MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 42700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015315	GCCT	2	8	50556	50563	0 %	25 %	25 %	50 %	327309970
1002	NC_015315	CGAAC	2	10	50571	50580	40 %	0 %	20 %	40 %	327309970
1003	NC_015315	GGC	2	6	50583	50588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309970
1004	NC_015315	TAG	2	6	50632	50637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309970
1005	NC_015315	TCT	2	6	50666	50671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309970
1006	NC_015315	CGC	2	6	50715	50720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309970
1007	NC_015315	GTC	2	6	50721	50726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309970
1008	NC_015315	GCG	2	6	50813	50818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309970
1009	NC_015315	CGGG	2	8	50827	50834	0 %	0 %	75 %	25 %	327309970
1010	NC_015315	TGG	2	6	50852	50857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309970
1011	NC_015315	TTG	2	6	50926	50931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309970
1012	NC_015315	CCA	2	6	50990	50995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309970
1013	NC_015315	GTC	2	6	51004	51009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309970
1014	NC_015315	CCT	2	6	51026	51031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309970
1015	NC_015315	GCG	2	6	51103	51108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309970
1016	NC_015315	CCT	2	6	51123	51128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309970
1017	NC_015315	ACC	2	6	51148	51153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309970
1018	NC_015315	TTGC	2	8	51172	51179	0 %	50 %	25 %	25 %	327309971
1019	NC_015315	AGT	2	6	51180	51185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309971
1020	NC_015315	GTA	3	9	51200	51208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309971
1021	NC_015315	GCC	2	6	51242	51247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309971
1022	NC_015315	GTCC	2	8	51305	51312	0 %	25 %	25 %	50 %	327309971
1023	NC_015315	GAG	2	6	51329	51334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309971
1024	NC_015315	ACG	2	6	51360	51365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309971
1025	NC_015315	GAG	2	6	51491	51496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309971
1026	NC_015315	CAGCT	2	10	51504	51513	20 %	20 %	20 %	40 %	327309971
1027	NC_015315	GGA	2	6	51517	51522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309971
1028	NC_015315	CAA	2	6	51578	51583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309971
1029	NC_015315	CGC	2	6	51590	51595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309971
1030	NC_015315	CGA	2	6	51611	51616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309971
1031	NC_015315	AG	3	6	51633	51638	50 %	0 %	50 %	0 %	327309971
1032	NC_015315	CCA	2	6	51644	51649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309971
1033	NC_015315	CGG	3	9	51664	51672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309971
1034	NC_015315	GTA	2	6	51725	51730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309971
1035	NC_015315	TGA	2	6	51766	51771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309971
1036	NC_015315	AGC	2	6	51789	51794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309971
1037	NC_015315	TCCA	2	8	51834	51841	25 %	25 %	0 %	50 %	327309971
1038	NC_015315	ACCC	2	8	51864	51871	25 %	0 %	0 %	75 %	327309971
1039	NC_015315	GCCC	2	8	51887	51894	0 %	0 %	25 %	75 %	327309971
1040	NC_015315	GAA	2	6	51920	51925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309971
1041	NC_015315	TAT	2	6	51938	51943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309971
1042	NC_015315	AGCC	2	8	51948	51955	25 %	0 %	25 %	50 %	327309971
1043	NC_015315	ATC	2	6	51960	51965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309971
1044	NC_015315	CCTCG	2	10	51995	52004	0 %	20 %	20 %	60 %	327309971
1045	NC_015315	TCC	2	6	52066	52071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309971
1046	NC_015315	ATC	2	6	52080	52085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309971
1047	NC_015315	GGC	2	6	52095	52100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309971
1048	NC_015315	GCC	2	6	52220	52225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309972
1049	NC_015315	T	6	6	52231	52236	0 %	100 %	0 %	0 %	327309972
1050	NC_015315	GAT	2	6	52259	52264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309972
1051	NC_015315	CCA	2	6	52270	52275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309972
1052	NC_015315	GCG	2	6	52332	52337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309972
1053	NC_015315	GAC	2	6	52379	52384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309972
1054	NC_015315	GAA	2	6	52415	52420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309972
1055	NC_015315	CT	3	6	52444	52449	0 %	50 %	0 %	50 %	327309972
1056	NC_015315	GGGA	2	8	52469	52476	25 %	0 %	75 %	0 %	327309972
1057	NC_015315	CGT	2	6	52507	52512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309972
1058	NC_015315	CAA	2	6	52529	52534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309972
1059	NC_015315	GTC	2	6	52556	52561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309972
1060	NC_015315	CCT	2	6	52592	52597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309972
1061	NC_015315	CCT	2	6	52633	52638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309972
1062	NC_015315	TCC	2	6	52665	52670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309972
1063	NC_015315	CCT	2	6	52676	52681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309972
1064	NC_015315	GGC	2	6	52685	52690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309972
1065	NC_015315	CCG	2	6	52729	52734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309972
1066	NC_015315	TA	3	6	52867	52872	50 %	50 %	0 %	0 %	327309973
1067	NC_015315	TA	3	6	52900	52905	50 %	50 %	0 %	0 %	327309973
1068	NC_015315	TTTATA	2	12	52997	53008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309973
1069	NC_015315	ATT	2	6	53014	53019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309973
1070	NC_015315	GCG	2	6	53259	53264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309974
1071	NC_015315	TCG	2	6	53277	53282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309974
1072	NC_015315	ACG	2	6	53301	53306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309974
1073	NC_015315	CGG	2	6	53307	53312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309974
1074	NC_015315	CTCTC	2	10	53403	53412	0 %	40 %	0 %	60 %	327309974
1075	NC_015315	CCT	2	6	53413	53418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309974
1076	NC_015315	CT	3	6	53417	53422	0 %	50 %	0 %	50 %	327309974
1077	NC_015315	CGG	2	6	53433	53438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309974
1078	NC_015315	TAC	2	6	53441	53446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309974
1079	NC_015315	TGG	2	6	53544	53549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309974
1080	NC_015315	AAG	2	6	53585	53590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309974
1081	NC_015315	GAG	2	6	53597	53602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309974
1082	NC_015315	GAG	2	6	53812	53817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309974
1083	NC_015315	GGA	2	6	53886	53891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309974
1084	NC_015315	AG	3	6	53902	53907	50 %	0 %	50 %	0 %	327309974
1085	NC_015315	CAC	2	6	53909	53914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309974
1086	NC_015315	GAG	2	6	53915	53920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309974
1087	NC_015315	GAG	2	6	53980	53985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309974
1088	NC_015315	ACA	2	6	54027	54032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309974
1089	NC_015315	TTC	2	6	54035	54040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309974
1090	NC_015315	GGC	2	6	54133	54138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309974
1091	NC_015315	GGT	2	6	54191	54196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309975
1092	NC_015315	CGG	2	6	54229	54234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309975
1093	NC_015315	CTG	2	6	54273	54278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309975
1094	NC_015315	AAGG	2	8	54308	54315	50 %	0 %	50 %	0 %	327309975
1095	NC_015315	CGG	2	6	54316	54321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309975
1096	NC_015315	GGA	2	6	54362	54367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309975
1097	NC_015315	GTC	2	6	54412	54417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309976
1098	NC_015315	TAC	2	6	54436	54441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309976
1099	NC_015315	CTC	2	6	54481	54486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309976
1100	NC_015315	CGT	3	9	54516	54524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309976
1101	NC_015315	AAG	2	6	54547	54552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309976
1102	NC_015315	GCG	2	6	54553	54558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309976
1103	NC_015315	GTC	2	6	54607	54612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309976
1104	NC_015315	CGT	2	6	54632	54637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309976
1105	NC_015315	CTA	2	6	54666	54671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309976
1106	NC_015315	TAG	2	6	54680	54685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309976
1107	NC_015315	GAG	2	6	54699	54704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309976
1108	NC_015315	GCG	2	6	55251	55256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309977
1109	NC_015315	AGG	3	9	55308	55316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309977
1110	NC_015315	CCT	2	6	55352	55357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309977
1111	NC_015315	GGC	2	6	55415	55420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309977
1112	NC_015315	ACG	2	6	55444	55449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309977
1113	NC_015315	GGC	2	6	55459	55464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309977
1114	NC_015315	GC	3	6	55519	55524	0 %	0 %	50 %	50 %	327309977
1115	NC_015315	CGCGC	2	10	55585	55594	0 %	0 %	40 %	60 %	327309977
1116	NC_015315	CCA	2	6	55625	55630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309977
1117	NC_015315	GC	3	6	55669	55674	0 %	0 %	50 %	50 %	327309977
1118	NC_015315	TC	3	6	55709	55714	0 %	50 %	0 %	50 %	327309977
1119	NC_015315	CCT	2	6	55750	55755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309977
1120	NC_015315	CGA	2	6	55801	55806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309977
1121	NC_015315	GCCGTC	2	12	55901	55912	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	327309977
1122	NC_015315	CATC	2	8	55928	55935	25 %	25 %	0 %	50 %	327309977
1123	NC_015315	CGA	2	6	55945	55950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309977
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1125	NC_015315	GTA	2	6	55997	56002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309977
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1497	NC_015315	GAG	2	6	72263	72268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309995
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