MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Treponema brennaborense DSM 12168 chromosome

Total Repeats: 41633

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015500	GAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296670
2	NC_015500	AGA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296670
3	NC_015500	AAG	2	6	128	133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296670
4	NC_015500	CGT	2	6	203	208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296670
5	NC_015500	GAT	2	6	225	230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296670
6	NC_015500	GCG	2	6	244	249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
7	NC_015500	GAA	2	6	268	273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296670
8	NC_015500	CGG	3	9	342	350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
9	NC_015500	CGG	2	6	374	379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
10	NC_015500	CGT	2	6	413	418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296670
11	NC_015500	GGC	2	6	429	434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
12	NC_015500	CCG	2	6	552	557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296670
13	NC_015500	CGG	2	6	687	692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
14	NC_015500	CGG	2	6	753	758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
15	NC_015500	CCG	2	6	776	781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296670
16	NC_015500	GAC	2	6	874	879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296670
17	NC_015500	AAG	2	6	911	916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296670
18	NC_015500	GTC	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296670
19	NC_015500	ATT	2	6	1328	1333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296670
20	NC_015500	CGA	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296670
21	NC_015500	CGG	2	6	1461	1466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
22	NC_015500	TAC	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296670
23	NC_015500	AGA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296670
24	NC_015500	GCA	2	6	1562	1567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296670
25	NC_015500	AAT	2	6	1897	1902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296671
26	NC_015500	ACA	2	6	1956	1961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296671
27	NC_015500	CGT	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296671
28	NC_015500	GAA	3	9	2024	2032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296671
29	NC_015500	ACC	3	9	2036	2044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332296671
30	NC_015500	TCC	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332296671
31	NC_015500	CCG	2	6	2232	2237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296671
32	NC_015500	CGA	2	6	2281	2286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296671
33	NC_015500	GAC	2	6	2330	2335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296671
34	NC_015500	GCC	2	6	2361	2366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296671
35	NC_015500	TTC	2	6	2377	2382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296671
36	NC_015500	CTT	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296671
37	NC_015500	TCG	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296671
38	NC_015500	CGC	2	6	2675	2680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296671
39	NC_015500	AGA	2	6	2749	2754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296671
40	NC_015500	CGA	2	6	2812	2817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296671
41	NC_015500	ACT	2	6	2907	2912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296671
42	NC_015500	CAT	2	6	2917	2922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296671
43	NC_015500	CTT	2	6	3014	3019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296672
44	NC_015500	AGG	2	6	3024	3029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332296672
45	NC_015500	GAA	2	6	3179	3184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296672
46	NC_015500	ACG	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296672
47	NC_015500	ACG	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296672
48	NC_015500	CCG	2	6	3687	3692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296672
49	NC_015500	ATG	3	9	3695	3703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296672
50	NC_015500	GAC	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296672
51	NC_015500	CGG	2	6	3751	3756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296672
52	NC_015500	GCG	2	6	3790	3795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296672
53	NC_015500	TAT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296672
54	NC_015500	CTG	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296672
55	NC_015500	GAC	2	6	3875	3880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296672
56	NC_015500	CCG	2	6	3932	3937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296672
57	NC_015500	CGC	2	6	3989	3994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296672
58	NC_015500	GCA	2	6	4115	4120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296673
59	NC_015500	ATC	2	6	4194	4199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296673
60	NC_015500	TGC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296673
61	NC_015500	ATC	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296673
62	NC_015500	CGG	2	6	4364	4369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296673
63	NC_015500	AGA	2	6	4388	4393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296673
64	NC_015500	TAA	2	6	4544	4549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296673
65	NC_015500	GGA	2	6	4726	4731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332296674
66	NC_015500	AAG	2	6	4792	4797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296674
67	NC_015500	AAT	2	6	4958	4963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296675
68	NC_015500	TCC	2	6	5256	5261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332296676
69	NC_015500	CTG	2	6	5262	5267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296676
70	NC_015500	GCG	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296676
71	NC_015500	CGG	2	6	5382	5387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296676
72	NC_015500	CGG	2	6	5537	5542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296677
73	NC_015500	TTC	2	6	5580	5585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296677
74	NC_015500	GAA	2	6	5632	5637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296677
75	NC_015500	CCG	2	6	5663	5668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296677
76	NC_015500	GCA	2	6	5677	5682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
77	NC_015500	GAA	2	6	5692	5697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296677
78	NC_015500	GGC	2	6	5746	5751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296677
79	NC_015500	CGA	2	6	5877	5882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
80	NC_015500	ACG	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
81	NC_015500	CGG	2	6	6002	6007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296677
82	NC_015500	CGA	2	6	6042	6047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
83	NC_015500	AAC	2	6	6130	6135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296677
84	NC_015500	GCA	2	6	6170	6175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
85	NC_015500	ACG	3	9	6218	6226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
86	NC_015500	ATG	2	6	6355	6360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296677
87	NC_015500	TAT	2	6	6400	6405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296677
88	NC_015500	GAA	2	6	6427	6432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296677
89	NC_015500	ACA	2	6	6446	6451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296677
90	NC_015500	CTG	2	6	6559	6564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296677
91	NC_015500	ATC	2	6	6595	6600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296677
92	NC_015500	CTG	2	6	6613	6618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296677
93	NC_015500	CAA	2	6	6843	6848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296677
94	NC_015500	GCT	2	6	6963	6968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296677
95	NC_015500	GCT	2	6	6993	6998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296677
96	NC_015500	CCG	2	6	7025	7030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296677
97	NC_015500	ATG	2	6	7060	7065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296677
98	NC_015500	TCT	2	6	7085	7090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296677
99	NC_015500	GCA	2	6	7158	7163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
100	NC_015500	CGC	2	6	7344	7349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296678
101	NC_015500	CGG	2	6	7488	7493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296678
102	NC_015500	GAA	2	6	7627	7632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296678
103	NC_015500	TTC	2	6	7665	7670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296678
104	NC_015500	CGG	2	6	7792	7797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296678
105	NC_015500	GAA	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296678
106	NC_015500	CCG	2	6	7829	7834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296678
107	NC_015500	TGA	2	6	7996	8001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296678
108	NC_015500	CGG	2	6	8161	8166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296679
109	NC_015500	CCG	2	6	8176	8181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296679
110	NC_015500	GCT	2	6	8330	8335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296679
111	NC_015500	AGT	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296679
112	NC_015500	TAT	2	6	8484	8489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296679
113	NC_015500	TAA	2	6	8540	8545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296679
114	NC_015500	CCG	2	6	8587	8592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296679
115	NC_015500	CTG	2	6	8787	8792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296679
116	NC_015500	CTG	2	6	8966	8971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296680
117	NC_015500	GTT	2	6	9000	9005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296680
118	NC_015500	ACG	2	6	9183	9188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296680
119	NC_015500	GCG	2	6	9231	9236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296680
120	NC_015500	CGG	2	6	9256	9261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296680
121	NC_015500	CGA	2	6	9280	9285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296680
122	NC_015500	ACG	2	6	9306	9311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296680
123	NC_015500	CGT	2	6	9424	9429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296680
124	NC_015500	GCG	2	6	9554	9559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296680
125	NC_015500	CTA	2	6	9603	9608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296680
126	NC_015500	AAG	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296680
127	NC_015500	GCC	2	6	9877	9882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296680
128	NC_015500	TGC	3	9	10115	10123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296681
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130	NC_015500	GCG	2	6	10301	10306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296681
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254	NC_015500	CCA	2	6	19749	19754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332296688
255	NC_015500	TCG	2	6	19840	19845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296688
256	NC_015500	CAG	2	6	20043	20048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296688
257	NC_015500	TTC	2	6	20142	20147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296688
258	NC_015500	CGG	2	6	20228	20233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296688
259	NC_015500	GCT	2	6	20444	20449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296688
260	NC_015500	ACG	2	6	20476	20481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296688
261	NC_015500	GCA	2	6	20496	20501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296688
262	NC_015500	TGA	2	6	20528	20533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296688
263	NC_015500	GAC	2	6	20622	20627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296688
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270	NC_015500	GCC	2	6	20949	20954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296688
271	NC_015500	ACG	2	6	20974	20979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296688
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274	NC_015500	TCC	2	6	21520	21525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332296689
275	NC_015500	CGG	2	6	21528	21533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296689
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279	NC_015500	CGA	2	6	21792	21797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296689
280	NC_015500	GCG	3	9	21841	21849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296689
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283	NC_015500	GAT	2	6	22080	22085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296689
284	NC_015500	GCG	2	6	22108	22113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296689
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288	NC_015500	TCG	2	6	22339	22344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296689
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375	NC_015500	CGC	2	6	30565	30570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296693
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