MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema brennaborense DSM 12168 chromosome

Total Repeats: 63779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_015500	GTC	2	6	199390	199395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296840
4003	NC_015500	GCG	2	6	199400	199405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296840
4004	NC_015500	CGG	2	6	199410	199415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296840
4005	NC_015500	CGA	2	6	199416	199421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296840
4006	NC_015500	TTC	2	6	199453	199458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296840
4007	NC_015500	TTC	2	6	199474	199479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296840
4008	NC_015500	GC	3	6	199512	199517	0 %	0 %	50 %	50 %	332296840
4009	NC_015500	GAG	2	6	199525	199530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332296840
4010	NC_015500	CG	3	6	199597	199602	0 %	0 %	50 %	50 %	332296840
4011	NC_015500	CGA	2	6	199644	199649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296840
4012	NC_015500	CAA	2	6	199675	199680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296840
4013	NC_015500	AT	3	6	200199	200204	50 %	50 %	0 %	0 %	332296841
4014	NC_015500	TCT	2	6	200253	200258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296841
4015	NC_015500	CCGT	2	8	200317	200324	0 %	25 %	25 %	50 %	332296841
4016	NC_015500	CTG	2	6	200347	200352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4017	NC_015500	GTC	2	6	200386	200391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4018	NC_015500	A	6	6	200434	200439	100 %	0 %	0 %	0 %	332296841
4019	NC_015500	GCCG	2	8	200440	200447	0 %	0 %	50 %	50 %	332296841
4020	NC_015500	GCT	3	9	200454	200462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4021	NC_015500	CGC	2	6	200475	200480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296841
4022	NC_015500	CGG	2	6	200567	200572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296841
4023	NC_015500	GAA	2	6	200614	200619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296841
4024	NC_015500	TGC	2	6	200651	200656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4025	NC_015500	GCT	2	6	200748	200753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4026	NC_015500	CGT	2	6	200769	200774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4027	NC_015500	GCC	2	6	200785	200790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296841
4028	NC_015500	T	6	6	200821	200826	0 %	100 %	0 %	0 %	332296841
4029	NC_015500	CTG	2	6	200866	200871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4030	NC_015500	CTG	2	6	200884	200889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4031	NC_015500	GCT	2	6	200934	200939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4032	NC_015500	GCT	2	6	200964	200969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4033	NC_015500	TCCG	2	8	200975	200982	0 %	25 %	25 %	50 %	332296841
4034	NC_015500	TGGG	2	8	201022	201029	0 %	25 %	75 %	0 %	332296841
4035	NC_015500	GTC	2	6	201037	201042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4036	NC_015500	GTTC	2	8	201045	201052	0 %	50 %	25 %	25 %	332296841
4037	NC_015500	TCG	2	6	201053	201058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4038	NC_015500	CGT	2	6	201074	201079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4039	NC_015500	CGG	2	6	201093	201098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296841
4040	NC_015500	CGT	2	6	201102	201107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4041	NC_015500	GAT	2	6	201138	201143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296841
4042	NC_015500	GC	3	6	201245	201250	0 %	0 %	50 %	50 %	332296841
4043	NC_015500	TGCG	2	8	201270	201277	0 %	25 %	50 %	25 %	332296841
4044	NC_015500	CCGTCG	2	12	201293	201304	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	332296841
4045	NC_015500	GCTCG	2	10	201327	201336	0 %	20 %	40 %	40 %	332296841
4046	NC_015500	GCT	2	6	201363	201368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296841
4047	NC_015500	GCGA	2	8	201613	201620	25 %	0 %	50 %	25 %	332296842
4048	NC_015500	T	6	6	201657	201662	0 %	100 %	0 %	0 %	332296842
4049	NC_015500	TCG	2	6	201670	201675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296842
4050	NC_015500	GCC	2	6	201687	201692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296842
4051	NC_015500	CCG	2	6	201721	201726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296842
4052	NC_015500	GGC	2	6	201732	201737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296842
4053	NC_015500	CGG	3	9	201761	201769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296842
4054	NC_015500	CGT	2	6	201830	201835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296842
4055	NC_015500	ACGA	2	8	201838	201845	50 %	0 %	25 %	25 %	332296842
4056	NC_015500	TCG	2	6	201874	201879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296842
4057	NC_015500	CAG	2	6	201891	201896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296842
4058	NC_015500	T	6	6	201933	201938	0 %	100 %	0 %	0 %	332296842
4059	NC_015500	ATG	2	6	201961	201966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296842
4060	NC_015500	CTT	2	6	201974	201979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296842
4061	NC_015500	CTG	2	6	201996	202001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296842
4062	NC_015500	GTC	2	6	202065	202070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296842
4063	NC_015500	GACG	2	8	202071	202078	25 %	0 %	50 %	25 %	332296842
4064	NC_015500	GTC	3	9	202080	202088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296842
4065	NC_015500	GAT	2	6	202092	202097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296842
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4069	NC_015500	TGT	2	6	202385	202390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296842
4070	NC_015500	GAT	2	6	202452	202457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296842
4071	NC_015500	GCCG	2	8	202476	202483	0 %	0 %	50 %	50 %	332296842
4072	NC_015500	GCG	2	6	202484	202489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296842
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4074	NC_015500	CGG	2	6	202645	202650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296843
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4079	NC_015500	CG	3	6	202815	202820	0 %	0 %	50 %	50 %	332296843
4080	NC_015500	CG	3	6	202919	202924	0 %	0 %	50 %	50 %	332296843
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4088	NC_015500	GC	3	6	203215	203220	0 %	0 %	50 %	50 %	332296843
4089	NC_015500	TGA	2	6	203551	203556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296844
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4092	NC_015500	TCC	2	6	203714	203719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332296844
4093	NC_015500	CGTG	2	8	203723	203730	0 %	25 %	50 %	25 %	332296844
4094	NC_015500	CCG	2	6	203781	203786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296844
4095	NC_015500	CGGA	2	8	203791	203798	25 %	0 %	50 %	25 %	332296844
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4099	NC_015500	TGA	2	6	203947	203952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296844
4100	NC_015500	GCG	2	6	203959	203964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296844
4101	NC_015500	A	6	6	204057	204062	100 %	0 %	0 %	0 %	332296844
4102	NC_015500	GCC	2	6	204150	204155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296844
4103	NC_015500	GAAA	2	8	204157	204164	75 %	0 %	25 %	0 %	332296844
4104	NC_015500	GCA	2	6	204179	204184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296844
4105	NC_015500	CGA	2	6	204197	204202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296844
4106	NC_015500	TACGT	2	10	204207	204216	20 %	40 %	20 %	20 %	332296844
4107	NC_015500	GCC	2	6	204223	204228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296844
4108	NC_015500	GTGCT	2	10	204234	204243	0 %	40 %	40 %	20 %	332296844
4109	NC_015500	T	6	6	204286	204291	0 %	100 %	0 %	0 %	332296844
4110	NC_015500	GCC	2	6	204368	204373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296844
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4112	NC_015500	CGC	2	6	204578	204583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296844
4113	NC_015500	ATT	2	6	204645	204650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296844
4114	NC_015500	CGA	2	6	204655	204660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296844
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4117	NC_015500	AAG	2	6	204862	204867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296844
4118	NC_015500	GC	3	6	204872	204877	0 %	0 %	50 %	50 %	332296844
4119	NC_015500	TGC	2	6	204913	204918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296844
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4121	NC_015500	CGG	2	6	204976	204981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296844
4122	NC_015500	GGT	2	6	205010	205015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332296844
4123	NC_015500	CTG	2	6	205068	205073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296844
4124	NC_015500	TTGAT	2	10	205120	205129	20 %	60 %	20 %	0 %	332296844
4125	NC_015500	CGA	2	6	205220	205225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296844
4126	NC_015500	TGC	2	6	205246	205251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296844
4127	NC_015500	CGG	2	6	205276	205281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296844
4128	NC_015500	CGG	2	6	205354	205359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296844
4129	NC_015500	AATA	2	8	205399	205406	75 %	25 %	0 %	0 %	332296844
4130	NC_015500	GTT	2	6	205655	205660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296845
4131	NC_015500	CGG	2	6	205696	205701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296845
4132	NC_015500	GCG	2	6	205739	205744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296845
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4137	NC_015500	TTC	2	6	205966	205971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296845
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4139	NC_015500	GAT	3	9	206048	206056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296845
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4142	NC_015500	TTAACC	2	12	206187	206198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296845
4143	NC_015500	ATA	2	6	206265	206270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296845
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4145	NC_015500	A	7	7	206425	206431	100 %	0 %	0 %	0 %	332296846
4146	NC_015500	CTT	2	6	206443	206448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296846
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4148	NC_015500	CGT	2	6	206531	206536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296846
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4150	NC_015500	GTT	2	6	206679	206684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296846
4151	NC_015500	CTG	2	6	206695	206700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296846
4152	NC_015500	CGC	2	6	206814	206819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296846
4153	NC_015500	ACGA	2	8	206866	206873	50 %	0 %	25 %	25 %	332296846
4154	NC_015500	CAG	2	6	206977	206982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296846
4155	NC_015500	CGAC	2	8	206996	207003	25 %	0 %	25 %	50 %	332296846
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4223	NC_015500	ACG	2	6	210793	210798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296849
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4227	NC_015500	ATTCC	2	10	210917	210926	20 %	40 %	0 %	40 %	332296849
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4239	NC_015500	ACG	2	6	211428	211433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296850
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4241	NC_015500	CAT	2	6	211508	211513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296850
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4243	NC_015500	CG	3	6	211651	211656	0 %	0 %	50 %	50 %	332296850
4244	NC_015500	ATTGG	2	10	211658	211667	20 %	40 %	40 %	0 %	332296850
4245	NC_015500	CG	3	6	211672	211677	0 %	0 %	50 %	50 %	332296850
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4251	NC_015500	CGG	2	6	211876	211881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296850
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4363	NC_015500	TGA	2	6	216776	216781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296853
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4366	NC_015500	T	7	7	216858	216864	0 %	100 %	0 %	0 %	332296853
4367	NC_015500	CGC	2	6	216895	216900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296853
4368	NC_015500	ATA	2	6	216902	216907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296853
4369	NC_015500	CGG	2	6	216909	216914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296853
4370	NC_015500	GTC	2	6	216968	216973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296853
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4373	NC_015500	TGA	2	6	217079	217084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296853
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4375	NC_015500	GT	3	6	217115	217120	0 %	50 %	50 %	0 %	332296853
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4389	NC_015500	ATC	2	6	217968	217973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296854
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4394	NC_015500	CGG	2	6	218251	218256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296854
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4399	NC_015500	A	6	6	218570	218575	100 %	0 %	0 %	0 %	332296855
4400	NC_015500	ATC	2	6	218607	218612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296855
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4402	NC_015500	TGC	2	6	218665	218670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296855
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4409	NC_015500	T	6	6	219098	219103	0 %	100 %	0 %	0 %	332296856
4410	NC_015500	TGC	2	6	219148	219153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296856
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4415	NC_015500	CGA	2	6	219259	219264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296856
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4421	NC_015500	GTC	2	6	219450	219455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296856
4422	NC_015500	TCGG	2	8	219459	219466	0 %	25 %	50 %	25 %	332296856
4423	NC_015500	ATC	2	6	219489	219494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296856
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4465	NC_015500	GAC	2	6	221424	221429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296856
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4471	NC_015500	CCGCGG	2	12	221579	221590	0 %	0 %	50 %	50 %	332296856
4472	NC_015500	GGA	2	6	221621	221626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332296856
4473	NC_015500	GCA	2	6	221657	221662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296856
4474	NC_015500	TTAG	2	8	222228	222235	25 %	50 %	25 %	0 %	332296857
4475	NC_015500	TGA	2	6	222260	222265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296857
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4478	NC_015500	GCGG	2	8	222341	222348	0 %	0 %	75 %	25 %	332296857
4479	NC_015500	GTTC	2	8	222506	222513	0 %	50 %	25 %	25 %	332296857
4480	NC_015500	AGCGGC	2	12	222541	222552	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	332296857
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4482	NC_015500	GCG	2	6	222590	222595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296857
4483	NC_015500	CGA	2	6	222614	222619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296857
4484	NC_015500	A	6	6	222643	222648	100 %	0 %	0 %	0 %	332296857
4485	NC_015500	AAG	2	6	222675	222680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296857
4486	NC_015500	A	7	7	222741	222747	100 %	0 %	0 %	0 %	332296857
4487	NC_015500	GC	3	6	222792	222797	0 %	0 %	50 %	50 %	332296857
4488	NC_015500	CCG	2	6	222854	222859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296857
4489	NC_015500	TCC	2	6	222877	222882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332296857
4490	NC_015500	TCT	2	6	222907	222912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296857
4491	NC_015500	GCG	2	6	222915	222920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296857
4492	NC_015500	AGC	2	6	222970	222975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296857
4493	NC_015500	TCC	2	6	222991	222996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332296857
4494	NC_015500	GC	3	6	223051	223056	0 %	0 %	50 %	50 %	332296857
4495	NC_015500	TTCG	2	8	223068	223075	0 %	50 %	25 %	25 %	332296857
4496	NC_015500	A	6	6	223086	223091	100 %	0 %	0 %	0 %	332296857
4497	NC_015500	TTTC	2	8	223282	223289	0 %	75 %	0 %	25 %	332296858
4498	NC_015500	GTA	2	6	223322	223327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296858
4499	NC_015500	TCG	2	6	223341	223346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296858
4500	NC_015500	AGC	2	6	223350	223355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296858

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