MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermobispora bispora DSM 43833 chromosome

Total Repeats: 102005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014165	C	6	6	228198	228203	0 %	0 %	0 %	100 %	296268181
5002	NC_014165	ATG	2	6	228232	228237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296268181
5003	NC_014165	CGCGGC	2	12	228532	228543	0 %	0 %	50 %	50 %	296268182
5004	NC_014165	TCA	2	6	228549	228554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296268182
5005	NC_014165	CGG	2	6	228561	228566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268182
5006	NC_014165	CGGG	2	8	228615	228622	0 %	0 %	75 %	25 %	296268182
5007	NC_014165	CGA	2	6	228628	228633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268182
5008	NC_014165	AG	3	6	228662	228667	50 %	0 %	50 %	0 %	296268182
5009	NC_014165	AGG	2	6	228672	228677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268182
5010	NC_014165	GCT	2	6	228706	228711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268182
5011	NC_014165	CGT	2	6	228712	228717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268182
5012	NC_014165	GCC	2	6	228727	228732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268182
5013	NC_014165	CGGC	2	8	228739	228746	0 %	0 %	50 %	50 %	296268182
5014	NC_014165	GGT	2	6	228802	228807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296268182
5015	NC_014165	AGG	3	9	228813	228821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268182
5016	NC_014165	CCG	2	6	228846	228851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268182
5017	NC_014165	CTG	2	6	228887	228892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268182
5018	NC_014165	CCG	2	6	228903	228908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268182
5019	NC_014165	CGG	2	6	228928	228933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268182
5020	NC_014165	CGG	2	6	228954	228959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268182
5021	NC_014165	GC	3	6	228960	228965	0 %	0 %	50 %	50 %	296268182
5022	NC_014165	GCC	2	6	229077	229082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268183
5023	NC_014165	CAC	2	6	229139	229144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296268183
5024	NC_014165	GCA	2	6	229162	229167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268183
5025	NC_014165	CGT	2	6	229192	229197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268183
5026	NC_014165	GGT	2	6	229216	229221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296268183
5027	NC_014165	AAT	2	6	229312	229317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296268183
5028	NC_014165	CGG	2	6	229445	229450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268183
5029	NC_014165	CGGA	2	8	229453	229460	25 %	0 %	50 %	25 %	296268183
5030	NC_014165	CTC	2	6	229496	229501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268183
5031	NC_014165	GAC	2	6	229544	229549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268183
5032	NC_014165	CCG	2	6	229555	229560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268183
5033	NC_014165	TCC	3	9	229582	229590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268183
5034	NC_014165	CGG	2	6	229601	229606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268183
5035	NC_014165	GCCG	2	8	229616	229623	0 %	0 %	50 %	50 %	296268183
5036	NC_014165	CGG	2	6	229651	229656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268183
5037	NC_014165	CGG	2	6	229672	229677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268183
5038	NC_014165	GCG	2	6	229716	229721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268183
5039	NC_014165	CGG	2	6	229741	229746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268183
5040	NC_014165	CGG	2	6	229750	229755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268183
5041	NC_014165	CCGG	2	8	229801	229808	0 %	0 %	50 %	50 %	296268183
5042	NC_014165	CGG	2	6	229825	229830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268183
5043	NC_014165	GGT	2	6	229847	229852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296268183
5044	NC_014165	GGT	2	6	229912	229917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296268183
5045	NC_014165	CGGC	2	8	229996	230003	0 %	0 %	50 %	50 %	296268183
5046	NC_014165	CGG	2	6	230011	230016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268183
5047	NC_014165	CGC	2	6	230022	230027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268183
5048	NC_014165	GCCG	2	8	230037	230044	0 %	0 %	50 %	50 %	296268183
5049	NC_014165	CCT	2	6	230056	230061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268183
5050	NC_014165	GC	3	6	230079	230084	0 %	0 %	50 %	50 %	296268183
5051	NC_014165	TCCGC	2	10	230097	230106	0 %	20 %	20 %	60 %	296268183
5052	NC_014165	CGA	2	6	230125	230130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268183
5053	NC_014165	CGG	2	6	230138	230143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268183
5054	NC_014165	GCC	2	6	230161	230166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268183
5055	NC_014165	GGT	2	6	230182	230187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296268183
5056	NC_014165	GTC	2	6	230243	230248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268183
5057	NC_014165	GCG	3	9	230952	230960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268184
5058	NC_014165	ACC	2	6	230965	230970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296268184
5059	NC_014165	CGG	2	6	231070	231075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268184
5060	NC_014165	CGG	2	6	231084	231089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268184
5061	NC_014165	TCG	2	6	231098	231103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268184
5062	NC_014165	C	6	6	231171	231176	0 %	0 %	0 %	100 %	296268184
5063	NC_014165	CGG	2	6	231220	231225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268184
5064	NC_014165	CCT	2	6	231255	231260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268184
5065	NC_014165	GCT	2	6	231288	231293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268184
5066	NC_014165	GC	3	6	231294	231299	0 %	0 %	50 %	50 %	296268184
5067	NC_014165	CCA	2	6	231323	231328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296268184
5068	NC_014165	CGAG	2	8	231350	231357	25 %	0 %	50 %	25 %	296268184
5069	NC_014165	GGGCC	2	10	231392	231401	0 %	0 %	60 %	40 %	296268184
5070	NC_014165	CGC	2	6	231453	231458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268184
5071	NC_014165	GCC	3	9	231515	231523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268184
5072	NC_014165	CGC	2	6	231552	231557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268184
5073	NC_014165	GC	3	6	231567	231572	0 %	0 %	50 %	50 %	296268184
5074	NC_014165	AGC	2	6	231584	231589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268184
5075	NC_014165	TGC	2	6	231590	231595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268184
5076	NC_014165	GAC	2	6	231604	231609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268184
5077	NC_014165	GCT	2	6	231618	231623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268184
5078	NC_014165	CAC	2	6	231624	231629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296268184
5079	NC_014165	CG	3	6	231635	231640	0 %	0 %	50 %	50 %	296268184
5080	NC_014165	CGC	2	6	231644	231649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268184
5081	NC_014165	GC	4	8	231666	231673	0 %	0 %	50 %	50 %	296268184
5082	NC_014165	GCT	2	6	231714	231719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268184
5083	NC_014165	GC	3	6	231726	231731	0 %	0 %	50 %	50 %	296268184
5084	NC_014165	GAG	2	6	231769	231774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268184
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5086	NC_014165	GAG	2	6	231856	231861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268184
5087	NC_014165	GCT	2	6	231885	231890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268184
5088	NC_014165	GAG	2	6	231937	231942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268184
5089	NC_014165	GGC	2	6	231956	231961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268184
5090	NC_014165	CG	3	6	231984	231989	0 %	0 %	50 %	50 %	296268184
5091	NC_014165	GGCC	2	8	232013	232020	0 %	0 %	50 %	50 %	296268184
5092	NC_014165	TGGCCA	2	12	232118	232129	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296268184
5093	NC_014165	CCT	2	6	232134	232139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268184
5094	NC_014165	CAC	2	6	232141	232146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296268184
5095	NC_014165	ACC	2	6	232157	232162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296268184
5096	NC_014165	CG	3	6	232163	232168	0 %	0 %	50 %	50 %	296268184
5097	NC_014165	GGCT	2	8	232177	232184	0 %	25 %	50 %	25 %	296268184
5098	NC_014165	CCGGGC	2	12	232224	232235	0 %	0 %	50 %	50 %	296268184
5099	NC_014165	GCCG	2	8	232281	232288	0 %	0 %	50 %	50 %	296268184
5100	NC_014165	CGC	2	6	232317	232322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268184
5101	NC_014165	GGC	2	6	232395	232400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268184
5102	NC_014165	GCC	2	6	232405	232410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268184
5103	NC_014165	GGC	2	6	232425	232430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268184
5104	NC_014165	CGG	2	6	232441	232446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268184
5105	NC_014165	GCGCTC	2	12	232468	232479	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296268184
5106	NC_014165	GAG	2	6	232519	232524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268184
5107	NC_014165	GAG	2	6	232540	232545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268184
5108	NC_014165	GGC	2	6	232622	232627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268184
5109	NC_014165	G	6	6	232628	232633	0 %	0 %	100 %	0 %	296268184
5110	NC_014165	GC	3	6	232641	232646	0 %	0 %	50 %	50 %	296268184
5111	NC_014165	GAC	2	6	232690	232695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268184
5112	NC_014165	GAG	2	6	232747	232752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268184
5113	NC_014165	CGCC	2	8	232767	232774	0 %	0 %	25 %	75 %	296268184
5114	NC_014165	CCG	2	6	232795	232800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268184
5115	NC_014165	GAC	2	6	232807	232812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268184
5116	NC_014165	CCG	2	6	232839	232844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268184
5117	NC_014165	CAG	2	6	232848	232853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268184
5118	NC_014165	CGAGGC	2	12	232860	232871	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296268184
5119	NC_014165	CG	3	6	232913	232918	0 %	0 %	50 %	50 %	296268184
5120	NC_014165	GGC	2	6	232941	232946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268184
5121	NC_014165	GAG	2	6	232975	232980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268184
5122	NC_014165	GCC	2	6	233010	233015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268184
5123	NC_014165	CG	3	6	233054	233059	0 %	0 %	50 %	50 %	296268184
5124	NC_014165	CAA	2	6	233067	233072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296268184
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5126	NC_014165	GCC	2	6	233275	233280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268185
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5155	NC_014165	CCGGTC	2	12	234777	234788	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296268186
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5239	NC_014165	GC	3	6	237819	237824	0 %	0 %	50 %	50 %	296268188
5240	NC_014165	TCCAGG	2	12	237836	237847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296268188
5241	NC_014165	CGA	2	6	237882	237887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268188
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5243	NC_014165	AGG	2	6	237980	237985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268188
5244	NC_014165	TCT	2	6	237990	237995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296268188
5245	NC_014165	TCG	2	6	238010	238015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268188
5246	NC_014165	CTC	2	6	238018	238023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268188
5247	NC_014165	CGG	2	6	238098	238103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268188
5248	NC_014165	CGG	2	6	238122	238127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268188
5249	NC_014165	GAG	2	6	238132	238137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268188
5250	NC_014165	GGC	2	6	238617	238622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268189
5251	NC_014165	CGG	2	6	238693	238698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268189
5252	NC_014165	GCG	2	6	239034	239039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268190
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5254	NC_014165	GCT	2	6	239059	239064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268190
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5256	NC_014165	CGG	3	9	239107	239115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268190
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5263	NC_014165	GCG	2	6	239295	239300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268190
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5265	NC_014165	CCG	2	6	239367	239372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268190
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5290	NC_014165	TGA	2	6	240433	240438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296268191
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5303	NC_014165	CCCG	2	8	240896	240903	0 %	0 %	25 %	75 %	296268191
5304	NC_014165	TTCCG	2	10	240918	240927	0 %	40 %	20 %	40 %	296268191
5305	NC_014165	CTCGAC	2	12	240977	240988	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296268191
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5361	NC_014165	TGGA	2	8	243023	243030	25 %	25 %	50 %	0 %	296268195
5362	NC_014165	CGG	2	6	243057	243062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268195
5363	NC_014165	GCC	2	6	243079	243084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268195
5364	NC_014165	CAT	2	6	243163	243168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296268195
5365	NC_014165	GGT	2	6	243196	243201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296268195
5366	NC_014165	CCCGG	2	10	243212	243221	0 %	0 %	40 %	60 %	296268195
5367	NC_014165	CGG	2	6	243250	243255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268195
5368	NC_014165	CGG	2	6	243267	243272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268195
5369	NC_014165	GCG	2	6	243284	243289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268195
5370	NC_014165	GGGC	2	8	243414	243421	0 %	0 %	75 %	25 %	296268196
5371	NC_014165	CTG	2	6	243440	243445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268196
5372	NC_014165	CGG	3	9	243496	243504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268196
5373	NC_014165	GTC	2	6	243518	243523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268196
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5376	NC_014165	GTC	2	6	243560	243565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268196
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5382	NC_014165	TGC	2	6	243966	243971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268196
5383	NC_014165	CCGAT	2	10	243972	243981	20 %	20 %	20 %	40 %	296268196
5384	NC_014165	CGC	2	6	243982	243987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268196
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5389	NC_014165	GC	3	6	244135	244140	0 %	0 %	50 %	50 %	296268196
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5392	NC_014165	CGA	2	6	244378	244383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268197
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5395	NC_014165	GAG	2	6	244466	244471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296268197
5396	NC_014165	CCGG	2	8	244484	244491	0 %	0 %	50 %	50 %	296268197
5397	NC_014165	CGT	2	6	244522	244527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268197
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5399	NC_014165	GC	3	6	244554	244559	0 %	0 %	50 %	50 %	296268197
5400	NC_014165	GCC	2	6	244582	244587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268197
5401	NC_014165	TCG	2	6	244608	244613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268197
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5404	NC_014165	GCG	3	9	244869	244877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268197
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5468	NC_014165	AAG	2	6	247813	247818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296268200
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5471	NC_014165	TCGC	2	8	248121	248128	0 %	25 %	25 %	50 %	296268201
5472	NC_014165	GCG	2	6	248162	248167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268201
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5474	NC_014165	GGCCG	2	10	248297	248306	0 %	0 %	60 %	40 %	296268201
5475	NC_014165	GC	3	6	248315	248320	0 %	0 %	50 %	50 %	296268201
5476	NC_014165	TCG	2	6	248463	248468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296268201
5477	NC_014165	GTCACG	2	12	248501	248512	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296268201
5478	NC_014165	CTC	2	6	248896	248901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296268202
5479	NC_014165	GCC	2	6	248931	248936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268202
5480	NC_014165	CGGCG	2	10	248944	248953	0 %	0 %	60 %	40 %	296268202
5481	NC_014165	GCA	2	6	248985	248990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268202
5482	NC_014165	GC	3	6	249003	249008	0 %	0 %	50 %	50 %	296268202
5483	NC_014165	GC	3	6	249041	249046	0 %	0 %	50 %	50 %	296268202
5484	NC_014165	GTA	2	6	249103	249108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296268202
5485	NC_014165	GC	3	6	249114	249119	0 %	0 %	50 %	50 %	296268202
5486	NC_014165	GCC	2	6	249125	249130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268202
5487	NC_014165	CCG	2	6	249171	249176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268202
5488	NC_014165	GCCCG	2	10	249184	249193	0 %	0 %	40 %	60 %	296268202
5489	NC_014165	CAG	2	6	249205	249210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296268202
5490	NC_014165	CCG	2	6	249227	249232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296268202
5491	NC_014165	CGG	2	6	249234	249239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296268202
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