MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_014974	GTG	2	6	44980	44985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449160
1003	NC_014974	GAG	2	6	44999	45004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449160
1004	NC_014974	GGC	2	6	45086	45091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449160
1005	NC_014974	CAC	2	6	45093	45098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449160
1006	NC_014974	TGGCC	2	10	45263	45272	0 %	20 %	40 %	40 %	320449160
1007	NC_014974	GGCG	2	8	45278	45285	0 %	0 %	75 %	25 %	320449160
1008	NC_014974	GGC	2	6	45411	45416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449160
1009	NC_014974	GGA	2	6	45441	45446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449160
1010	NC_014974	TGA	2	6	45500	45505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449160
1011	NC_014974	ATG	2	6	45520	45525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449160
1012	NC_014974	GAG	2	6	45594	45599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449161
1013	NC_014974	GCGG	2	8	45600	45607	0 %	0 %	75 %	25 %	320449161
1014	NC_014974	GCCTTG	2	12	45616	45627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449161
1015	NC_014974	CGG	2	6	45635	45640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449161
1016	NC_014974	CCT	2	6	45725	45730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449161
1017	NC_014974	CTT	2	6	45738	45743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449161
1018	NC_014974	CCT	2	6	45746	45751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449161
1019	NC_014974	CCA	2	6	45764	45769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449161
1020	NC_014974	CGG	2	6	45836	45841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449161
1021	NC_014974	CAA	2	6	45873	45878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449161
1022	NC_014974	ACA	2	6	45909	45914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449162
1023	NC_014974	CAC	2	6	45931	45936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449162
1024	NC_014974	TCC	2	6	45947	45952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449162
1025	NC_014974	AGG	2	6	45971	45976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449162
1026	NC_014974	CAC	2	6	45994	45999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449162
1027	NC_014974	GGT	2	6	46003	46008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449162
1028	NC_014974	CCA	2	6	46020	46025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449162
1029	NC_014974	TCT	2	6	46053	46058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449162
1030	NC_014974	GTA	2	6	46060	46065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449162
1031	NC_014974	CCT	2	6	46086	46091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449162
1032	NC_014974	TGA	2	6	46191	46196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449162
1033	NC_014974	TGG	3	9	46263	46271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449162
1034	NC_014974	GAA	2	6	46300	46305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449162
1035	NC_014974	AGG	3	9	46430	46438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449162
1036	NC_014974	CCA	2	6	46449	46454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449162
1037	NC_014974	CTG	2	6	46528	46533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449163
1038	NC_014974	GGT	2	6	46607	46612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449163
1039	NC_014974	C	6	6	46638	46643	0 %	0 %	0 %	100 %	320449163
1040	NC_014974	ACC	2	6	46684	46689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449163
1041	NC_014974	CCT	2	6	46693	46698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449163
1042	NC_014974	GGT	2	6	46709	46714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449163
1043	NC_014974	ATG	2	6	46716	46721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449163
1044	NC_014974	CCCG	2	8	46730	46737	0 %	0 %	25 %	75 %	320449163
1045	NC_014974	CCA	2	6	46757	46762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449163
1046	NC_014974	GGC	2	6	46803	46808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449163
1047	NC_014974	CAC	2	6	46818	46823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449163
1048	NC_014974	GAG	2	6	46955	46960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449164
1049	NC_014974	CCCTT	2	10	46974	46983	0 %	40 %	0 %	60 %	320449164
1050	NC_014974	GGC	2	6	47042	47047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449164
1051	NC_014974	CCT	2	6	47162	47167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449164
1052	NC_014974	GTG	2	6	47199	47204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449164
1053	NC_014974	GGGGC	2	10	47205	47214	0 %	0 %	80 %	20 %	320449164
1054	NC_014974	CGC	2	6	47240	47245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449164
1055	NC_014974	CTG	2	6	47274	47279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449164
1056	NC_014974	GGA	2	6	47294	47299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449164
1057	NC_014974	TGCGG	2	10	47309	47318	0 %	20 %	60 %	20 %	320449164
1058	NC_014974	GGA	2	6	47321	47326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449164
1059	NC_014974	CCA	2	6	47338	47343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449164
1060	NC_014974	ATGG	2	8	47442	47449	25 %	25 %	50 %	0 %	320449164
1061	NC_014974	GGGGAT	2	12	47471	47482	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	320449164
1062	NC_014974	TCT	2	6	47492	47497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449164
1063	NC_014974	GA	3	6	47499	47504	50 %	0 %	50 %	0 %	320449164
1064	NC_014974	G	6	6	47762	47767	0 %	0 %	100 %	0 %	320449164
1065	NC_014974	GGA	2	6	47817	47822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449164
1066	NC_014974	GTG	2	6	47904	47909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449164
1067	NC_014974	CTC	2	6	47973	47978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449164
1068	NC_014974	GGC	2	6	48038	48043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449164
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1070	NC_014974	ATC	2	6	48135	48140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449164
1071	NC_014974	CTT	2	6	48147	48152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449164
1072	NC_014974	TGG	3	9	48165	48173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449164
1073	NC_014974	AAG	2	6	48188	48193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449165
1074	NC_014974	GTG	2	6	48233	48238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449165
1075	NC_014974	CGGGG	2	10	48256	48265	0 %	0 %	80 %	20 %	320449165
1076	NC_014974	GGCGG	2	10	48289	48298	0 %	0 %	80 %	20 %	320449165
1077	NC_014974	GGC	2	6	48319	48324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449165
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1079	NC_014974	GGAG	2	8	48427	48434	25 %	0 %	75 %	0 %	320449165
1080	NC_014974	G	6	6	48533	48538	0 %	0 %	100 %	0 %	320449165
1081	NC_014974	CAGCGC	2	12	48539	48550	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320449165
1082	NC_014974	GGC	2	6	48559	48564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449165
1083	NC_014974	CCG	2	6	48609	48614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449165
1084	NC_014974	GAA	2	6	48661	48666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449165
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1086	NC_014974	CCA	2	6	48691	48696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449165
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1088	NC_014974	GCGG	2	8	48712	48719	0 %	0 %	75 %	25 %	320449165
1089	NC_014974	G	6	6	48739	48744	0 %	0 %	100 %	0 %	320449165
1090	NC_014974	GGA	2	6	48754	48759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449165
1091	NC_014974	G	6	6	48789	48794	0 %	0 %	100 %	0 %	320449165
1092	NC_014974	TGG	3	9	48865	48873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449166
1093	NC_014974	GCCCA	2	10	48888	48897	20 %	0 %	20 %	60 %	320449166
1094	NC_014974	GCATG	2	10	48902	48911	20 %	20 %	40 %	20 %	320449166
1095	NC_014974	CTT	2	6	49046	49051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449166
1096	NC_014974	C	6	6	49096	49101	0 %	0 %	0 %	100 %	320449166
1097	NC_014974	CAAG	2	8	49109	49116	50 %	0 %	25 %	25 %	320449166
1098	NC_014974	ACCG	2	8	49212	49219	25 %	0 %	25 %	50 %	320449166
1099	NC_014974	G	6	6	49219	49224	0 %	0 %	100 %	0 %	320449166
1100	NC_014974	CGCC	2	8	49268	49275	0 %	0 %	25 %	75 %	320449166
1101	NC_014974	CTA	2	6	49283	49288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449166
1102	NC_014974	G	6	6	49291	49296	0 %	0 %	100 %	0 %	320449166
1103	NC_014974	GAT	2	6	49301	49306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449166
1104	NC_014974	GGT	2	6	49307	49312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449166
1105	NC_014974	CGCCAG	2	12	49337	49348	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320449166
1106	NC_014974	TGG	2	6	49453	49458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449166
1107	NC_014974	GAG	2	6	49500	49505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449166
1108	NC_014974	CGG	2	6	49579	49584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449167
1109	NC_014974	CTTC	2	8	49605	49612	0 %	50 %	0 %	50 %	320449167
1110	NC_014974	GGC	2	6	49623	49628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449167
1111	NC_014974	GGGC	2	8	49779	49786	0 %	0 %	75 %	25 %	320449167
1112	NC_014974	AGG	2	6	49802	49807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449167
1113	NC_014974	C	6	6	49844	49849	0 %	0 %	0 %	100 %	320449167
1114	NC_014974	CGG	2	6	49859	49864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449167
1115	NC_014974	ACC	2	6	49880	49885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449167
1116	NC_014974	GCGG	2	8	49974	49981	0 %	0 %	75 %	25 %	320449167
1117	NC_014974	G	7	7	49980	49986	0 %	0 %	100 %	0 %	320449167
1118	NC_014974	AAGG	2	8	50014	50021	50 %	0 %	50 %	0 %	320449167
1119	NC_014974	CCG	2	6	50042	50047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449167
1120	NC_014974	TTC	2	6	50085	50090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449168
1121	NC_014974	TCC	2	6	50128	50133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449168
1122	NC_014974	CTTC	2	8	50138	50145	0 %	50 %	0 %	50 %	320449168
1123	NC_014974	TGG	2	6	50185	50190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449168
1124	NC_014974	CTTCTC	2	12	50205	50216	0 %	50 %	0 %	50 %	320449168
1125	NC_014974	C	6	6	50220	50225	0 %	0 %	0 %	100 %	320449168
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1255	NC_014974	GGC	2	6	55158	55163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449175
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