MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 31420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015555	ACC	2	6	238	243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333895863
2	NC_015555	ATA	2	6	334	339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895863
3	NC_015555	GCA	2	6	370	375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895863
4	NC_015555	GAA	3	9	424	432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895863
5	NC_015555	TGT	2	6	525	530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895863
6	NC_015555	CGC	2	6	555	560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333895863
7	NC_015555	GAC	2	6	748	753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895863
8	NC_015555	GAA	2	6	760	765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895863
9	NC_015555	GAC	2	6	805	810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895863
10	NC_015555	AGG	2	6	842	847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333895863
11	NC_015555	ATA	2	6	892	897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895863
12	NC_015555	CCT	2	6	913	918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333895863
13	NC_015555	CCA	2	6	988	993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333895863
14	NC_015555	TAA	2	6	1121	1126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895863
15	NC_015555	ATA	2	6	1198	1203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895863
16	NC_015555	AAG	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895863
17	NC_015555	TAC	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895863
18	NC_015555	GAA	2	6	1381	1386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895863
19	NC_015555	GAA	2	6	1474	1479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895863
20	NC_015555	ATT	2	6	1759	1764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895864
21	NC_015555	ACC	2	6	1805	1810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333895864
22	NC_015555	ACA	2	6	1848	1853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333895864
23	NC_015555	TAC	2	6	1867	1872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895864
24	NC_015555	GTA	2	6	1896	1901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
25	NC_015555	GTT	2	6	1934	1939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895864
26	NC_015555	GAT	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
27	NC_015555	TGA	2	6	2002	2007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
28	NC_015555	TTC	2	6	2062	2067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895864
29	NC_015555	TGA	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
30	NC_015555	TAA	2	6	2094	2099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895864
31	NC_015555	AGA	2	6	2124	2129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895864
32	NC_015555	AGA	2	6	2281	2286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895864
33	NC_015555	GAT	2	6	2306	2311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
34	NC_015555	TAC	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895864
35	NC_015555	TGA	3	9	2371	2379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
36	NC_015555	GAT	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
37	NC_015555	TTG	2	6	2555	2560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895864
38	NC_015555	ATC	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895864
39	NC_015555	ATA	2	6	2780	2785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895864
40	NC_015555	AGA	2	6	2794	2799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895864
41	NC_015555	TGA	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895864
42	NC_015555	ATG	2	6	2861	2866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895865
43	NC_015555	TGG	2	6	2938	2943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895865
44	NC_015555	TTG	2	6	3125	3130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895866
45	NC_015555	CTG	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895866
46	NC_015555	TTA	2	6	3238	3243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895866
47	NC_015555	ATT	3	9	3302	3310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895866
48	NC_015555	GAA	2	6	3340	3345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895866
49	NC_015555	AAG	2	6	3498	3503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895866
50	NC_015555	ATA	2	6	3556	3561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895866
51	NC_015555	ACA	2	6	3566	3571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333895866
52	NC_015555	ATT	2	6	3679	3684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895866
53	NC_015555	AGA	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895866
54	NC_015555	AAT	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895866
55	NC_015555	AAT	2	6	3778	3783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895866
56	NC_015555	TGA	2	6	3798	3803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895866
57	NC_015555	GAT	2	6	3898	3903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895866
58	NC_015555	CAG	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895866
59	NC_015555	TAA	2	6	4001	4006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895866
60	NC_015555	TGA	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895866
61	NC_015555	AGG	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333895866
62	NC_015555	GTG	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895867
63	NC_015555	AAT	2	6	4249	4254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895867
64	NC_015555	GAA	3	9	4316	4324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895867
65	NC_015555	ACA	2	6	4350	4355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333895867
66	NC_015555	TAA	2	6	4368	4373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895867
67	NC_015555	TCT	2	6	4680	4685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895868
68	NC_015555	ATT	2	6	4688	4693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895868
69	NC_015555	TAT	3	9	4808	4816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895868
70	NC_015555	ATC	2	6	4824	4829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895868
71	NC_015555	ATT	2	6	4976	4981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895868
72	NC_015555	ATC	2	6	5000	5005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895868
73	NC_015555	GCC	3	9	5033	5041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333895868
74	NC_015555	TCT	2	6	5129	5134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895868
75	NC_015555	TTA	2	6	5143	5148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895868
76	NC_015555	AGT	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895868
77	NC_015555	AGT	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895869
78	NC_015555	ATG	2	6	5256	5261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895869
79	NC_015555	TTC	2	6	5287	5292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895869
80	NC_015555	TCT	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895869
81	NC_015555	TCT	2	6	5393	5398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895869
82	NC_015555	ACA	2	6	5417	5422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333895869
83	NC_015555	TAA	2	6	5518	5523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895869
84	NC_015555	TAT	2	6	5596	5601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895869
85	NC_015555	GTT	2	6	5656	5661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895869
86	NC_015555	TTG	2	6	5706	5711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895869
87	NC_015555	TCT	2	6	5810	5815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895869
88	NC_015555	AGT	3	9	5877	5885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895869
89	NC_015555	GTA	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895869
90	NC_015555	AAG	2	6	6039	6044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895869
91	NC_015555	AAG	2	6	6070	6075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895869
92	NC_015555	ACT	2	6	6338	6343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895869
93	NC_015555	GAC	2	6	6353	6358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895869
94	NC_015555	GTA	2	6	6386	6391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895869
95	NC_015555	ATG	2	6	6495	6500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895869
96	NC_015555	CTA	2	6	6546	6551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895869
97	NC_015555	ATG	2	6	6768	6773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895870
98	NC_015555	CAG	2	6	6856	6861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895870
99	NC_015555	TAG	2	6	6891	6896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895870
100	NC_015555	TGA	2	6	6907	6912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895870
101	NC_015555	ATT	2	6	6947	6952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895870
102	NC_015555	GAT	2	6	6980	6985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895870
103	NC_015555	TAC	2	6	7053	7058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895870
104	NC_015555	GGT	2	6	7064	7069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895870
105	NC_015555	TGG	2	6	7099	7104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895870
106	NC_015555	AGT	2	6	7126	7131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895870
107	NC_015555	TTG	2	6	7374	7379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895870
108	NC_015555	AGA	2	6	7396	7401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895870
109	NC_015555	AAG	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895870
110	NC_015555	GGC	2	6	7592	7597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333895870
111	NC_015555	CAT	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895870
112	NC_015555	GGA	2	6	7843	7848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333895870
113	NC_015555	CTG	2	6	7890	7895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895870
114	NC_015555	AGC	2	6	7909	7914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895870
115	NC_015555	AAG	2	6	7936	7941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895870
116	NC_015555	TTG	2	6	8025	8030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895870
117	NC_015555	TGA	2	6	8152	8157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895870
118	NC_015555	GAT	2	6	8167	8172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895870
119	NC_015555	GTC	2	6	8234	8239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895870
120	NC_015555	CTT	2	6	8285	8290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895870
121	NC_015555	CCA	2	6	8351	8356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333895870
122	NC_015555	TAC	2	6	8387	8392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895870
123	NC_015555	AGC	2	6	8490	8495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895870
124	NC_015555	TAC	2	6	8503	8508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895870
125	NC_015555	TGA	2	6	8548	8553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895870
126	NC_015555	TGA	2	6	8566	8571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895870
127	NC_015555	GAA	2	6	8697	8702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895871
128	NC_015555	AGA	2	6	8726	8731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895871
129	NC_015555	GCT	2	6	9036	9041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895871
130	NC_015555	TTC	2	6	9160	9165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895871
131	NC_015555	TTA	2	6	9183	9188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895871
132	NC_015555	CTA	2	6	9223	9228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895871
133	NC_015555	TCC	2	6	9233	9238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333895871
134	NC_015555	GGT	2	6	9345	9350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895871
135	NC_015555	ATA	2	6	9405	9410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895871
136	NC_015555	GTC	2	6	9624	9629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895871
137	NC_015555	GCA	2	6	9659	9664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895871
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139	NC_015555	ATC	2	6	9748	9753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895871
140	NC_015555	GAA	2	6	9801	9806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895871
141	NC_015555	TGA	2	6	9851	9856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895871
142	NC_015555	GAA	2	6	9899	9904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895871
143	NC_015555	AGA	2	6	9994	9999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895871
144	NC_015555	AGA	2	6	10001	10006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895871
145	NC_015555	ATA	2	6	10080	10085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895871
146	NC_015555	TCA	2	6	10119	10124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895871
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148	NC_015555	AGA	2	6	10151	10156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895871
149	NC_015555	TGT	2	6	10196	10201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895871
150	NC_015555	GTG	2	6	10264	10269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895871
151	NC_015555	TAA	2	6	10435	10440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895871
152	NC_015555	AAT	2	6	10538	10543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895871
153	NC_015555	CGA	2	6	10559	10564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895871
154	NC_015555	TGA	2	6	10607	10612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895871
155	NC_015555	AAT	2	6	10658	10663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895871
156	NC_015555	GAT	2	6	10764	10769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895871
157	NC_015555	TGT	2	6	10772	10777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895871
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159	NC_015555	AAG	2	6	10841	10846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895871
160	NC_015555	AAT	2	6	10889	10894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895871
161	NC_015555	TAC	2	6	11033	11038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895871
162	NC_015555	TGA	2	6	11050	11055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895871
163	NC_015555	TGA	2	6	11060	11065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895871
164	NC_015555	GTT	2	6	11076	11081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895871
165	NC_015555	ATG	2	6	11101	11106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895871
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169	NC_015555	AAG	2	6	11523	11528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895872
170	NC_015555	TAG	2	6	11553	11558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895872
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173	NC_015555	TCT	3	9	11746	11754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895873
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181	NC_015555	TTA	2	6	12802	12807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895874
182	NC_015555	CAT	2	6	12893	12898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895874
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232	NC_015555	ATA	2	6	16268	16273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895877
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237	NC_015555	AGC	2	6	16498	16503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895877
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239	NC_015555	TAA	2	6	16599	16604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895878
240	NC_015555	TGC	2	6	16645	16650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895878
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247	NC_015555	GGC	2	6	17165	17170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333895879
248	NC_015555	AGA	2	6	17212	17217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895879
249	NC_015555	TTA	2	6	17243	17248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895879
250	NC_015555	GGT	2	6	17258	17263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895879
251	NC_015555	TTG	2	6	17430	17435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895879
252	NC_015555	GCG	2	6	17567	17572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333895879
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254	NC_015555	TCA	2	6	17624	17629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895879
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