MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus barophilus MP chromosome

Total Repeats: 36707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014804	ATT	2	6	28982	28987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229799
502	NC_014804	CAG	2	6	29019	29024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315229799
503	NC_014804	T	6	6	29072	29077	0 %	100 %	0 %	0 %	315229799
504	NC_014804	GTG	2	6	29454	29459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315229800
505	NC_014804	AAAG	2	8	29496	29503	75 %	0 %	25 %	0 %	315229800
506	NC_014804	TCC	2	6	29509	29514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315229800
507	NC_014804	TC	3	6	29595	29600	0 %	50 %	0 %	50 %	315229800
508	NC_014804	GA	3	6	29647	29652	50 %	0 %	50 %	0 %	315229800
509	NC_014804	TGATA	2	10	29656	29665	40 %	40 %	20 %	0 %	315229800
510	NC_014804	TGGG	2	8	29676	29683	0 %	25 %	75 %	0 %	315229800
511	NC_014804	ATT	2	6	29696	29701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229800
512	NC_014804	A	6	6	29731	29736	100 %	0 %	0 %	0 %	315229800
513	NC_014804	A	7	7	29748	29754	100 %	0 %	0 %	0 %	315229800
514	NC_014804	AC	3	6	29886	29891	50 %	0 %	0 %	50 %	315229800
515	NC_014804	AAG	2	6	29926	29931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229800
516	NC_014804	TTAA	2	8	29955	29962	50 %	50 %	0 %	0 %	315229800
517	NC_014804	AAT	2	6	29973	29978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229801
518	NC_014804	GTA	2	6	30076	30081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229801
519	NC_014804	T	7	7	30113	30119	0 %	100 %	0 %	0 %	315229801
520	NC_014804	TCT	2	6	30126	30131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229801
521	NC_014804	TGG	2	6	30192	30197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315229801
522	NC_014804	GA	3	6	30363	30368	50 %	0 %	50 %	0 %	315229801
523	NC_014804	GCT	2	6	30469	30474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229801
524	NC_014804	TA	3	6	30533	30538	50 %	50 %	0 %	0 %	315229801
525	NC_014804	CATC	2	8	30578	30585	25 %	25 %	0 %	50 %	315229801
526	NC_014804	TCT	3	9	30677	30685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229801
527	NC_014804	T	6	6	30718	30723	0 %	100 %	0 %	0 %	315229801
528	NC_014804	CTT	2	6	30787	30792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229801
529	NC_014804	GCT	2	6	30802	30807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229801
530	NC_014804	GGCT	2	8	30872	30879	0 %	25 %	50 %	25 %	315229801
531	NC_014804	CCT	2	6	30903	30908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315229801
532	NC_014804	CAA	2	6	30938	30943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229801
533	NC_014804	T	6	6	30944	30949	0 %	100 %	0 %	0 %	315229801
534	NC_014804	CTGG	2	8	31075	31082	0 %	25 %	50 %	25 %	315229801
535	NC_014804	GCA	2	6	31087	31092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315229801
536	NC_014804	TTC	2	6	31093	31098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229801
537	NC_014804	TGG	2	6	31136	31141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315229801
538	NC_014804	CTC	2	6	31185	31190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315229801
539	NC_014804	T	6	6	31200	31205	0 %	100 %	0 %	0 %	315229801
540	NC_014804	AATTAA	2	12	31266	31277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229801
541	NC_014804	TCA	2	6	31351	31356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229801
542	NC_014804	TGA	2	6	31419	31424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229801
543	NC_014804	A	6	6	31424	31429	100 %	0 %	0 %	0 %	315229801
544	NC_014804	GTT	2	6	31435	31440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229801
545	NC_014804	TAA	2	6	31463	31468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229801
546	NC_014804	CCT	2	6	31584	31589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315229801
547	NC_014804	TGT	2	6	31593	31598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229801
548	NC_014804	AT	3	6	31648	31653	50 %	50 %	0 %	0 %	315229801
549	NC_014804	T	6	6	31842	31847	0 %	100 %	0 %	0 %	315229802
550	NC_014804	TAA	2	6	31876	31881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229802
551	NC_014804	AC	3	6	31955	31960	50 %	0 %	0 %	50 %	315229802
552	NC_014804	TCT	2	6	32021	32026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229802
553	NC_014804	GCATT	2	10	32047	32056	20 %	40 %	20 %	20 %	315229802
554	NC_014804	ATT	2	6	32141	32146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229802
555	NC_014804	CTG	2	6	32247	32252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229802
556	NC_014804	TGC	2	6	32270	32275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229802
557	NC_014804	TCTA	2	8	32304	32311	25 %	50 %	0 %	25 %	315229802
558	NC_014804	CTA	2	6	32387	32392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229802
559	NC_014804	AGA	2	6	32401	32406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229802
560	NC_014804	TGCT	2	8	32449	32456	0 %	50 %	25 %	25 %	315229802
561	NC_014804	T	6	6	32465	32470	0 %	100 %	0 %	0 %	315229802
562	NC_014804	TTG	2	6	32503	32508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229802
563	NC_014804	TTC	2	6	32547	32552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229802
564	NC_014804	AGG	2	6	32599	32604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315229802
565	NC_014804	ATATTT	2	12	32640	32651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229802
566	NC_014804	TCT	2	6	32696	32701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229802
567	NC_014804	TGG	2	6	32772	32777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315229802
568	NC_014804	CTTGG	2	10	32859	32868	0 %	40 %	40 %	20 %	315229802
569	NC_014804	CAG	2	6	32880	32885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315229802
570	NC_014804	AAT	2	6	32903	32908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315229802
571	NC_014804	AG	4	8	32976	32983	50 %	0 %	50 %	0 %	315229802
572	NC_014804	CTT	2	6	32985	32990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229802
573	NC_014804	AAGA	2	8	33005	33012	75 %	0 %	25 %	0 %	315229802
574	NC_014804	GAT	2	6	33014	33019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229802
575	NC_014804	ATC	2	6	33041	33046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229802
576	NC_014804	TCT	2	6	33149	33154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229803
577	NC_014804	T	7	7	33154	33160	0 %	100 %	0 %	0 %	315229803
578	NC_014804	TGGA	2	8	33227	33234	25 %	25 %	50 %	0 %	315229803
579	NC_014804	T	6	6	33292	33297	0 %	100 %	0 %	0 %	315229803
580	NC_014804	CTC	2	6	33312	33317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315229803
581	NC_014804	TC	3	6	33354	33359	0 %	50 %	0 %	50 %	315229803
582	NC_014804	CTCTT	2	10	33375	33384	0 %	60 %	0 %	40 %	315229803
583	NC_014804	CATG	2	8	33448	33455	25 %	25 %	25 %	25 %	315229803
584	NC_014804	TAT	2	6	33624	33629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229803
585	NC_014804	CAT	2	6	33710	33715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229803
586	NC_014804	TTA	2	6	33755	33760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229803
587	NC_014804	TCCATG	2	12	34116	34127	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315229804
588	NC_014804	ATT	2	6	34179	34184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229804
589	NC_014804	ATT	2	6	34332	34337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229804
590	NC_014804	AT	3	6	34338	34343	50 %	50 %	0 %	0 %	315229804
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592	NC_014804	CTG	2	6	34607	34612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229805
593	NC_014804	CCA	2	6	34674	34679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315229805
594	NC_014804	TTA	2	6	34815	34820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229805
595	NC_014804	GTC	2	6	34853	34858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229805
596	NC_014804	ATC	2	6	34880	34885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229805
597	NC_014804	TTGC	2	8	34905	34912	0 %	50 %	25 %	25 %	315229805
598	NC_014804	GCT	2	6	34934	34939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229805
599	NC_014804	TTTA	2	8	34966	34973	25 %	75 %	0 %	0 %	315229805
600	NC_014804	ACT	2	6	35030	35035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229805
601	NC_014804	ATGT	2	8	35036	35043	25 %	50 %	25 %	0 %	315229805
602	NC_014804	AG	3	6	35209	35214	50 %	0 %	50 %	0 %	315229805
603	NC_014804	GAACTG	2	12	35259	35270	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315229805
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607	NC_014804	TAG	2	6	35486	35491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315229805
608	NC_014804	AGA	2	6	35525	35530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229805
609	NC_014804	TTAG	2	8	35561	35568	25 %	50 %	25 %	0 %	315229805
610	NC_014804	A	6	6	35575	35580	100 %	0 %	0 %	0 %	315229805
611	NC_014804	CTT	2	6	35591	35596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229805
612	NC_014804	TTG	2	6	35598	35603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229805
613	NC_014804	CTG	2	6	35637	35642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315229805
614	NC_014804	ACA	2	6	35655	35660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229805
615	NC_014804	C	6	6	35674	35679	0 %	0 %	0 %	100 %	315229805
616	NC_014804	AT	3	6	35726	35731	50 %	50 %	0 %	0 %	315229805
617	NC_014804	CTA	2	6	35733	35738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315229805
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619	NC_014804	ATT	2	6	35747	35752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229805
620	NC_014804	A	6	6	35837	35842	100 %	0 %	0 %	0 %	315229806
621	NC_014804	TTCA	2	8	35868	35875	25 %	50 %	0 %	25 %	315229806
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623	NC_014804	TCT	2	6	36070	36075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229806
624	NC_014804	T	6	6	36092	36097	0 %	100 %	0 %	0 %	315229806
625	NC_014804	G	6	6	36124	36129	0 %	0 %	100 %	0 %	315229806
626	NC_014804	CAA	2	6	36164	36169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315229806
627	NC_014804	TAT	2	6	36173	36178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315229806
628	NC_014804	T	6	6	36343	36348	0 %	100 %	0 %	0 %	315229806
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751	NC_014804	TA	3	6	43096	43101	50 %	50 %	0 %	0 %	315229814
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754	NC_014804	AAG	2	6	43244	43249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315229814
755	NC_014804	TCCT	2	8	43262	43269	0 %	50 %	0 %	50 %	315229814
756	NC_014804	TTG	2	6	43289	43294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315229814
757	NC_014804	CTT	2	6	43323	43328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315229814
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