MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 plasmid pTpau01

Total Repeats: 2240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014159	GGC	2	6	48392	48397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141955
1002	NC_014159	CGA	2	6	48487	48492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141955
1003	NC_014159	ACC	2	6	48564	48569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141955
1004	NC_014159	GGC	2	6	48579	48584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141955
1005	NC_014159	CCA	2	6	48665	48670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141955
1006	NC_014159	CAG	2	6	48715	48720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141955
1007	NC_014159	GCC	2	6	48782	48787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141955
1008	NC_014159	TGA	2	6	48796	48801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141955
1009	NC_014159	CTG	2	6	48869	48874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141955
1010	NC_014159	CAA	2	6	48910	48915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296141955
1011	NC_014159	CGC	2	6	48922	48927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141955
1012	NC_014159	AGT	2	6	48960	48965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141955
1013	NC_014159	CG	3	6	48969	48974	0 %	0 %	50 %	50 %	296141955
1014	NC_014159	GA	3	6	49023	49028	50 %	0 %	50 %	0 %	296141955
1015	NC_014159	GAG	2	6	49046	49051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296141955
1016	NC_014159	GC	3	6	49077	49082	0 %	0 %	50 %	50 %	296141955
1017	NC_014159	GC	3	6	49087	49092	0 %	0 %	50 %	50 %	296141955
1018	NC_014159	GGT	2	6	49137	49142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141955
1019	NC_014159	CTG	2	6	49148	49153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141955
1020	NC_014159	CGT	2	6	49660	49665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1021	NC_014159	CGG	2	6	49708	49713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141956
1022	NC_014159	GTG	2	6	49714	49719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141956
1023	NC_014159	ACC	2	6	49727	49732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141956
1024	NC_014159	CCA	2	6	49740	49745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141956
1025	NC_014159	CGC	2	6	49750	49755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141956
1026	NC_014159	TCC	2	6	49756	49761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141956
1027	NC_014159	GTCC	2	8	49770	49777	0 %	25 %	25 %	50 %	296141956
1028	NC_014159	CGGG	2	8	49815	49822	0 %	0 %	75 %	25 %	296141956
1029	NC_014159	TCG	2	6	49848	49853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1030	NC_014159	TGA	2	6	49912	49917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141956
1031	NC_014159	GCCT	2	8	49919	49926	0 %	25 %	25 %	50 %	296141956
1032	NC_014159	TCG	2	6	49935	49940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1033	NC_014159	GTT	2	6	49944	49949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141956
1034	NC_014159	GCT	2	6	49975	49980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1035	NC_014159	CGC	2	6	49988	49993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141956
1036	NC_014159	TCA	2	6	50029	50034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141956
1037	NC_014159	CTG	2	6	50042	50047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1038	NC_014159	CTG	2	6	50087	50092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1039	NC_014159	CCA	2	6	50104	50109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141956
1040	NC_014159	TGA	2	6	50140	50145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141956
1041	NC_014159	GCC	2	6	50172	50177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141956
1042	NC_014159	GT	3	6	50181	50186	0 %	50 %	50 %	0 %	296141956
1043	NC_014159	CACGC	2	10	50264	50273	20 %	0 %	20 %	60 %	296141956
1044	NC_014159	TGC	2	6	50274	50279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1045	NC_014159	CGC	2	6	50300	50305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141956
1046	NC_014159	TCA	2	6	50356	50361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141956
1047	NC_014159	TTG	2	6	50367	50372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141956
1048	NC_014159	TCG	2	6	50386	50391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1049	NC_014159	GGCC	2	8	50395	50402	0 %	0 %	50 %	50 %	296141956
1050	NC_014159	CTG	2	6	50489	50494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1051	NC_014159	TCG	2	6	50499	50504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1052	NC_014159	ACC	2	6	50511	50516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141956
1053	NC_014159	CCG	2	6	50520	50525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141956
1054	NC_014159	GCT	2	6	50530	50535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1055	NC_014159	CCCCTC	2	12	50594	50605	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	296141956
1056	NC_014159	CCG	2	6	50638	50643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141956
1057	NC_014159	CCGC	2	8	50737	50744	0 %	0 %	25 %	75 %	296141956
1058	NC_014159	CG	3	6	50754	50759	0 %	0 %	50 %	50 %	296141956
1059	NC_014159	CTG	2	6	50816	50821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141956
1060	NC_014159	CG	3	6	50979	50984	0 %	0 %	50 %	50 %	296141956
1061	NC_014159	CCGCC	2	10	51309	51318	0 %	0 %	20 %	80 %	296141957
1062	NC_014159	CGC	2	6	51362	51367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141957
1063	NC_014159	CG	3	6	51372	51377	0 %	0 %	50 %	50 %	296141957
1064	NC_014159	ATGG	2	8	51429	51436	25 %	25 %	50 %	0 %	296141957
1065	NC_014159	GCC	2	6	51454	51459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141957
1066	NC_014159	TCA	2	6	51478	51483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141957
1067	NC_014159	GCG	2	6	52042	52047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141958
1068	NC_014159	CGCA	2	8	52090	52097	25 %	0 %	25 %	50 %	296141958
1069	NC_014159	CTC	2	6	52110	52115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141958
1070	NC_014159	GTCGAG	2	12	52158	52169	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296141958
1071	NC_014159	CCT	2	6	52193	52198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141958
1072	NC_014159	GGCTC	2	10	52215	52224	0 %	20 %	40 %	40 %	296141958
1073	NC_014159	CCT	2	6	52262	52267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141958
1074	NC_014159	ACG	2	6	52366	52371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141958
1075	NC_014159	CCG	2	6	52389	52394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141958
1076	NC_014159	CTG	2	6	52407	52412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141958
1077	NC_014159	CTA	2	6	52424	52429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141958
1078	NC_014159	GAT	2	6	52439	52444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141958
1079	NC_014159	GA	3	6	52567	52572	50 %	0 %	50 %	0 %	296141958
1080	NC_014159	GGT	2	6	52635	52640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141958
1081	NC_014159	GC	3	6	52667	52672	0 %	0 %	50 %	50 %	296141958
1082	NC_014159	AAG	2	6	52827	52832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296141959
1083	NC_014159	AGC	2	6	52849	52854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141959
1084	NC_014159	CGG	2	6	52858	52863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141959
1085	NC_014159	CGC	2	6	52871	52876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141959
1086	NC_014159	GCCCG	2	10	52877	52886	0 %	0 %	40 %	60 %	296141959
1087	NC_014159	GCT	2	6	52896	52901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141959
1088	NC_014159	GCC	2	6	52922	52927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141959
1089	NC_014159	GAG	2	6	52977	52982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296141959
1090	NC_014159	GCT	2	6	53036	53041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141959
1091	NC_014159	TCG	2	6	53110	53115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141959
1092	NC_014159	CGA	2	6	53126	53131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141959
1093	NC_014159	GAC	2	6	53710	53715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141960
1094	NC_014159	TCACG	2	10	53717	53726	20 %	20 %	20 %	40 %	296141960
1095	NC_014159	GCA	2	6	53744	53749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141960
1096	NC_014159	GCC	2	6	53772	53777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141960
1097	NC_014159	TCG	2	6	53783	53788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141960
1098	NC_014159	CG	3	6	53787	53792	0 %	0 %	50 %	50 %	296141960
1099	NC_014159	GTC	2	6	53803	53808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141960
1100	NC_014159	CCAG	2	8	53831	53838	25 %	0 %	25 %	50 %	296141960
1101	NC_014159	CGC	2	6	53847	53852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141960
1102	NC_014159	CGC	2	6	53922	53927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141960
1103	NC_014159	GC	3	6	53970	53975	0 %	0 %	50 %	50 %	296141960
1104	NC_014159	CCG	2	6	54027	54032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141960
1105	NC_014159	GCT	2	6	54144	54149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141960
1106	NC_014159	CGA	2	6	54153	54158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141960
1107	NC_014159	CAC	2	6	54174	54179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141960
1108	NC_014159	GGCTG	2	10	54199	54208	0 %	20 %	60 %	20 %	296141960
1109	NC_014159	CGT	2	6	54213	54218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141960
1110	NC_014159	GCG	2	6	54222	54227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141960
1111	NC_014159	TCG	2	6	54245	54250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141960
1112	NC_014159	CGA	2	6	54297	54302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141960
1113	NC_014159	CG	3	6	54316	54321	0 %	0 %	50 %	50 %	296141960
1114	NC_014159	GACC	2	8	54354	54361	25 %	0 %	25 %	50 %	296141960
1115	NC_014159	CGCGC	2	10	54387	54396	0 %	0 %	40 %	60 %	296141960
1116	NC_014159	GTC	2	6	54448	54453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141960
1117	NC_014159	GCC	2	6	54454	54459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141960
1118	NC_014159	GCC	2	6	54473	54478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141960
1119	NC_014159	GCG	2	6	54479	54484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141960
1120	NC_014159	TCG	2	6	54554	54559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141960
1121	NC_014159	CGC	2	6	54570	54575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141960
1122	NC_014159	CGG	2	6	54577	54582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141960
1123	NC_014159	TTC	2	6	54586	54591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141960
1124	NC_014159	CCG	2	6	54600	54605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141960
1125	NC_014159	CGT	2	6	54638	54643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141960
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1248	NC_014159	ACCG	2	8	59631	59638	25 %	0 %	25 %	50 %	296141967
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1250	NC_014159	CAG	2	6	59772	59777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141967
1251	NC_014159	AC	3	6	59778	59783	50 %	0 %	0 %	50 %	296141967
1252	NC_014159	CA	3	6	59827	59832	50 %	0 %	0 %	50 %	296141967
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1500	NC_014159	CGG	3	9	73935	73943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141977

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