MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 plasmid pTHEAM01

Total Repeats: 1541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014917	CCG	2	6	25351	25356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774881
502	NC_014917	GCC	2	6	25367	25372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774881
503	NC_014917	GCA	2	6	25429	25434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774881
504	NC_014917	TAA	2	6	25459	25464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774881
505	NC_014917	CCG	2	6	25539	25544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774881
506	NC_014917	CTC	2	6	25548	25553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774881
507	NC_014917	A	6	6	25592	25597	100 %	0 %	0 %	0 %	319774881
508	NC_014917	TTC	2	6	25632	25637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774881
509	NC_014917	TTC	2	6	25693	25698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774881
510	NC_014917	CCT	2	6	25774	25779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774881
511	NC_014917	AACGG	2	10	25813	25822	40 %	0 %	40 %	20 %	319774881
512	NC_014917	CGC	2	6	25849	25854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774881
513	NC_014917	AGGC	2	8	25873	25880	25 %	0 %	50 %	25 %	319774881
514	NC_014917	CAC	2	6	25919	25924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774881
515	NC_014917	AGC	2	6	25962	25967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774881
516	NC_014917	TCA	2	6	25972	25977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774881
517	NC_014917	GCC	2	6	26051	26056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774881
518	NC_014917	GCA	2	6	26090	26095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774881
519	NC_014917	CTC	2	6	26376	26381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774882
520	NC_014917	TA	3	6	26394	26399	50 %	50 %	0 %	0 %	319774882
521	NC_014917	CGG	2	6	26402	26407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774882
522	NC_014917	TTA	2	6	26441	26446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774882
523	NC_014917	CTC	2	6	26464	26469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774882
524	NC_014917	GCCT	2	8	26539	26546	0 %	25 %	25 %	50 %	319774882
525	NC_014917	GTA	2	6	26565	26570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774882
526	NC_014917	GAG	2	6	26575	26580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774882
527	NC_014917	CT	4	8	26654	26661	0 %	50 %	0 %	50 %	319774882
528	NC_014917	C	6	6	26665	26670	0 %	0 %	0 %	100 %	319774882
529	NC_014917	CCCT	2	8	26701	26708	0 %	25 %	0 %	75 %	319774882
530	NC_014917	CTCG	2	8	26739	26746	0 %	25 %	25 %	50 %	319774882
531	NC_014917	CAG	2	6	26769	26774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774882
532	NC_014917	GGC	2	6	26775	26780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774882
533	NC_014917	CTC	2	6	26832	26837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774882
534	NC_014917	TGGGCT	2	12	26846	26857	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319774882
535	NC_014917	CTTTGG	2	12	26865	26876	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319774882
536	NC_014917	TGGAA	2	10	26889	26898	40 %	20 %	40 %	0 %	319774882
537	NC_014917	AGC	2	6	26949	26954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774882
538	NC_014917	GCTCT	2	10	26958	26967	0 %	40 %	20 %	40 %	319774882
539	NC_014917	CTC	2	6	27184	27189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774883
540	NC_014917	TCC	2	6	27209	27214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774883
541	NC_014917	GTA	2	6	27242	27247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774883
542	NC_014917	TCG	2	6	27291	27296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774883
543	NC_014917	TCT	2	6	27334	27339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774883
544	NC_014917	CTC	2	6	27347	27352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774883
545	NC_014917	AG	3	6	27398	27403	50 %	0 %	50 %	0 %	319774883
546	NC_014917	CCTT	2	8	27408	27415	0 %	50 %	0 %	50 %	319774883
547	NC_014917	GTA	2	6	27431	27436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774883
548	NC_014917	GAA	2	6	27446	27451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774883
549	NC_014917	TCTCT	2	10	27510	27519	0 %	60 %	0 %	40 %	319774884
550	NC_014917	TAA	2	6	27563	27568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774884
551	NC_014917	GTC	2	6	27702	27707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774884
552	NC_014917	AGA	2	6	27740	27745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774884
553	NC_014917	ACC	2	6	27751	27756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774884
554	NC_014917	CGT	2	6	27762	27767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774884
555	NC_014917	GCAG	2	8	27781	27788	25 %	0 %	50 %	25 %	319774884
556	NC_014917	TTGAG	2	10	27955	27964	20 %	40 %	40 %	0 %	319774885
557	NC_014917	CGG	2	6	28024	28029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774885
558	NC_014917	CCG	2	6	28057	28062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774885
559	NC_014917	CGC	2	6	28070	28075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774885
560	NC_014917	TCAA	2	8	28080	28087	50 %	25 %	0 %	25 %	319774885
561	NC_014917	CAG	2	6	28118	28123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774885
562	NC_014917	CCT	2	6	28135	28140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774885
563	NC_014917	ACCTCT	2	12	28149	28160	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	319774885
564	NC_014917	TC	3	6	28172	28177	0 %	50 %	0 %	50 %	319774886
565	NC_014917	A	6	6	28240	28245	100 %	0 %	0 %	0 %	319774886
566	NC_014917	GTCC	2	8	28264	28271	0 %	25 %	25 %	50 %	319774886
567	NC_014917	ACCC	2	8	28313	28320	25 %	0 %	0 %	75 %	319774886
568	NC_014917	CT	3	6	28333	28338	0 %	50 %	0 %	50 %	319774886
569	NC_014917	CT	3	6	28424	28429	0 %	50 %	0 %	50 %	319774886
570	NC_014917	G	6	6	28475	28480	0 %	0 %	100 %	0 %	319774886
571	NC_014917	TCCCT	2	10	28484	28493	0 %	40 %	0 %	60 %	319774886
572	NC_014917	TC	3	6	28564	28569	0 %	50 %	0 %	50 %	319774886
573	NC_014917	TGG	2	6	28839	28844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774886
574	NC_014917	T	6	6	28868	28873	0 %	100 %	0 %	0 %	319774887
575	NC_014917	A	7	7	28941	28947	100 %	0 %	0 %	0 %	319774887
576	NC_014917	CTC	2	6	29003	29008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774887
577	NC_014917	TTA	2	6	29020	29025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774887
578	NC_014917	AG	3	6	29037	29042	50 %	0 %	50 %	0 %	319774887
579	NC_014917	GAC	2	6	29140	29145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774887
580	NC_014917	CCAG	2	8	29194	29201	25 %	0 %	25 %	50 %	319774887
581	NC_014917	ACCTCT	2	12	29283	29294	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	319774887
582	NC_014917	GAA	2	6	29383	29388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774887
583	NC_014917	A	6	6	29467	29472	100 %	0 %	0 %	0 %	319774887
584	NC_014917	ATC	2	6	29592	29597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774887
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586	NC_014917	AGA	2	6	29769	29774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774888
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588	NC_014917	AGA	2	6	29859	29864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774888
589	NC_014917	CTA	2	6	29889	29894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774888
590	NC_014917	GAG	2	6	29921	29926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774888
591	NC_014917	TTCCT	2	10	30009	30018	0 %	60 %	0 %	40 %	319774888
592	NC_014917	TTC	2	6	30033	30038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774889
593	NC_014917	ATT	2	6	30134	30139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774889
594	NC_014917	GCAG	2	8	30142	30149	25 %	0 %	50 %	25 %	319774889
595	NC_014917	TCT	2	6	30209	30214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774889
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597	NC_014917	TGA	2	6	30267	30272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774889
598	NC_014917	TCC	2	6	30338	30343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319774889
599	NC_014917	T	6	6	30358	30363	0 %	100 %	0 %	0 %	319774889
600	NC_014917	ATTTC	2	10	30366	30375	20 %	60 %	0 %	20 %	319774889
601	NC_014917	GGA	2	6	30393	30398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774889
602	NC_014917	T	6	6	30399	30404	0 %	100 %	0 %	0 %	319774889
603	NC_014917	T	7	7	30417	30423	0 %	100 %	0 %	0 %	319774889
604	NC_014917	TTG	2	6	30453	30458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774889
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607	NC_014917	CAG	2	6	30483	30488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774889
608	NC_014917	GCA	2	6	30510	30515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774889
609	NC_014917	TTC	2	6	30809	30814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774890
610	NC_014917	CAG	2	6	30868	30873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774890
611	NC_014917	TTAT	2	8	30884	30891	25 %	75 %	0 %	0 %	319774890
612	NC_014917	AGG	2	6	30998	31003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774890
613	NC_014917	AGG	2	6	31039	31044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774890
614	NC_014917	GTT	2	6	31045	31050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774890
615	NC_014917	CTG	2	6	31054	31059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774890
616	NC_014917	CAG	2	6	31080	31085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774890
617	NC_014917	CTG	2	6	31099	31104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774890
618	NC_014917	TTC	2	6	31109	31114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774890
619	NC_014917	CGCC	2	8	31119	31126	0 %	0 %	25 %	75 %	319774890
620	NC_014917	CGC	2	6	31225	31230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319774890
621	NC_014917	AGCTGG	2	12	31238	31249	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319774890
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623	NC_014917	GGTG	2	8	31398	31405	0 %	25 %	75 %	0 %	319774890
624	NC_014917	GAG	2	6	31489	31494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774890
625	NC_014917	GGCT	2	8	31513	31520	0 %	25 %	50 %	25 %	319774890
626	NC_014917	AGG	2	6	31606	31611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774890
627	NC_014917	AGT	2	6	31628	31633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774891
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