MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 plasmid pTpau01

Total Repeats: 2240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014159	CAC	2	6	24784	24789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141935
502	NC_014159	CTG	2	6	24807	24812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141935
503	NC_014159	CTG	2	6	24866	24871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141935
504	NC_014159	AGG	2	6	24876	24881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296141935
505	NC_014159	GGC	2	6	24922	24927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141935
506	NC_014159	GGC	3	9	24978	24986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141935
507	NC_014159	CAC	2	6	25060	25065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141935
508	NC_014159	CGA	2	6	25086	25091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141935
509	NC_014159	CG	3	6	25140	25145	0 %	0 %	50 %	50 %	296141935
510	NC_014159	CGA	2	6	25255	25260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141935
511	NC_014159	GAC	2	6	25289	25294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141935
512	NC_014159	CCG	3	9	25320	25328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141935
513	NC_014159	CGG	2	6	25479	25484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141935
514	NC_014159	CCGC	2	8	25491	25498	0 %	0 %	25 %	75 %	296141935
515	NC_014159	GATCT	2	10	25511	25520	20 %	40 %	20 %	20 %	296141935
516	NC_014159	ATCC	2	8	25537	25544	25 %	25 %	0 %	50 %	296141935
517	NC_014159	CCG	2	6	25599	25604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141935
518	NC_014159	AGCCC	2	10	25625	25634	20 %	0 %	20 %	60 %	296141935
519	NC_014159	TGC	2	6	25642	25647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141935
520	NC_014159	CCA	2	6	25659	25664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141935
521	NC_014159	TGA	2	6	25688	25693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141935
522	NC_014159	CCG	2	6	25782	25787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141936
523	NC_014159	CAT	2	6	25800	25805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141936
524	NC_014159	CCG	2	6	25835	25840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141936
525	NC_014159	TGCT	2	8	25856	25863	0 %	50 %	25 %	25 %	296141936
526	NC_014159	GCC	2	6	25870	25875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141936
527	NC_014159	GGGA	2	8	25876	25883	25 %	0 %	75 %	0 %	296141936
528	NC_014159	CGC	2	6	25903	25908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141936
529	NC_014159	ACGAA	2	10	25952	25961	60 %	0 %	20 %	20 %	296141936
530	NC_014159	TCC	2	6	25963	25968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141936
531	NC_014159	TGCGC	2	10	25989	25998	0 %	20 %	40 %	40 %	296141936
532	NC_014159	TCTGCG	2	12	26030	26041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141936
533	NC_014159	CCGGCA	2	12	26048	26059	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296141936
534	NC_014159	CCG	2	6	26151	26156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141936
535	NC_014159	CGA	2	6	26166	26171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141936
536	NC_014159	ATC	2	6	26197	26202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141936
537	NC_014159	ATC	2	6	26215	26220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141936
538	NC_014159	CGA	2	6	26223	26228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141936
539	NC_014159	CTG	2	6	26236	26241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141936
540	NC_014159	CGC	2	6	26256	26261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141936
541	NC_014159	TCG	2	6	26279	26284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141936
542	NC_014159	GCC	2	6	26287	26292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141936
543	NC_014159	CGA	2	6	26343	26348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141936
544	NC_014159	CAC	2	6	26395	26400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141936
545	NC_014159	CGT	3	9	26406	26414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141936
546	NC_014159	CCA	2	6	26447	26452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141936
547	NC_014159	CAC	2	6	26626	26631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141937
548	NC_014159	GCCT	2	8	26656	26663	0 %	25 %	25 %	50 %	296141937
549	NC_014159	CAG	2	6	26666	26671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141937
550	NC_014159	TGA	2	6	26760	26765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141937
551	NC_014159	CGT	2	6	26788	26793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141937
552	NC_014159	CCA	2	6	26808	26813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141937
553	NC_014159	CGC	2	6	26860	26865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141937
554	NC_014159	AGG	2	6	26905	26910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296141938
555	NC_014159	ACC	2	6	26913	26918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141938
556	NC_014159	GC	3	6	26944	26949	0 %	0 %	50 %	50 %	296141938
557	NC_014159	GCG	2	6	26997	27002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141938
558	NC_014159	GTG	2	6	27015	27020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141938
559	NC_014159	TGA	2	6	27047	27052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141938
560	NC_014159	TGT	3	9	27076	27084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141938
561	NC_014159	TCA	2	6	27091	27096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141938
562	NC_014159	CACC	2	8	27100	27107	25 %	0 %	0 %	75 %	296141938
563	NC_014159	GC	3	6	27137	27142	0 %	0 %	50 %	50 %	296141938
564	NC_014159	CGC	2	6	27191	27196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141938
565	NC_014159	CCG	2	6	27197	27202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141938
566	NC_014159	TCG	2	6	27304	27309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141938
567	NC_014159	TCG	2	6	27313	27318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141938
568	NC_014159	TCG	2	6	27343	27348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141938
569	NC_014159	CGA	2	6	27440	27445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141938
570	NC_014159	GCA	2	6	27497	27502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141938
571	NC_014159	GGT	2	6	27759	27764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141939
572	NC_014159	GTT	2	6	27819	27824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296141939
573	NC_014159	GCG	2	6	27849	27854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141939
574	NC_014159	GGC	3	9	27861	27869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141939
575	NC_014159	TGA	2	6	27918	27923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296141939
576	NC_014159	GGCGG	2	10	27924	27933	0 %	0 %	80 %	20 %	296141939
577	NC_014159	TGG	2	6	27938	27943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141939
578	NC_014159	CAT	2	6	27955	27960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141939
579	NC_014159	GGT	2	6	27972	27977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296141939
580	NC_014159	GCG	3	9	28050	28058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141939
581	NC_014159	TCG	2	6	28066	28071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141939
582	NC_014159	CTGC	2	8	28075	28082	0 %	25 %	25 %	50 %	296141939
583	NC_014159	GCT	2	6	28122	28127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141939
584	NC_014159	AGC	3	9	28245	28253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141939
585	NC_014159	TG	3	6	28293	28298	0 %	50 %	50 %	0 %	296141939
586	NC_014159	GT	3	6	28342	28347	0 %	50 %	50 %	0 %	296141939
587	NC_014159	CTG	2	6	28348	28353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141939
588	NC_014159	GTGC	2	8	28366	28373	0 %	25 %	50 %	25 %	296141939
589	NC_014159	TCT	2	6	28440	28445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296141939
590	NC_014159	CGGT	2	8	28487	28494	0 %	25 %	50 %	25 %	296141939
591	NC_014159	GC	3	6	28499	28504	0 %	0 %	50 %	50 %	296141939
592	NC_014159	GGC	2	6	28515	28520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141939
593	NC_014159	AGC	2	6	28550	28555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141939
594	NC_014159	GCAGC	2	10	28608	28617	20 %	0 %	40 %	40 %	296141939
595	NC_014159	CG	3	6	28677	28682	0 %	0 %	50 %	50 %	296141939
596	NC_014159	TCG	2	6	28688	28693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141939
597	NC_014159	CGC	2	6	28701	28706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141939
598	NC_014159	CGA	2	6	28737	28742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141939
599	NC_014159	CTG	2	6	28753	28758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141939
600	NC_014159	CCG	2	6	28775	28780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141939
601	NC_014159	GAC	2	6	28800	28805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141939
602	NC_014159	GCG	2	6	28876	28881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141939
603	NC_014159	GCC	2	6	28912	28917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141939
604	NC_014159	GC	3	6	28929	28934	0 %	0 %	50 %	50 %	296141939
605	NC_014159	CGCAC	2	10	28941	28950	20 %	0 %	20 %	60 %	296141939
606	NC_014159	CGC	2	6	29007	29012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141939
607	NC_014159	CAC	2	6	29013	29018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141939
608	NC_014159	CGA	2	6	29037	29042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141939
609	NC_014159	GCC	2	6	29047	29052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141939
610	NC_014159	CGA	2	6	29133	29138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141940
611	NC_014159	GCCG	2	8	29158	29165	0 %	0 %	50 %	50 %	296141940
612	NC_014159	CG	3	6	29177	29182	0 %	0 %	50 %	50 %	296141940
613	NC_014159	CCA	2	6	29249	29254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141940
614	NC_014159	TGC	2	6	29285	29290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141940
615	NC_014159	GCT	2	6	29304	29309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141940
616	NC_014159	CCG	2	6	29333	29338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141940
617	NC_014159	GCT	2	6	29460	29465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141940
618	NC_014159	C	6	6	29523	29528	0 %	0 %	0 %	100 %	296141940
619	NC_014159	TCGGCG	2	12	29567	29578	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296141940
620	NC_014159	CTC	2	6	29584	29589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141940
621	NC_014159	CAC	2	6	29601	29606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141940
622	NC_014159	ACC	2	6	29607	29612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296141940
623	NC_014159	GGCA	2	8	29613	29620	25 %	0 %	50 %	25 %	296141940
624	NC_014159	CAA	2	6	29622	29627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296141940
625	NC_014159	GCA	2	6	29635	29640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141940
626	NC_014159	CGC	2	6	29679	29684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141940
627	NC_014159	CCT	2	6	29691	29696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296141940
628	NC_014159	ATC	2	6	29740	29745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296141940
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636	NC_014159	CGG	2	6	31154	31159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141941
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751	NC_014159	CGC	2	6	36751	36756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296141946
752	NC_014159	CAA	6	18	36769	36786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296141946
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754	NC_014159	GAG	2	6	36908	36913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296141946
755	NC_014159	CCCAC	2	10	36914	36923	20 %	0 %	0 %	80 %	296141946
756	NC_014159	CTG	2	6	36924	36929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141946
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882	NC_014159	CGA	2	6	43294	43299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296141950
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