MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014974	CCA	2	6	23551	23556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449131
502	NC_014974	TCC	2	6	23565	23570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449131
503	NC_014974	AGG	2	6	23614	23619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449131
504	NC_014974	CGG	2	6	23632	23637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449131
505	NC_014974	CGT	2	6	23644	23649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449131
506	NC_014974	C	6	6	23684	23689	0 %	0 %	0 %	100 %	320449131
507	NC_014974	TGA	2	6	23728	23733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449131
508	NC_014974	TGG	2	6	23751	23756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449131
509	NC_014974	GAT	2	6	23873	23878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449131
510	NC_014974	CTC	2	6	23912	23917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449131
511	NC_014974	GTC	2	6	23936	23941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449131
512	NC_014974	CTAG	2	8	23978	23985	25 %	25 %	25 %	25 %	320449132
513	NC_014974	TTC	2	6	23989	23994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449132
514	NC_014974	CCA	2	6	23996	24001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449132
515	NC_014974	CGG	2	6	24119	24124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449132
516	NC_014974	CTC	2	6	24141	24146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449132
517	NC_014974	GAG	2	6	24207	24212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449132
518	NC_014974	C	7	7	24235	24241	0 %	0 %	0 %	100 %	320449132
519	NC_014974	AGG	2	6	24259	24264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449132
520	NC_014974	G	6	6	24271	24276	0 %	0 %	100 %	0 %	320449132
521	NC_014974	G	8	8	24288	24295	0 %	0 %	100 %	0 %	320449132
522	NC_014974	ACC	2	6	24301	24306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449132
523	NC_014974	GTA	2	6	24363	24368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449132
524	NC_014974	TCC	2	6	24376	24381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449132
525	NC_014974	C	6	6	24380	24385	0 %	0 %	0 %	100 %	320449132
526	NC_014974	CCT	2	6	24410	24415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449132
527	NC_014974	GGGCC	2	10	24428	24437	0 %	0 %	60 %	40 %	320449132
528	NC_014974	CACCCG	2	12	24441	24452	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320449132
529	NC_014974	G	8	8	24456	24463	0 %	0 %	100 %	0 %	320449132
530	NC_014974	GTG	2	6	24508	24513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449132
531	NC_014974	AAG	2	6	24537	24542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449132
532	NC_014974	GGGCC	2	10	24543	24552	0 %	0 %	60 %	40 %	320449132
533	NC_014974	G	6	6	24572	24577	0 %	0 %	100 %	0 %	320449132
534	NC_014974	GGC	2	6	24582	24587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449132
535	NC_014974	AGG	2	6	24592	24597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449132
536	NC_014974	CTT	2	6	24709	24714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449133
537	NC_014974	CTC	3	9	24727	24735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449133
538	NC_014974	GCG	2	6	24758	24763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449133
539	NC_014974	TCC	2	6	24815	24820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449133
540	NC_014974	CCG	2	6	24892	24897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449133
541	NC_014974	CGG	2	6	24906	24911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449133
542	NC_014974	CTT	2	6	24922	24927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449133
543	NC_014974	GGCCTC	2	12	24952	24963	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449133
544	NC_014974	CTC	2	6	25024	25029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449133
545	NC_014974	CTG	2	6	25033	25038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449133
546	NC_014974	TCC	2	6	25071	25076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449133
547	NC_014974	CCT	2	6	25086	25091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449133
548	NC_014974	GCCT	2	8	25108	25115	0 %	25 %	25 %	50 %	320449133
549	NC_014974	CCT	2	6	25122	25127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449133
550	NC_014974	TCC	2	6	25136	25141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449133
551	NC_014974	GCC	2	6	25208	25213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449133
552	NC_014974	CTT	2	6	25239	25244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449133
553	NC_014974	TCC	2	6	25250	25255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449133
554	NC_014974	TGA	2	6	25266	25271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449133
555	NC_014974	TCT	2	6	25272	25277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449133
556	NC_014974	GCA	2	6	25296	25301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449133
557	NC_014974	GGC	2	6	25497	25502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449134
558	NC_014974	G	6	6	25532	25537	0 %	0 %	100 %	0 %	320449134
559	NC_014974	CCA	3	9	25538	25546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449134
560	NC_014974	CGG	2	6	25558	25563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449134
561	NC_014974	GCA	2	6	25601	25606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449134
562	NC_014974	AGG	2	6	25607	25612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449134
563	NC_014974	GCGG	2	8	25620	25627	0 %	0 %	75 %	25 %	320449134
564	NC_014974	CGG	2	6	25646	25651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449134
565	NC_014974	GGA	2	6	25674	25679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449134
566	NC_014974	GGA	2	6	25689	25694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449134
567	NC_014974	CCT	2	6	25728	25733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449134
568	NC_014974	CCA	2	6	25740	25745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449134
569	NC_014974	GCT	2	6	25761	25766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449134
570	NC_014974	GTG	2	6	25840	25845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449134
571	NC_014974	CTT	2	6	25848	25853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449134
572	NC_014974	CAG	2	6	25861	25866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449134
573	NC_014974	TCT	2	6	25875	25880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449134
574	NC_014974	GAG	2	6	25900	25905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449134
575	NC_014974	TGGCCT	2	12	25907	25918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449134
576	NC_014974	CTTC	2	8	25941	25948	0 %	50 %	0 %	50 %	320449134
577	NC_014974	GCAG	2	8	26026	26033	25 %	0 %	50 %	25 %	320449134
578	NC_014974	AGG	2	6	26034	26039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449134
579	NC_014974	CCT	2	6	26113	26118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449135
580	NC_014974	CGGGG	2	10	26128	26137	0 %	0 %	80 %	20 %	320449135
581	NC_014974	ACC	2	6	26141	26146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449135
582	NC_014974	GGGAA	2	10	26215	26224	40 %	0 %	60 %	0 %	320449135
583	NC_014974	GGA	2	6	26293	26298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449135
584	NC_014974	CCT	2	6	26302	26307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449135
585	NC_014974	CGCC	2	8	26314	26321	0 %	0 %	25 %	75 %	320449135
586	NC_014974	AGG	2	6	26334	26339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449135
587	NC_014974	ACGCCC	2	12	26388	26399	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320449135
588	NC_014974	G	6	6	26417	26422	0 %	0 %	100 %	0 %	320449135
589	NC_014974	GGC	2	6	26424	26429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449135
590	NC_014974	CCTGGC	2	12	26434	26445	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449135
591	NC_014974	GGT	2	6	26452	26457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449135
592	NC_014974	CAC	2	6	26491	26496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449135
593	NC_014974	CATC	2	8	26536	26543	25 %	25 %	0 %	50 %	320449135
594	NC_014974	AGG	2	6	26544	26549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449135
595	NC_014974	G	6	6	26556	26561	0 %	0 %	100 %	0 %	320449135
596	NC_014974	CGG	2	6	26562	26567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449135
597	NC_014974	CAC	2	6	26575	26580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449135
598	NC_014974	CGG	2	6	26629	26634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449135
599	NC_014974	CAAGG	2	10	26680	26689	40 %	0 %	40 %	20 %	320449135
600	NC_014974	GAGG	2	8	26722	26729	25 %	0 %	75 %	0 %	320449135
601	NC_014974	GGAG	2	8	26793	26800	25 %	0 %	75 %	0 %	320449135
602	NC_014974	GGA	2	6	26818	26823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449135
603	NC_014974	CTT	2	6	26855	26860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449135
604	NC_014974	AGG	2	6	26865	26870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449135
605	NC_014974	CCTGGC	2	12	26886	26897	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449136
606	NC_014974	CTC	3	9	26971	26979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449136
607	NC_014974	AGG	2	6	27080	27085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449136
608	NC_014974	GGC	2	6	27108	27113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449136
609	NC_014974	GGT	2	6	27126	27131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449136
610	NC_014974	TGG	2	6	27167	27172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449136
611	NC_014974	GCG	2	6	27198	27203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449136
612	NC_014974	G	6	6	27203	27208	0 %	0 %	100 %	0 %	320449136
613	NC_014974	CCAGGC	2	12	27261	27272	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320449136
614	NC_014974	AGG	2	6	27293	27298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449136
615	NC_014974	TGG	2	6	27314	27319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449136
616	NC_014974	C	6	6	27349	27354	0 %	0 %	0 %	100 %	320449136
617	NC_014974	CAT	2	6	27420	27425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449136
618	NC_014974	TCC	2	6	27452	27457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449136
619	NC_014974	GAGG	2	8	27477	27484	25 %	0 %	75 %	0 %	320449136
620	NC_014974	ATG	2	6	27496	27501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320449136
621	NC_014974	CTG	2	6	27508	27513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449136
622	NC_014974	TGC	2	6	27554	27559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449136
623	NC_014974	CTG	2	6	27589	27594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449136
624	NC_014974	CTC	3	9	27649	27657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449136
625	NC_014974	CCA	2	6	27767	27772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449136
626	NC_014974	CTT	2	6	27826	27831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449136
627	NC_014974	TCC	2	6	27866	27871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449136
628	NC_014974	GGC	2	6	27921	27926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449136
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645	NC_014974	GGGGA	2	10	28542	28551	20 %	0 %	80 %	0 %	320449137
646	NC_014974	G	6	6	28581	28586	0 %	0 %	100 %	0 %	320449137
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753	NC_014974	C	6	6	34125	34130	0 %	0 %	0 %	100 %	320449144
754	NC_014974	GAG	4	12	34150	34161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449144
755	NC_014974	GA	3	6	34290	34295	50 %	0 %	50 %	0 %	320449144
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