	10	205308	205317	40 %	40 %	20 %	0 %	333896052
104	NC_015555	AAAAG	2	10	207242	207251	80 %	0 %	20 %	0 %	333896052
105	NC_015555	TAAGT	2	10	208460	208469	40 %	40 %	20 %	0 %	333896052
106	NC_015555	CATCG	2	10	212214	212223	20 %	20 %	20 %	40 %	333896057
107	NC_015555	TTCTG	2	10	212480	212489	0 %	60 %	20 %	20 %	333896057
108	NC_015555	GCAAA	2	10	216611	216620	60 %	0 %	20 %	20 %	333896060
109	NC_015555	TTCAT	2	10	218311	218320	20 %	60 %	0 %	20 %	333896062
110	NC_015555	AAATA	2	10	218355	218364	80 %	20 %	0 %	0 %	333896062
111	NC_015555	ATCAA	2	10	219884	219893	60 %	20 %	0 %	20 %	333896063
112	NC_015555	AAAGC	2	10	221608	221617	60 %	0 %	20 %	20 %	333896064
113	NC_015555	AGGGC	2	10	221853	221862	20 %	0 %	60 %	20 %	333896064
114	NC_015555	AATCA	2	10	221916	221925	60 %	20 %	0 %	20 %	333896064
115	NC_015555	AAAAG	2	10	223547	223556	80 %	0 %	20 %	0 %	333896065
116	NC_015555	TAAAA	2	10	224579	224588	80 %	20 %	0 %	0 %	333896065
117	NC_015555	AAAAG	2	10	225028	225037	80 %	0 %	20 %	0 %	333896066
118	NC_015555	AGTGT	2	10	226323	226332	20 %	40 %	40 %	0 %	333896068
119	NC_015555	TTGCT	2	10	233866	233875	0 %	60 %	20 %	20 %	333896074
120	NC_015555	AATTT	2	10	233986	233995	40 %	60 %	0 %	0 %	333896074
121	NC_015555	CCAAA	2	10	236022	236031	60 %	0 %	0 %	40 %	333896075
122	NC_015555	ATTCT	2	10	236440	236449	20 %	60 %	0 %	20 %	333896076
123	NC_015555	TAACT	2	10	237422	237431	40 %	40 %	0 %	20 %	333896076
124	NC_015555	TGGAG	2	10	238625	238634	20 %	20 %	60 %	0 %	333896077
125	NC_015555	TGATT	2	10	238904	238913	20 %	60 %	20 %	0 %	333896077
126	NC_015555	GACAT	2	10	239046	239055	40 %	20 %	20 %	20 %	333896077
127	NC_015555	GAGTA	2	10	239673	239682	40 %	20 %	40 %	0 %	333896079
128	NC_015555	ATTCT	2	10	242969	242978	20 %	60 %	0 %	20 %	333896083
129	NC_015555	TCTTA	2	10	245484	245493	20 %	60 %	0 %	20 %	333896087
130	NC_015555	AAACA	2	10	247339	247348	80 %	0 %	0 %	20 %	333896088
131	NC_015555	AGGGC	2	10	250111	250120	20 %	0 %	60 %	20 %	333896090
132	NC_015555	TAAAA	2	10	253852	253861	80 %	20 %	0 %	0 %	333896094
133	NC_015555	GAAAT	2	10	255522	255531	60 %	20 %	20 %	0 %	333896095
134	NC_015555	GAAAA	2	10	260468	260477	80 %	0 %	20 %	0 %	333896098
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