MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 plasmid pTHEAM01

Total Repeats: 1049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014917	CGA	2	6	369	374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774849
2	NC_014917	CTG	2	6	376	381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774849
3	NC_014917	AGT	3	9	802	810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774850
4	NC_014917	CTA	2	6	826	831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774850
5	NC_014917	CTC	2	6	840	845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774850
6	NC_014917	CTT	2	6	869	874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774850
7	NC_014917	CGC	2	6	1291	1296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774851
8	NC_014917	CAC	2	6	1449	1454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774851
9	NC_014917	TGG	2	6	1474	1479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774851
10	NC_014917	GTA	2	6	1490	1495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774851
11	NC_014917	GTA	2	6	1511	1516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774851
12	NC_014917	TCC	2	6	1543	1548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774851
13	NC_014917	CTC	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774851
14	NC_014917	CTC	2	6	1858	1863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774851
15	NC_014917	CTC	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774851
16	NC_014917	GAA	2	6	2029	2034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774851
17	NC_014917	TGT	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774851
18	NC_014917	TTC	2	6	2091	2096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774851
19	NC_014917	CTC	2	6	2148	2153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774851
20	NC_014917	TTG	2	6	2226	2231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774851
21	NC_014917	GGT	3	9	2254	2262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774851
22	NC_014917	GGC	2	6	2389	2394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774851
23	NC_014917	CTT	2	6	2421	2426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774851
24	NC_014917	TAT	2	6	2643	2648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774852
25	NC_014917	GTT	2	6	2657	2662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774852
26	NC_014917	CTT	2	6	3036	3041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774852
27	NC_014917	CAG	2	6	3094	3099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774852
28	NC_014917	CCT	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774853
29	NC_014917	TCC	2	6	3150	3155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774853
30	NC_014917	AGG	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774853
31	NC_014917	TCA	2	6	3300	3305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774853
32	NC_014917	TCT	2	6	3342	3347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774853
33	NC_014917	GAA	2	6	3545	3550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774853
34	NC_014917	AGT	3	9	3631	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774853
35	NC_014917	GAA	2	6	3755	3760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774853
36	NC_014917	GTG	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774853
37	NC_014917	CCT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774853
38	NC_014917	CAG	2	6	3875	3880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774853
39	NC_014917	GAA	2	6	3888	3893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774853
40	NC_014917	CTC	2	6	3898	3903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774853
41	NC_014917	CGA	2	6	3946	3951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774853
42	NC_014917	TCG	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774853
43	NC_014917	GTC	2	6	4056	4061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774853
44	NC_014917	GTA	2	6	4106	4111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774853
45	NC_014917	AGT	2	6	4204	4209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774853
46	NC_014917	TGA	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774853
47	NC_014917	GAG	2	6	4326	4331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774853
48	NC_014917	AGT	2	6	4378	4383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774853
49	NC_014917	CCT	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774853
50	NC_014917	AGA	2	6	4615	4620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774853
51	NC_014917	TCG	2	6	4665	4670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774853
52	NC_014917	AGT	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774853
53	NC_014917	AGG	2	6	4818	4823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774853
54	NC_014917	ACC	2	6	4932	4937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774853
55	NC_014917	CGG	2	6	4982	4987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774853
56	NC_014917	CTT	3	9	5041	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774853
57	NC_014917	CTG	2	6	5104	5109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774853
58	NC_014917	CCT	2	6	5122	5127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774853
59	NC_014917	GAA	2	6	5152	5157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774853
60	NC_014917	CCG	2	6	5167	5172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774853
61	NC_014917	TTC	2	6	5242	5247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774853
62	NC_014917	CCG	2	6	5469	5474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774853
63	NC_014917	TCG	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774853
64	NC_014917	GTC	2	6	5523	5528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774853
65	NC_014917	GCG	2	6	5575	5580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774853
66	NC_014917	GAA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774854
67	NC_014917	CTC	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774854
68	NC_014917	CGA	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774854
69	NC_014917	AGA	2	6	5952	5957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774854
70	NC_014917	ACT	2	6	6059	6064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774854
71	NC_014917	CCA	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774854
72	NC_014917	GGT	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774854
73	NC_014917	GAG	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774854
74	NC_014917	CGA	2	6	6255	6260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774854
75	NC_014917	GCC	2	6	6274	6279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774854
76	NC_014917	CCT	2	6	6291	6296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774854
77	NC_014917	CAA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774854
78	NC_014917	GAG	2	6	6364	6369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774854
79	NC_014917	CGA	2	6	6384	6389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774854
80	NC_014917	CTT	2	6	6490	6495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774854
81	NC_014917	ACT	2	6	6653	6658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774854
82	NC_014917	GAA	2	6	6664	6669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774854
83	NC_014917	CTA	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774854
84	NC_014917	AGA	2	6	6849	6854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774855
85	NC_014917	GTT	2	6	6883	6888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774855
86	NC_014917	AGG	2	6	6933	6938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774855
87	NC_014917	GAG	2	6	6952	6957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774855
88	NC_014917	ATC	2	6	7012	7017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774855
89	NC_014917	ATT	2	6	7024	7029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774855
90	NC_014917	ACA	2	6	7190	7195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774855
91	NC_014917	GCC	2	6	7256	7261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774855
92	NC_014917	AAG	2	6	7312	7317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774855
93	NC_014917	CTT	2	6	7345	7350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774855
94	NC_014917	CCT	2	6	7394	7399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774855
95	NC_014917	CTC	2	6	7504	7509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774855
96	NC_014917	AGA	2	6	7608	7613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774855
97	NC_014917	GAG	2	6	7659	7664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774855
98	NC_014917	GAG	2	6	7668	7673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774855
99	NC_014917	GAG	2	6	7678	7683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774855
100	NC_014917	CTT	2	6	7684	7689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774855
101	NC_014917	TCT	2	6	7830	7835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774856
102	NC_014917	CTC	2	6	7952	7957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774856
103	NC_014917	TCA	2	6	8028	8033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774857
104	NC_014917	CTC	2	6	8065	8070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774857
105	NC_014917	ATC	2	6	8180	8185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774857
106	NC_014917	GAA	2	6	8191	8196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774857
107	NC_014917	CTT	2	6	8260	8265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774857
108	NC_014917	GAA	2	6	8431	8436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774857
109	NC_014917	TCT	2	6	8472	8477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774857
110	NC_014917	CCG	2	6	8649	8654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774858
111	NC_014917	AGC	2	6	8666	8671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774858
112	NC_014917	TCC	2	6	8672	8677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774858
113	NC_014917	GAA	2	6	8791	8796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774858
114	NC_014917	ACT	2	6	8801	8806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774858
115	NC_014917	GAG	2	6	8875	8880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774858
116	NC_014917	CGG	2	6	8959	8964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774858
117	NC_014917	CTC	2	6	9017	9022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774858
118	NC_014917	CTG	2	6	9059	9064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774858
119	NC_014917	CCA	2	6	9090	9095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774858
120	NC_014917	TAT	2	6	9284	9289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774859
121	NC_014917	GTC	2	6	9305	9310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774859
122	NC_014917	GCT	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774859
123	NC_014917	CCA	2	6	9406	9411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774859
124	NC_014917	GAG	2	6	9527	9532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774859
125	NC_014917	CGG	2	6	9616	9621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774859
126	NC_014917	GGC	2	6	9688	9693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774859
127	NC_014917	GAG	2	6	9773	9778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774860
128	NC_014917	GGA	2	6	9857	9862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774860
129	NC_014917	GAG	2	6	10272	10277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774861
130	NC_014917	GAG	2	6	10295	10300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774861
131	NC_014917	TCA	2	6	10321	10326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774861
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256	NC_014917	TGA	2	6	19744	19749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774873
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