MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema brennaborense DSM 12168 chromosome

Total Repeats: 63779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_015500	CGT	3	9	249760	249768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296882
5003	NC_015500	CGG	2	6	249778	249783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296882
5004	NC_015500	CGG	2	6	249866	249871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296882
5005	NC_015500	ACA	3	9	250029	250037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296882
5006	NC_015500	TCG	2	6	250095	250100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296882
5007	NC_015500	GCG	2	6	250110	250115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296882
5008	NC_015500	ACG	2	6	250121	250126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296882
5009	NC_015500	CTG	2	6	250136	250141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296882
5010	NC_015500	GCG	2	6	250161	250166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296882
5011	NC_015500	CGG	2	6	250220	250225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296882
5012	NC_015500	GCA	2	6	250240	250245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296882
5013	NC_015500	GCC	2	6	250328	250333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296882
5014	NC_015500	CGT	2	6	250334	250339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296882
5015	NC_015500	CGT	2	6	250387	250392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296882
5016	NC_015500	AGC	2	6	250428	250433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296882
5017	NC_015500	GC	3	6	250445	250450	0 %	0 %	50 %	50 %	332296882
5018	NC_015500	CCG	2	6	250466	250471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296882
5019	NC_015500	CGA	2	6	250540	250545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296882
5020	NC_015500	ACG	2	6	250562	250567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296882
5021	NC_015500	ATC	2	6	250613	250618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296882
5022	NC_015500	CGA	2	6	250627	250632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296882
5023	NC_015500	GGC	2	6	250676	250681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296882
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5025	NC_015500	TGT	2	6	251145	251150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296883
5026	NC_015500	ACC	2	6	251190	251195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332296883
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5028	NC_015500	TCT	2	6	251231	251236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296883
5029	NC_015500	CTT	2	6	251241	251246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296883
5030	NC_015500	TCGT	2	8	251276	251283	0 %	50 %	25 %	25 %	332296883
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5032	NC_015500	CAT	2	6	251323	251328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296883
5033	NC_015500	CGC	2	6	251352	251357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296883
5034	NC_015500	T	6	6	251374	251379	0 %	100 %	0 %	0 %	332296883
5035	NC_015500	CTG	2	6	251380	251385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296883
5036	NC_015500	CG	4	8	251419	251426	0 %	0 %	50 %	50 %	332296883
5037	NC_015500	GACGG	2	10	251452	251461	20 %	0 %	60 %	20 %	332296883
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5040	NC_015500	CGG	2	6	251622	251627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296883
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5042	NC_015500	CGT	2	6	251683	251688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296883
5043	NC_015500	CGA	2	6	251709	251714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296883
5044	NC_015500	CGA	2	6	251718	251723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296883
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5049	NC_015500	GCTTG	2	10	251916	251925	0 %	40 %	40 %	20 %	332296883
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5051	NC_015500	AGCC	2	8	252007	252014	25 %	0 %	25 %	50 %	332296883
5052	NC_015500	TTTC	2	8	252018	252025	0 %	75 %	0 %	25 %	332296883
5053	NC_015500	CGC	2	6	252069	252074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296883
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5055	NC_015500	TCG	2	6	252212	252217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296883
5056	NC_015500	AGC	2	6	252218	252223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296883
5057	NC_015500	GCA	2	6	252240	252245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296883
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5060	NC_015500	CAGCG	2	10	252317	252326	20 %	0 %	40 %	40 %	332296883
5061	NC_015500	GCC	2	6	252395	252400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296883
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5073	NC_015500	T	8	8	253189	253196	0 %	100 %	0 %	0 %	332296884
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5080	NC_015500	CGT	2	6	253624	253629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296885
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5091	NC_015500	CGTATT	2	12	254310	254321	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332296886
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5095	NC_015500	T	6	6	254384	254389	0 %	100 %	0 %	0 %	332296886
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5100	NC_015500	T	6	6	254587	254592	0 %	100 %	0 %	0 %	332296886
5101	NC_015500	AAT	2	6	254594	254599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296886
5102	NC_015500	TGA	2	6	254622	254627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296886
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5105	NC_015500	TCG	2	6	254704	254709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296886
5106	NC_015500	T	7	7	254711	254717	0 %	100 %	0 %	0 %	332296886
5107	NC_015500	TTG	2	6	254734	254739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296886
5108	NC_015500	ACGGTA	2	12	254749	254760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332296886
5109	NC_015500	GAC	2	6	254788	254793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296886
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5111	NC_015500	CGC	2	6	255189	255194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296886
5112	NC_015500	AACC	2	8	255195	255202	50 %	0 %	0 %	50 %	332296886
5113	NC_015500	CGTT	2	8	255230	255237	0 %	50 %	25 %	25 %	332296886
5114	NC_015500	A	6	6	255249	255254	100 %	0 %	0 %	0 %	332296886
5115	NC_015500	CGAA	2	8	255266	255273	50 %	0 %	25 %	25 %	332296886
5116	NC_015500	CAG	2	6	255291	255296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296886
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5119	NC_015500	CCT	2	6	255420	255425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332296886
5120	NC_015500	AAAT	2	8	255529	255536	75 %	25 %	0 %	0 %	332296886
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5122	NC_015500	CGA	2	6	255620	255625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296886
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5243	NC_015500	TA	3	6	261259	261264	50 %	50 %	0 %	0 %	332296892
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5489	NC_015500	ATGAA	2	10	273832	273841	60 %	20 %	20 %	0 %	332296903
5490	NC_015500	CCGTT	2	10	273849	273858	0 %	40 %	20 %	40 %	332296903
5491	NC_015500	TTTCC	2	10	273876	273885	0 %	60 %	0 %	40 %	332296903
5492	NC_015500	CGG	2	6	273940	273945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296903
5493	NC_015500	ACGTAC	2	12	273996	274007	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332296903
5494	NC_015500	TGC	2	6	274026	274031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296903
5495	NC_015500	CGC	2	6	274055	274060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296903
5496	NC_015500	CGTG	2	8	274063	274070	0 %	25 %	50 %	25 %	332296903
5497	NC_015500	ACG	2	6	274134	274139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296903
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5500	NC_015500	GATCC	2	10	274205	274214	20 %	20 %	20 %	40 %	332296903

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