MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 50453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015555	CTA	2	6	78259	78264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895928
1502	NC_015555	ATG	2	6	78363	78368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895928
1503	NC_015555	TTTAC	2	10	78382	78391	20 %	60 %	0 %	20 %	333895928
1504	NC_015555	TGT	2	6	78443	78448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895928
1505	NC_015555	AAT	2	6	78534	78539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895928
1506	NC_015555	TTG	2	6	78578	78583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895928
1507	NC_015555	TGT	2	6	78679	78684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895929
1508	NC_015555	GCC	2	6	78862	78867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333895929
1509	NC_015555	AAT	2	6	78934	78939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895929
1510	NC_015555	ATA	2	6	78950	78955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895929
1511	NC_015555	GT	3	6	78956	78961	0 %	50 %	50 %	0 %	333895929
1512	NC_015555	AAAG	2	8	79036	79043	75 %	0 %	25 %	0 %	333895929
1513	NC_015555	ATA	2	6	79052	79057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895929
1514	NC_015555	ATC	2	6	79065	79070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895929
1515	NC_015555	GCG	2	6	79073	79078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333895929
1516	NC_015555	GAA	2	6	79096	79101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895929
1517	NC_015555	CCTG	2	8	79106	79113	0 %	25 %	25 %	50 %	333895929
1518	NC_015555	ATGA	2	8	81099	81106	50 %	25 %	25 %	0 %	333895930
1519	NC_015555	CGT	2	6	81160	81165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895930
1520	NC_015555	ATAAA	2	10	81232	81241	80 %	20 %	0 %	0 %	333895930
1521	NC_015555	TGG	2	6	85036	85041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895931
1522	NC_015555	ACA	2	6	85140	85145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333895931
1523	NC_015555	ATA	2	6	85157	85162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895931
1524	NC_015555	TAA	2	6	85171	85176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895931
1525	NC_015555	GTCA	2	8	85190	85197	25 %	25 %	25 %	25 %	333895931
1526	NC_015555	GTG	2	6	85250	85255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895931
1527	NC_015555	TCC	2	6	85261	85266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333895931
1528	NC_015555	GGAT	2	8	85277	85284	25 %	25 %	50 %	0 %	333895931
1529	NC_015555	TGG	2	6	85296	85301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895931
1530	NC_015555	AG	3	6	85311	85316	50 %	0 %	50 %	0 %	333895931
1531	NC_015555	AAC	2	6	85340	85345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333895931
1532	NC_015555	TGC	3	9	85354	85362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895931
1533	NC_015555	ATTT	2	8	85374	85381	25 %	75 %	0 %	0 %	333895931
1534	NC_015555	AATA	2	8	85396	85403	75 %	25 %	0 %	0 %	333895931
1535	NC_015555	GGT	3	9	85436	85444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895931
1536	NC_015555	TGC	2	6	85486	85491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895931
1537	NC_015555	CAT	2	6	85581	85586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895931
1538	NC_015555	A	6	6	85600	85605	100 %	0 %	0 %	0 %	333895931
1539	NC_015555	AGA	2	6	85666	85671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895931
1540	NC_015555	TGC	2	6	85681	85686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895931
1541	NC_015555	TAA	2	6	85788	85793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895931
1542	NC_015555	GTCAA	2	10	85807	85816	40 %	20 %	20 %	20 %	333895931
1543	NC_015555	ATG	2	6	85838	85843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895931
1544	NC_015555	TGA	2	6	85852	85857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895931
1545	NC_015555	GTT	2	6	85892	85897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895931
1546	NC_015555	TGG	2	6	85909	85914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895931
1547	NC_015555	GCA	2	6	85934	85939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895931
1548	NC_015555	AGG	2	6	85954	85959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333895931
1549	NC_015555	A	6	6	85960	85965	100 %	0 %	0 %	0 %	333895932
1550	NC_015555	GAC	2	6	86043	86048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895932
1551	NC_015555	AAT	2	6	86124	86129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895932
1552	NC_015555	TGA	2	6	86177	86182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895932
1553	NC_015555	A	6	6	86184	86189	100 %	0 %	0 %	0 %	333895932
1554	NC_015555	ATT	2	6	86217	86222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895932
1555	NC_015555	ATC	2	6	86243	86248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895932
1556	NC_015555	ATT	2	6	86344	86349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895932
1557	NC_015555	CAT	2	6	86380	86385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895932
1558	NC_015555	GATAA	2	10	86391	86400	60 %	20 %	20 %	0 %	333895932
1559	NC_015555	A	7	7	86412	86418	100 %	0 %	0 %	0 %	333895932
1560	NC_015555	AAT	2	6	86444	86449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895932
1561	NC_015555	AT	3	6	86448	86453	50 %	50 %	0 %	0 %	333895932
1562	NC_015555	CA	3	6	86455	86460	50 %	0 %	0 %	50 %	333895932
1563	NC_015555	A	7	7	86536	86542	100 %	0 %	0 %	0 %	333895932
1564	NC_015555	A	6	6	86705	86710	100 %	0 %	0 %	0 %	333895933
1565	NC_015555	AGAC	2	8	86733	86740	50 %	0 %	25 %	25 %	333895933
1566	NC_015555	AAT	2	6	86785	86790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895933
1567	NC_015555	GAT	2	6	86807	86812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895933
1568	NC_015555	A	6	6	86833	86838	100 %	0 %	0 %	0 %	333895933
1569	NC_015555	GAT	2	6	86839	86844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895933
1570	NC_015555	A	6	6	86864	86869	100 %	0 %	0 %	0 %	333895933
1571	NC_015555	CATAT	2	10	87030	87039	40 %	40 %	0 %	20 %	333895934
1572	NC_015555	AAG	2	6	87051	87056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895934
1573	NC_015555	ATT	2	6	87062	87067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895934
1574	NC_015555	GACA	2	8	87121	87128	50 %	0 %	25 %	25 %	333895934
1575	NC_015555	TGC	2	6	87172	87177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895934
1576	NC_015555	ATC	2	6	87196	87201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895934
1577	NC_015555	TTTC	2	8	87202	87209	0 %	75 %	0 %	25 %	333895934
1578	NC_015555	AT	3	6	87233	87238	50 %	50 %	0 %	0 %	333895934
1579	NC_015555	GCA	2	6	87239	87244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895934
1580	NC_015555	TCA	2	6	87248	87253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895934
1581	NC_015555	ATG	2	6	87261	87266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895934
1582	NC_015555	GTT	2	6	87278	87283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895934
1583	NC_015555	TACT	2	8	87321	87328	25 %	50 %	0 %	25 %	333895934
1584	NC_015555	TA	3	6	87344	87349	50 %	50 %	0 %	0 %	333895934
1585	NC_015555	ATT	2	6	87462	87467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895934
1586	NC_015555	ATAA	2	8	87485	87492	75 %	25 %	0 %	0 %	333895934
1587	NC_015555	GTG	2	6	87494	87499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333895934
1588	NC_015555	TAG	2	6	87531	87536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895934
1589	NC_015555	GATAG	2	10	87677	87686	40 %	20 %	40 %	0 %	333895934
1590	NC_015555	ATCA	2	8	87720	87727	50 %	25 %	0 %	25 %	333895934
1591	NC_015555	CTT	2	6	87735	87740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895934
1592	NC_015555	TGA	2	6	87747	87752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895934
1593	NC_015555	CAAG	2	8	87830	87837	50 %	0 %	25 %	25 %	333895934
1594	NC_015555	GAT	2	6	87878	87883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895934
1595	NC_015555	TACGAT	2	12	87905	87916	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895934
1596	NC_015555	TGA	3	9	88051	88059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895934
1597	NC_015555	TAAA	2	8	88191	88198	75 %	25 %	0 %	0 %	333895934
1598	NC_015555	GAT	2	6	88220	88225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895934
1599	NC_015555	A	7	7	88303	88309	100 %	0 %	0 %	0 %	333895934
1600	NC_015555	AT	3	6	88321	88326	50 %	50 %	0 %	0 %	333895934
1601	NC_015555	TA	3	6	88335	88340	50 %	50 %	0 %	0 %	333895934
1602	NC_015555	GT	3	6	88385	88390	0 %	50 %	50 %	0 %	333895934
1603	NC_015555	AAT	2	6	88392	88397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895934
1604	NC_015555	AAAT	2	8	88454	88461	75 %	25 %	0 %	0 %	333895935
1605	NC_015555	A	6	6	88468	88473	100 %	0 %	0 %	0 %	333895935
1606	NC_015555	TTG	2	6	88499	88504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895935
1607	NC_015555	AG	3	6	88510	88515	50 %	0 %	50 %	0 %	333895935
1608	NC_015555	CTT	2	6	88555	88560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895935
1609	NC_015555	A	8	8	88564	88571	100 %	0 %	0 %	0 %	333895935
1610	NC_015555	CTT	2	6	88597	88602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333895935
1611	NC_015555	GCA	2	6	88606	88611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895935
1612	NC_015555	ATA	2	6	88639	88644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895935
1613	NC_015555	ATG	2	6	88655	88660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895935
1614	NC_015555	TTG	2	6	88685	88690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333895935
1615	NC_015555	AGA	2	6	88837	88842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895935
1616	NC_015555	AGA	2	6	88866	88871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895935
1617	NC_015555	AT	3	6	88902	88907	50 %	50 %	0 %	0 %	333895935
1618	NC_015555	TTA	2	6	88913	88918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895935
1619	NC_015555	CAGG	2	8	88928	88935	25 %	0 %	50 %	25 %	333895935
1620	NC_015555	TA	3	6	88969	88974	50 %	50 %	0 %	0 %	333895935
1621	NC_015555	TGA	2	6	88989	88994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895935
1622	NC_015555	ATT	2	6	89005	89010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895935
1623	NC_015555	AGG	2	6	89013	89018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333895935
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1625	NC_015555	AAG	2	6	89065	89070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895936
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