MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 plasmid pTHEAM01

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014917	GA	4	8	616	623	50 %	0 %	50 %	0 %	319774849
2	NC_014917	CT	3	6	676	681	0 %	50 %	0 %	50 %	319774850
3	NC_014917	GA	3	6	1082	1087	50 %	0 %	50 %	0 %	319774851
4	NC_014917	CT	4	8	1397	1404	0 %	50 %	0 %	50 %	319774851
5	NC_014917	TC	3	6	1443	1448	0 %	50 %	0 %	50 %	319774851
6	NC_014917	AT	4	8	1456	1463	50 %	50 %	0 %	0 %	319774851
7	NC_014917	AT	3	6	1480	1485	50 %	50 %	0 %	0 %	319774851
8	NC_014917	AG	3	6	1834	1839	50 %	0 %	50 %	0 %	319774851
9	NC_014917	AG	3	6	1974	1979	50 %	0 %	50 %	0 %	319774851
10	NC_014917	AG	3	6	2355	2360	50 %	0 %	50 %	0 %	319774851
11	NC_014917	CT	3	6	2832	2837	0 %	50 %	0 %	50 %	319774852
12	NC_014917	TC	3	6	2895	2900	0 %	50 %	0 %	50 %	319774852
13	NC_014917	TC	4	8	3370	3377	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
14	NC_014917	AG	3	6	3569	3574	50 %	0 %	50 %	0 %	319774853
15	NC_014917	CT	3	6	4307	4312	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
16	NC_014917	AG	3	6	4394	4399	50 %	0 %	50 %	0 %	319774853
17	NC_014917	CT	3	6	4543	4548	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
18	NC_014917	CT	4	8	5263	5270	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
19	NC_014917	TG	3	6	5460	5465	0 %	50 %	50 %	0 %	319774853
20	NC_014917	TC	3	6	5841	5846	0 %	50 %	0 %	50 %	319774854
21	NC_014917	AG	3	6	5929	5934	50 %	0 %	50 %	0 %	319774854
22	NC_014917	AG	3	6	6484	6489	50 %	0 %	50 %	0 %	319774854
23	NC_014917	TC	3	6	7137	7142	0 %	50 %	0 %	50 %	319774855
24	NC_014917	CT	3	6	7621	7626	0 %	50 %	0 %	50 %	319774855
25	NC_014917	TC	3	6	7699	7704	0 %	50 %	0 %	50 %	319774856
26	NC_014917	TC	3	6	8406	8411	0 %	50 %	0 %	50 %	319774857
27	NC_014917	TC	3	6	8946	8951	0 %	50 %	0 %	50 %	319774858
28	NC_014917	AG	5	10	9175	9184	50 %	0 %	50 %	0 %	319774858
29	NC_014917	CT	3	6	9719	9724	0 %	50 %	0 %	50 %	319774859
30	NC_014917	AG	3	6	9997	10002	50 %	0 %	50 %	0 %	319774860
31	NC_014917	CT	3	6	10260	10265	0 %	50 %	0 %	50 %	319774861
32	NC_014917	CT	3	6	10643	10648	0 %	50 %	0 %	50 %	319774861
33	NC_014917	CT	3	6	11276	11281	0 %	50 %	0 %	50 %	319774862
34	NC_014917	CT	3	6	11392	11397	0 %	50 %	0 %	50 %	319774862
35	NC_014917	CT	3	6	11582	11587	0 %	50 %	0 %	50 %	319774862
36	NC_014917	CT	3	6	11959	11964	0 %	50 %	0 %	50 %	319774863
37	NC_014917	TC	3	6	12216	12221	0 %	50 %	0 %	50 %	319774863
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39	NC_014917	AG	3	6	12538	12543	50 %	0 %	50 %	0 %	319774864
40	NC_014917	CT	3	6	12606	12611	0 %	50 %	0 %	50 %	319774864
41	NC_014917	CT	3	6	12640	12645	0 %	50 %	0 %	50 %	319774864
42	NC_014917	CT	3	6	13039	13044	0 %	50 %	0 %	50 %	319774865
43	NC_014917	TC	3	6	13080	13085	0 %	50 %	0 %	50 %	319774865
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67	NC_014917	AG	3	6	22951	22956	50 %	0 %	50 %	0 %	319774877
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71	NC_014917	AG	3	6	24044	24049	50 %	0 %	50 %	0 %	319774879
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111	NC_014917	TC	3	6	43920	43925	0 %	50 %	0 %	50 %	319774906
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.