MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 50453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015555	GGC	2	6	241143	241148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333896081
4502	NC_015555	AGA	2	6	241286	241291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896082
4503	NC_015555	GAA	2	6	241356	241361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896082
4504	NC_015555	AGA	2	6	241376	241381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896082
4505	NC_015555	GAA	2	6	241419	241424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896082
4506	NC_015555	TGA	2	6	241640	241645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896082
4507	NC_015555	A	7	7	241682	241688	100 %	0 %	0 %	0 %	333896082
4508	NC_015555	TCCA	2	8	241814	241821	25 %	25 %	0 %	50 %	333896082
4509	NC_015555	A	6	6	241861	241866	100 %	0 %	0 %	0 %	333896082
4510	NC_015555	T	6	6	241918	241923	0 %	100 %	0 %	0 %	333896083
4511	NC_015555	ATG	2	6	241930	241935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896083
4512	NC_015555	GTT	2	6	241953	241958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896083
4513	NC_015555	TAT	2	6	242034	242039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896083
4514	NC_015555	TTAGCA	2	12	242045	242056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896083
4515	NC_015555	GTTTTT	2	12	242070	242081	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	333896083
4516	NC_015555	TCTT	2	8	242082	242089	0 %	75 %	0 %	25 %	333896083
4517	NC_015555	AAG	2	6	242103	242108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896083
4518	NC_015555	ATC	2	6	242109	242114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896083
4519	NC_015555	T	7	7	242298	242304	0 %	100 %	0 %	0 %	333896083
4520	NC_015555	GCT	2	6	242305	242310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896083
4521	NC_015555	TCT	2	6	242317	242322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896083
4522	NC_015555	GT	3	6	242351	242356	0 %	50 %	50 %	0 %	333896083
4523	NC_015555	CA	3	6	242372	242377	50 %	0 %	0 %	50 %	333896083
4524	NC_015555	CT	4	8	242411	242418	0 %	50 %	0 %	50 %	333896083
4525	NC_015555	ATT	2	6	242434	242439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896083
4526	NC_015555	AGA	2	6	242442	242447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896083
4527	NC_015555	GCC	2	6	242496	242501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333896083
4528	NC_015555	TGG	2	6	242509	242514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896083
4529	NC_015555	GAT	2	6	242517	242522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896083
4530	NC_015555	TAG	2	6	242531	242536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896083
4531	NC_015555	TCT	2	6	242539	242544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896083
4532	NC_015555	TAT	2	6	242586	242591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896083
4533	NC_015555	TTTC	3	12	242592	242603	0 %	75 %	0 %	25 %	333896083
4534	NC_015555	AT	3	6	242612	242617	50 %	50 %	0 %	0 %	333896083
4535	NC_015555	TCA	3	9	242650	242658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896083
4536	NC_015555	GTCT	2	8	242695	242702	0 %	50 %	25 %	25 %	333896083
4537	NC_015555	CAT	2	6	242705	242710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896083
4538	NC_015555	ACT	2	6	242818	242823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896083
4539	NC_015555	T	6	6	242842	242847	0 %	100 %	0 %	0 %	333896083
4540	NC_015555	CTT	2	6	242849	242854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896083
4541	NC_015555	TCT	2	6	242875	242880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896083
4542	NC_015555	CCG	2	6	242881	242886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333896083
4543	NC_015555	ATT	2	6	242890	242895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896083
4544	NC_015555	T	7	7	242910	242916	0 %	100 %	0 %	0 %	333896083
4545	NC_015555	ATTCT	2	10	242969	242978	20 %	60 %	0 %	20 %	333896083
4546	NC_015555	TAC	2	6	242982	242987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896083
4547	NC_015555	CAA	2	6	243008	243013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896083
4548	NC_015555	T	6	6	243040	243045	0 %	100 %	0 %	0 %	333896083
4549	NC_015555	ATG	2	6	243073	243078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896083
4550	NC_015555	TGA	2	6	243114	243119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896083
4551	NC_015555	TAG	2	6	243149	243154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896083
4552	NC_015555	ATTT	2	8	243167	243174	25 %	75 %	0 %	0 %	333896083
4553	NC_015555	CTA	2	6	243182	243187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896083
4554	NC_015555	CAA	2	6	243188	243193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896083
4555	NC_015555	TTG	2	6	243205	243210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896083
4556	NC_015555	TAA	2	6	243213	243218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896083
4557	NC_015555	TA	3	6	243296	243301	50 %	50 %	0 %	0 %	333896083
4558	NC_015555	ATTT	2	8	243393	243400	25 %	75 %	0 %	0 %	333896083
4559	NC_015555	ACA	2	6	243484	243489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896083
4560	NC_015555	AATG	2	8	243652	243659	50 %	25 %	25 %	0 %	333896084
4561	NC_015555	T	7	7	243679	243685	0 %	100 %	0 %	0 %	333896084
4562	NC_015555	TGG	2	6	243697	243702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896084
4563	NC_015555	ATA	2	6	243704	243709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896084
4564	NC_015555	TA	3	6	243729	243734	50 %	50 %	0 %	0 %	333896084
4565	NC_015555	ATC	2	6	243788	243793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896084
4566	NC_015555	T	8	8	243824	243831	0 %	100 %	0 %	0 %	333896084
4567	NC_015555	ACA	2	6	243900	243905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896084
4568	NC_015555	TGA	2	6	243924	243929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896084
4569	NC_015555	ACT	2	6	243931	243936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896084
4570	NC_015555	T	7	7	243941	243947	0 %	100 %	0 %	0 %	333896084
4571	NC_015555	TA	3	6	243978	243983	50 %	50 %	0 %	0 %	333896084
4572	NC_015555	CAT	2	6	243990	243995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896084
4573	NC_015555	TTG	2	6	244002	244007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896084
4574	NC_015555	AT	3	6	244039	244044	50 %	50 %	0 %	0 %	333896084
4575	NC_015555	A	7	7	244114	244120	100 %	0 %	0 %	0 %	333896084
4576	NC_015555	ATT	2	6	244257	244262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896085
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4579	NC_015555	CTA	2	6	244319	244324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896085
4580	NC_015555	TGC	2	6	244335	244340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896085
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4582	NC_015555	AT	3	6	244377	244382	50 %	50 %	0 %	0 %	333896085
4583	NC_015555	A	6	6	244435	244440	100 %	0 %	0 %	0 %	333896085
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4587	NC_015555	GAA	2	6	244789	244794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896086
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4589	NC_015555	CCAAAA	2	12	244821	244832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896086
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4592	NC_015555	AT	3	6	244888	244893	50 %	50 %	0 %	0 %	333896086
4593	NC_015555	AG	3	6	244901	244906	50 %	0 %	50 %	0 %	333896086
4594	NC_015555	TGA	2	6	244931	244936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896086
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4599	NC_015555	GAAA	2	8	245132	245139	75 %	0 %	25 %	0 %	333896087
4600	NC_015555	AAG	2	6	245151	245156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896087
4601	NC_015555	T	6	6	245249	245254	0 %	100 %	0 %	0 %	333896087
4602	NC_015555	AT	4	8	245284	245291	50 %	50 %	0 %	0 %	333896087
4603	NC_015555	GA	3	6	245312	245317	50 %	0 %	50 %	0 %	333896087
4604	NC_015555	ATA	2	6	245376	245381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896087
4605	NC_015555	AT	3	6	245408	245413	50 %	50 %	0 %	0 %	333896087
4606	NC_015555	TGG	2	6	245462	245467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896087
4607	NC_015555	TCTTA	2	10	245484	245493	20 %	60 %	0 %	20 %	333896087
4608	NC_015555	A	7	7	245508	245514	100 %	0 %	0 %	0 %	333896087
4609	NC_015555	AAT	2	6	245586	245591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896087
4610	NC_015555	TA	3	6	245601	245606	50 %	50 %	0 %	0 %	333896087
4611	NC_015555	GGT	2	6	245670	245675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896087
4612	NC_015555	AAC	2	6	245681	245686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896087
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4614	NC_015555	GA	3	6	245723	245728	50 %	0 %	50 %	0 %	333896087
4615	NC_015555	ATG	2	6	245784	245789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896087
4616	NC_015555	GA	3	6	245805	245810	50 %	0 %	50 %	0 %	333896087
4617	NC_015555	AAT	2	6	245864	245869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896087
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4620	NC_015555	A	6	6	247145	247150	100 %	0 %	0 %	0 %	333896088
4621	NC_015555	TAT	2	6	247164	247169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896088
4622	NC_015555	TGA	2	6	247189	247194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896088
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4624	NC_015555	AAACA	2	10	247339	247348	80 %	0 %	0 %	20 %	333896088
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4994	NC_015555	CAG	2	6	266878	266883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896105
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